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Gpnmb基因在BXD重組近交系小鼠眼組織的表達(dá)差異和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-31 17:39

  本文選題:糖蛋白神經(jīng)調(diào)節(jié)肽B相關(guān)基因 + 色素性青光眼。 參考:《江蘇醫(yī)藥》2014年02期


【摘要】:目的研究色素播散綜合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神經(jīng)調(diào)節(jié)肽B相關(guān)基因(Gpnmb)在BXD重組近交系(BXD RI)小鼠眼組織的表達(dá)差異及其基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。方法采用Affymetrix基因芯片檢測(cè)確定68個(gè)品系的BXD RI小鼠眼組織中Gpnmb基因的表達(dá)差異。采用基因表達(dá)數(shù)量性狀基因座(eQTL)分析方法,結(jié)合GeneNetwork網(wǎng)站上的在線分析工具,研究差異表達(dá)的特征,進(jìn)而構(gòu)建Gpnmb基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。結(jié)果 Gpnmb在BXD RI眼組織中平均表達(dá)水平為10.92,不同品系小鼠表達(dá)量存在差異。Gpnmb基因?yàn)轫樖阶饔玫膃QTL,End3基因是其下游候選基因;诤虶pnmb高度相關(guān)基因的基因網(wǎng)絡(luò)得以構(gòu)建。結(jié)論構(gòu)建Gpnmb基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為PDS和PG發(fā)病機(jī)制的深入研究提供線索。
[Abstract]:Objective to study the differential expression of glycoprotein neuromodulatory peptide B related gene (Gpnmb) related genes (Gpnmb) in the BXD recombinant inbred line (BXD RI) mouse eye tissues and its gene regulation network. Methods the Gpnmb gene in the BXD RI mouse eye tissues of 68 strains was determined by Affymetrix gene chip. The analysis method of gene expression quantitative trait loci (eQTL) and the online analysis tool on the GeneNetwork website were used to study the characteristics of the differential expression, and then the Gpnmb gene regulation network was constructed. The average expression level of Gpnmb in the BXD RI eye tissues was 10.92, and the expression of different strain mice was different in the.Gpnmb gene. For the CIS action of eQTL, the End3 gene is the downstream candidate gene. The gene network based on the highly related gene of Gpnmb is constructed. Conclusion the construction of the Gpnmb gene regulation network provides a clue for the in-depth study of the pathogenesis of PDS and PG.
【作者單位】: 南通大學(xué)附屬醫(yī)院眼科;美國(guó)田納西大學(xué)醫(yī)學(xué)中心;
【基金】:江蘇省自然科學(xué)基金(BK2008186) 南通市社會(huì)事業(yè)創(chuàng)新與示范計(jì)劃(HS2011005)
【分類號(hào)】:R775

【共引文獻(xiàn)】

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1 陳穎;應(yīng)用遺傳基因組學(xué)手段初步構(gòu)建阿爾茨海默病相關(guān)基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[D];南通大學(xué);2009年

【相似文獻(xiàn)】

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2 柳曦,廖崇凱;色素性青光眼2例[J];眼科新進(jìn)展;1998年03期

3 明萍,陶永賢;單側(cè)色素性青光眼1例報(bào)告[J];重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);1998年02期

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5 周麗鈞,黃又莉,王安悅;色素性青光眼2例[J];中國(guó)實(shí)用眼科雜志;1995年06期

6 王延俊;程依璉;羅又蓉;;遺傳性色素性青光眼一家系[J];醫(yī)學(xué)科技;1992年00期

7 Tura噻h M.E;Tekeli O. ;王大江;;色素性青光眼伴巨大角膜[J];世界核心醫(yī)學(xué)期刊文摘(眼科學(xué)分冊(cè));2006年03期

8 張黎,張昆;色素性青光眼減壓術(shù)后長(zhǎng)期隨訪1例報(bào)告[J];眼外傷職業(yè)眼病雜志(附眼科手術(shù));1998年05期

9 陳少華;;色素性青光眼1例報(bào)告[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào);1989年01期

10 王蓉芳,嵇訓(xùn)傳;色素性青光眼[J];國(guó)際眼科學(xué)縱覽;1986年02期

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1 周苗苗;后房型有晶體眼人工晶體植入術(shù)矯正散光的臨床研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2010年



本文編號(hào):1960719

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