本文關(guān)鍵詞： 轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-βⅡ 寡核苷酸類 分子對(duì)接 結(jié)合位點(diǎn) 生物傳感器　出處：《重慶醫(yī)學(xué)》2014年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-βⅡ型受體(TRβⅡ)胞外段蛋白與靶向適配子S58的結(jié)合位點(diǎn),并在體外進(jìn)行驗(yàn)證,證實(shí)S58的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。方法通過(guò)適配子ssDNA序列建立其三維結(jié)構(gòu),在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索受體蛋白TRβⅡ胞外段的晶體結(jié)構(gòu),運(yùn)用計(jì)算機(jī)輔助技術(shù)對(duì)兩個(gè)分子進(jìn)行對(duì)接實(shí)驗(yàn),根據(jù)結(jié)果指導(dǎo)剪切優(yōu)化適配子結(jié)構(gòu),分別用生物傳感器技術(shù)及蛋白免疫印跡法驗(yàn)證其親和力。結(jié)果核酸適配子ssDNA S58與TRβⅡ胞外段蛋白結(jié)合的可信位點(diǎn)包括位點(diǎn)Ⅰ(T4、T5、G6、C7)、位點(diǎn)Ⅱ(G13、A14、T15、C16、G17、C18)、位點(diǎn)Ⅲ(T31、G32、T33、C34)及位點(diǎn)Ⅳ(G40、A41、T42、T43、T44、G45、G46)。S58與TRβⅡ胞外段蛋白的親和力高,S58的α-平滑肌肌動(dòng)蛋白(α-SMA)表達(dá)明顯較DMEM對(duì)照降低(P0.05),根據(jù)結(jié)果剪切適配子S58后得到優(yōu)化后的ssDNA親和力、α-SMA表達(dá)均不如S58。結(jié)論核酸適配子S58為受體蛋白TβRⅡ的高特異性分子,具有一定穩(wěn)定性,任何結(jié)構(gòu)的改變均會(huì)降低與TβRⅡ的親和力。計(jì)算機(jī)輔助的分子對(duì)接技術(shù)成為一項(xiàng)探索分子間作用的重要手段,為醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究提供了良好的理論依據(jù)。
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本文編號(hào)：1443864