本文關(guān)鍵詞： 轉(zhuǎn)化生長因子-βⅡ 寡核苷酸類 分子對接 結(jié)合位點 生物傳感器　出處：《重慶醫(yī)學(xué)》2014年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的預(yù)測轉(zhuǎn)化生長因子-βⅡ型受體(TRβⅡ)胞外段蛋白與靶向適配子S58的結(jié)合位點,并在體外進行驗證,證實S58的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性。方法通過適配子ssDNA序列建立其三維結(jié)構(gòu),在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫搜索受體蛋白TRβⅡ胞外段的晶體結(jié)構(gòu),運用計算機輔助技術(shù)對兩個分子進行對接實驗,根據(jù)結(jié)果指導(dǎo)剪切優(yōu)化適配子結(jié)構(gòu),分別用生物傳感器技術(shù)及蛋白免疫印跡法驗證其親和力。結(jié)果核酸適配子ssDNA S58與TRβⅡ胞外段蛋白結(jié)合的可信位點包括位點Ⅰ(T4、T5、G6、C7)、位點Ⅱ(G13、A14、T15、C16、G17、C18)、位點Ⅲ(T31、G32、T33、C34)及位點Ⅳ(G40、A41、T42、T43、T44、G45、G46)。S58與TRβⅡ胞外段蛋白的親和力高,S58的α-平滑肌肌動蛋白(α-SMA)表達明顯較DMEM對照降低(P0.05),根據(jù)結(jié)果剪切適配子S58后得到優(yōu)化后的ssDNA親和力、α-SMA表達均不如S58。結(jié)論核酸適配子S58為受體蛋白TβRⅡ的高特異性分子,具有一定穩(wěn)定性,任何結(jié)構(gòu)的改變均會降低與TβRⅡ的親和力。計算機輔助的分子對接技術(shù)成為一項探索分子間作用的重要手段,為醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究提供了良好的理論依據(jù)。
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本文編號：1443864