本文選題：Leber遺傳性視神經(jīng)病變　切入點：線粒體DNA　出處：《鄭州大學》2010年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】： 目的分析一未攜帶原發(fā)突變且僅有男性患者的Leber遺傳性視神經(jīng)病變家系的臨床表型、遺傳特征,檢測其突變基因,探討是否與x染色體有關。 方法收集河南安陽一僅有男性患者且臨床診斷為LHON家系的臨床資料,分析遺傳特征；用Primer5設計線粒體引物,PCR (polymerase chain reaction)-測序重新檢測該家系是否攜帶3個原發(fā)突變。對先證者線粒體基因(mitochondrial DNA, mtDNA)全測序,將測序結果與修正的mtDNA劍橋標準序列比對,確定該家系的突變位點,然后在專業(yè)遺傳學網(wǎng)站上查找這些突變位點的相關信息,必要時進行對照人群mtDNA測序分析,以確定致病突變；在ABI PRISM(?) Linkage Mapping Set Version 2.5試劑盒中挑選可以覆蓋整條X染色體的18個微衛(wèi)星熒光標記對家系內(nèi)成員進行X染色體掃描,Genotyper3.7軟件進行基因分型,Linkage和Merlin 1.1.2軟件進行連鎖分析,初步定位可能存在X連鎖修飾基因的區(qū)域,進一步進行精細掃描和定位,最后利用Cyrillie軟件構建單倍體型圖,確定是否存在X染色體連鎖修飾基因。 結果此家系符合母系遺傳特征,30位母系成員中6人發(fā)病,且全部為男性,表現(xiàn)出低外顯率和男性患病偏倚的特點。重新測序發(fā)現(xiàn)該家系未攜帶3個原發(fā)突變。先證者mtDNA全測序結果發(fā)現(xiàn)31個同質(zhì)突變位點,其中包括1個已報道的致病突變位點G3635A和2個未報道過的突變點ND4 T11809C與ND5A12340G。T11809C為無義突變,A12340G為錯義突變,剩余28個突變點均為已報道過的線粒體多態(tài),該先證者屬于線粒體單倍體型F1。MtDNA測序所有其它母系成員均同時攜帶G3635A和A12340G突變。107位正常家系外對照中不存在G3635A和A12340G突變。連鎖分析在DXS1060得到最大兩點LOD值1.46(θ=0.0),但是兩點非參數(shù)分析和多點非參數(shù)分析結果顯示所有標記p0.05,單倍體型分析圖未發(fā)現(xiàn)共分離單倍體。 結論此家系為攜帶G3635A和A12340G突變的LHON家系；此家系不存在X連鎖修飾基因。
[Abstract]:Objective to analyze the clinical phenotype and genetic characteristics of a family with Leber hereditary optic neuropathy without primary mutation and only male patients, to detect the mutation gene and to explore whether it is related to the x chromosome. Methods the clinical data of male patients with LHON were collected and the genetic characteristics were analyzed. Polymerase chain reaction- sequencing was used to detect whether the family carried three primary mutations. The mitochondrial DNA (mtDNA) of the proband was sequenced, and the results were compared with the modified mtDNA Cambridge standard sequence. Identify the mutation sites of the family, then search the website of professional genetics for the relevant information of these mutation sites and, if necessary, carry out the mtDNA sequencing analysis in the control population to determine the pathogenic mutation. Linkage Mapping Set Version 2.5 kit selected 18 microsatellite fluorescent markers that could cover the entire X chromosome. Genotyper3.7 software was used to carry out genotyping and Linkage and Merlin 1.1.2 for linkage analysis. The region of X linkage modifier gene may be located preliminarily, and further fine scanning and localization are carried out. Finally, haploid pattern is constructed by Cyrillie software to determine the existence of X chromosome linkage modification gene. Results 6 of the 30 maternal members of this family, all of whom were male, were in accordance with the maternal genetic characteristics. It was found that the pedigree did not carry three primary mutations, while the proband mtDNA sequencing revealed 31 homogenous mutation sites. Among them, one reported mutation site G3635A and two unreported mutation sites ND4 T11809C and ND5A12340G.T11809C were nonsense mutations and A12340G were missense mutations. The remaining 28 mutation sites were all reported mitochondrial polymorphisms. The proband belonged to mitochondrial haploid type F1. MtDNA sequencing. All other maternal members were carrying G3635A and A12340G mutations simultaneously. There were no G3635A and A12340G mutations in the normal pedigree. Linkage analysis showed that the maximum two LOD values were 1.46 (胃 0.00. 01) in DXS1060, but G3635A and A12340G mutations were not present in the normal pedigree. The results of two-point nonparametric analysis and multi-point nonparametric analysis showed that all markers were p0.05, and no cosegregated haploid was found in haploid pattern. Conclusion this family is a LHON family with G3635A and A12340G mutations, and there is no X linkage modifier gene in this family.
【學位授予單位】：鄭州大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2010
【分類號】：R774.6

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本文編號：1589178