Gpnmb基因在BXD重組近交系小鼠眼組織的表達差異和基因調控網絡分析
本文選題:糖蛋白神經調節(jié)肽B相關基因 + 色素性青光眼。 參考:《江蘇醫(yī)藥》2014年02期
【摘要】:目的研究色素播散綜合征(PDS)和色素性青光眼(PG)致病基因糖蛋白神經調節(jié)肽B相關基因(Gpnmb)在BXD重組近交系(BXD RI)小鼠眼組織的表達差異及其基因調控網絡。方法采用Affymetrix基因芯片檢測確定68個品系的BXD RI小鼠眼組織中Gpnmb基因的表達差異。采用基因表達數量性狀基因座(eQTL)分析方法,結合GeneNetwork網站上的在線分析工具,研究差異表達的特征,進而構建Gpnmb基因調控網絡。結果 Gpnmb在BXD RI眼組織中平均表達水平為10.92,不同品系小鼠表達量存在差異。Gpnmb基因為順式作用的eQTL,End3基因是其下游候選基因;诤虶pnmb高度相關基因的基因網絡得以構建。結論構建Gpnmb基因調控網絡,為PDS和PG發(fā)病機制的深入研究提供線索。
[Abstract]:Objective to study the differential expression of glycoprotein neuromodulatory peptide B related gene (Gpnmb) related genes (Gpnmb) in the BXD recombinant inbred line (BXD RI) mouse eye tissues and its gene regulation network. Methods the Gpnmb gene in the BXD RI mouse eye tissues of 68 strains was determined by Affymetrix gene chip. The analysis method of gene expression quantitative trait loci (eQTL) and the online analysis tool on the GeneNetwork website were used to study the characteristics of the differential expression, and then the Gpnmb gene regulation network was constructed. The average expression level of Gpnmb in the BXD RI eye tissues was 10.92, and the expression of different strain mice was different in the.Gpnmb gene. For the CIS action of eQTL, the End3 gene is the downstream candidate gene. The gene network based on the highly related gene of Gpnmb is constructed. Conclusion the construction of the Gpnmb gene regulation network provides a clue for the in-depth study of the pathogenesis of PDS and PG.
【作者單位】: 南通大學附屬醫(yī)院眼科;美國田納西大學醫(yī)學中心;
【基金】:江蘇省自然科學基金(BK2008186) 南通市社會事業(yè)創(chuàng)新與示范計劃(HS2011005)
【分類號】:R775
【共引文獻】
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【相似文獻】
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本文編號:1960719
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