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OPN基因多態(tài)性與廣西壯族人群鼻咽癌易感性的關(guān)系

發(fā)布時(shí)間:2018-07-29 16:24
【摘要】:目的研究骨橋蛋白(osteopontin,OPN)基因單核苷酸多態(tài)性及其單倍型與廣西壯族人群鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)易感性的關(guān)系。方法采用病例-對(duì)照研究方法,收集2010-03-01-2013-03-20入住右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院的廣西壯族鼻咽癌患者150例,同時(shí)隨機(jī)選取2012-01-01-2012-08-01右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院常規(guī)體檢的廣西壯族人150名作為對(duì)照。采用單堿基延伸PCR技術(shù)和DNA測(cè)序法,檢測(cè)150例廣西壯族鼻咽癌患者和150名壯族對(duì)照者的OPN基因rs11728697和rs4754位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性,并分析OPN基因的單倍型頻率。結(jié)果在OPN基因rs11728697位點(diǎn)上,攜帶CT基因型的個(gè)體相比攜帶常見的CC基因型個(gè)體罹患鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn)更高,OR=1.78,95%CI為1.05~2.98,χ2=5.863,P=0.033;但TT基因型并不增個(gè)體罹患鼻咽癌的風(fēng)險(xiǎn),OR=0.92,95%CI為0.55~1.77,χ2=0.012,P=0.921。同時(shí),鼻咽癌組在該位點(diǎn)的等位基因型頻率與對(duì)照組的頻率相比差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,OR=1.14,95%CI為0.69~1.45,χ2=0.545,P=0.466。在OPN基因rs4754位點(diǎn)上,對(duì)照組和鼻咽癌組的基因型及等位基因型頻率分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P0.05。對(duì)照組和鼻咽癌組的單倍型頻率分布差異亦無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P0.05。結(jié)論在廣西壯族人群中,OPN基因rs11728697位點(diǎn)的CT基因型可能增加個(gè)體鼻咽癌的易感性,而rs4754位點(diǎn)的多態(tài)性與鼻咽癌的易感性無關(guān)。
[Abstract]:Objective to study the relationship between single nucleotide polymorphism and haplotype of osteopontin gene and susceptibility to nasopharyngeal carcinoma (NPC) in Guangxi Zhuang nationality. Methods A case-control study was conducted to collect 150 patients with nasopharyngeal carcinoma of Zhuang nationality in Guangxi, who were admitted to affiliated Hospital of Youjiang Medical College for nationalities from 2010-03-01-2013-03-20. At the same time, 150 Guangxi Zhuang people were randomly selected as the control group in the affiliated hospital of Youjiang Medical College for nationalities. The single nucleotide polymorphisms of OPN gene rs11728697 and rs4754 locus in 150 patients with nasopharyngeal carcinoma of Zhuang nationality and 150 controls of Zhuang nationality in Guangxi were detected by single base extension PCR technique and DNA sequencing. The haplotype frequency of OPN gene was analyzed. Results at the rs11728697 locus of OPN gene, individuals with CT genotype had a higher risk of developing nasopharyngeal carcinoma than those with common CC genotype, the CI was 1.75 鹵2.98, 蠂 2 = 5.863, P 0.033, but TT genotype did not increase the risk of NPC. The CI of individuals with CT genotype was 0.551.77, and 蠂 2 0.012 with P + 0.921. At the same time, there was no significant difference in allelic frequency between nasopharyngeal carcinoma group and control group. At the rs4754 locus of OPN gene, there was no significant difference in genotype and allele frequencies between control group and nasopharyngeal carcinoma group (P 0.05). There was no significant difference in haplotype frequency distribution between control group and nasopharyngeal carcinoma group (P 0.05). Conclusion CT genotypes of rs11728697 locus in Guangxi Zhuang population may increase the susceptibility of NPC, but the polymorphism of rs4754 locus is not related to the susceptibility of NPC.
【作者單位】: 右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科;右江民族醫(yī)學(xué)院中醫(yī)藥化學(xué)實(shí)驗(yàn)室;右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院桂西高發(fā)病防治實(shí)驗(yàn)中心;
【基金】:廣西自然科學(xué)基金(2012GXSFBA053121) 百色市科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)項(xiàng)目(百科計(jì)20140617;20140901)
【分類號(hào)】:R739.63

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本文編號(hào):2153277

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