本文關鍵詞：一個先天性白內(nèi)障家系致病基因的鑒定

  更多相關文章： 先天性白內(nèi)障 基因組掃描 連鎖分析 突變檢測 CRYBB2

【摘要】：先天性白內(nèi)障又稱嬰幼兒白內(nèi)障,是兒童致盲的主要原因之一,流行病學調(diào)查顯示其患病率為1-6/10000。在先天性白內(nèi)障患者中,大約8.3%-25%是遺傳性的。其遺傳方式有常染色體顯性遺傳(autosomal dominant, AD)、常染色體隱性遺傳(autosomal recessive, AR)和X連鎖隱性遺傳(X-linked recessive, XR),其中以常染色體顯性遺傳最為常見。該病具有高度遺傳異質(zhì)性,致病基因分別定位在1p36、3q21、13q11-q12、22q11等不同的染色體位上,已克隆了至少39個基因,其中晶狀體蛋白突變是其發(fā)生的主要原因,約占遺傳性白內(nèi)障的50%。 目的：鑒定一個先天性白內(nèi)障大家系的致病基因。 方法：本研究收集了一個先天性白內(nèi)障家系36名成員(其中患者20名)的血樣,選取家系中24名成員(其中患者18名)進行全基因組掃描和多點連鎖分析,根據(jù)連鎖分析的結果構建單體型圖確定致病基因候選區(qū)間；對候選區(qū)間進行生物信息學分析,確定候選基因；最后對候選基因進行突變篩查,以期找到致病基因。 結果：通過全基因組掃描和連鎖分析,我們在22號染色體rs140390、rs743409及rs2283792處得到最大LOD值3.263；單體型分析將疾病基因定位于22q11.21-12.1的2個SNP標記rs2283792和rs761670之間4.3Mb區(qū)域。依據(jù)功能候選策略,分析UCSC數(shù)據(jù)庫rs2283792至rs761670之間及其附近的基因,晶狀體蛋白基因CRYBB2、CRYBB3被選為首批候選基因。通過對先證者CRYBB2、 CRYBB3基因編碼區(qū)及外顯子與內(nèi)含子交界區(qū)域進行測序分析,發(fā)現(xiàn)CRYBB2第453位由G改變成了C (c.453GC)。隨后對家系中其他成員該位點進行了檢測,發(fā)現(xiàn)該變異在家系內(nèi)與疾病共分離。查詢NCBI SNP數(shù)據(jù)庫顯示數(shù)據(jù)庫中未收錄。對300個正常個體該位點進行檢測亦未發(fā)現(xiàn)該突變。 結論：CRYBB2基因c.453GC是此先天性白內(nèi)障家系的致病突變。
【關鍵詞】：先天性白內(nèi)障 基因組掃描 連鎖分析 突變檢測 CRYBB2
【學位授予單位】：中南大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2014
【分類號】：R776.1;Q78
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-8
• 目錄8-9
• 英文縮略詞表9-10
• 主要儀器、試劑與耗材10-13
• 前言13-17
• 1 研究對象17-19
• 2 研究方法19-27
• 2.1 樣本收集19
• 2.2 全基因組掃描19-22
• 2.3 連鎖分析22
• 2.4 單體型圖的構建22
• 2.5 生物信息學分析及候選基因確定22
• 2.6 候選基因突變篩查22-26
• 2.7 保守性分析26-27
• 3 結果27-33
• 3.1 全基因組掃描及連鎖分析結果27-29
• 3.2 單體型圖29-30
• 3.3 生物信息學分析及候選基因確定30
• 3.4 候選基因突變檢測結果30-32
• 3.5 保守性分析32-33
• 4 討論33-38
• 5 結論38-39
• 參考文獻39-44
• 綜述44-57
• 參考文獻52-57
• 致謝57-58
• 個人簡歷58

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 薛金龍;石淑先;孫芳玲;艾厚喜;張麗;王文;;Wnt信號通路及相關神經(jīng)因子對神經(jīng)再生的影響[J];中國比較醫(yī)學雜志;2013年09期

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本文編號：1027877