目的心肌肥厚是心血管疾病(如高血壓、心肌梗死)所引起的常見病理過程,是引起心力衰竭和猝死的主要原因,然而,心肌肥厚發(fā)生發(fā)展過程中的相關因素尚未完全明確。本研究通過生物信息學分析結合生物學實驗,篩選和鑒定與心肌肥厚密切相關的關鍵基因,為進一步探討和分析心肌肥厚的分子機制奠定基礎。方法從美國國立生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GEO數據庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)下載數據集GSE47420,我們使用其中野生型小鼠的數據樣本,包括對照組和Ang II組,每組分別包含3個C57Bl/6J小鼠樣本和3個Balb/C小鼠樣本。在GPL6887平臺(Illumina MouseWG-6 v2.0 expression beadchip)的基礎上使用GEO2R在線工具,以P0.05且|logFC|0.5為閾值分別篩選C57Bl/6J和Balb/C小鼠對照組與Ang II組之間差異表達基因;利用DAVID6.7(https://david-d.ncifcrf.gov/)在線數據庫對兩種小鼠中共有差異表達基因進行基因本體論GO和信號通路KEGG富集分析;通過String數據庫和Cytoscape軟件對差異基因進行蛋白質相互作用網絡分析和可視化,以degree10為標準確定樞紐基因;通過持續(xù)泵注Ang II建立昆明小鼠心肌肥厚模型,采用超聲多普勒、形態(tài)學、組織學進行模型鑒定,并通過qPCR方法檢測DEGS在心肌肥厚中的表達。結果經分析得到共同差異表達基因202個,其中上調基因127個,下調基因75個。GO富集結果顯示,上調基因主要富集在膠原纖維組織、細胞對機械刺激的反應、血管生成等生物學過程;下調基因主要富集在代謝過程、氧化還原過程、脂肪酸β-氧化等生物學過程。KEGG信號通路結果顯示,上調基因主要參與癌癥中的蛋白多糖、HIF-1信號通路等信號通路;下調基因主要參與代謝途徑、纈氨酸,亮氨酸和異亮氨酸降解等信號通路。PPI分析獲得樞紐基因12個,包括Dcn、Hadha、Col5a1、Hsp90aa1、Lox、Fbn1、Col3a1、Igf1、Loxl1、Mmp2、Bgn、Timp1。qPCR結果顯示,肥厚心肌組織中的樞紐基因Dcn、Hadha和Hsp90aa1的表達水平明顯下調。結論本研究篩選并鑒定出肥厚心肌組織中異常變化的若干基因及相關信號通路,這為后續(xù)解析心肌肥厚發(fā)生發(fā)展的分子機制提供新的方向和實驗基礎。
【學位單位】：錦州醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位年份】：2019
【中圖分類】：R54
【部分圖文】：

Ephb1 0.004699 -1.33Smtn 0.002508 -1.34Sybu 0.001786 -1.36Scgb1c1 0.015034 -1.39Itgb6 0.002508 -1.46Whrn 0.013889 -1.46Cpeb3 0.000345 -1.49Ift81 0.013924 -1.49Pdp2 0.002943 -1.52Acot1 0.018264 -1.53Acaa2 0.004278 -1.58Cdkn1c 0.001102 -1.63Pigh 0.009544 -1.71Dgat2 0.008132 -1.76Lgals4 0.002233 -1.86Ky 0.002776 -1.88Ces1d 0.037284 -2.36

圖 2 蛋白質相互作用網絡分析注：圖 2（A、B 和 C）綠色代表上調基因，紅色代表下調基因。B：C57Bl/6J 小鼠和lb/C 小鼠樣本中共有差異基因熱圖。、小鼠模型建立

AngII組和對照組給藥前1天和給藥第13天,小鼠血壓測量代表圖片
【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 肖珍;朱杰寧;唐春梅;林秋雄;胡志琴;張灼;符永恒;張夢珍;單志新;;巨噬細胞移動抑制因子缺失加重苯腎上腺素誘導的小鼠心肌肥厚[J];上海大學學報(自然科學版);2016年03期

2 楊志軍;王耀峰;文小軍;;急性一氧化碳中毒對小鼠心肌酶學的影響[J];新鄉(xiāng)醫(yī)學院學報;2014年01期

3 嚴思敏;吳雙;蔣碧梅;涂自智;王慷慨;肖獻忠;;異丙腎上腺素所致小鼠心肌肥厚中核仁素的表達[J];中南醫(yī)學科學雜志;2013年02期

4 朱咸中,曾伶,薛存寬,李穎,尹丙姣;SOD對小鼠心肌攝取~(86)Rb的影響[J];放射學實踐;1999年04期

5 殷同慶;;慢性乙醇對小鼠心肌LDH同工酶活性的影響[J];南通大學學報(醫(yī)學版);1988年03期

6 曹振華;張力平;趙魯鳴;;冠心靈對小鼠心肌營養(yǎng)性血流量的影響[J];山東中醫(yī)學院學報;1988年02期

7 趙波;黃獻誠;杜宏微;吳小春;王貴喜;李樹濃;;雷公藤延長同種小鼠心肌移植物存活時間的研究[J];中西醫(yī)結合雜志;1988年01期

8 程聽,徐光祿;阿霉素對小鼠心肌過氧化代謝的影響[J];中國藥理學通報;1989年04期

9 張蒙;董苗;周暄宣;魏仁吉;王玉玲;李步瀠;于立明;翟蒙恩;金振曉;段維勛;王四旺;;二苯乙烯苷對小鼠心肌肥厚作用的研究[J];中國體外循環(huán)雜志;2016年04期

10 陳桂秀;楊明濤;劉濤;王浩宇;劉康;馮剛;;小鼠心肌微血管內皮細胞的體外培養(yǎng)[J];西部醫(yī)學;2013年03期

相關博士學位論文 前10條

1 劉琴;復方羅布麻片對小鼠心肌肥厚的作用及其機制研究[D];廣州中醫(yī)藥大學;2015年

2 程姝娟;Toll樣受體4在內毒素誘導的小鼠心肌炎癥因子表達和左室功能不全中的作用[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進修學院;2004年

3 李傳保;乙醛脫氫酶2對代謝綜合征小鼠心肌的保護作用及機制研究[D];山東大學;2015年

4 宋延彬;腎功能不全小鼠心肌缺血/再灌注損傷加重及機制：心肌脂聯(lián)素信號通路受損[D];第四軍醫(yī)大學;2014年

5 董梅;受體相互作用蛋白3基因和亮氨酸酮對小鼠心肌缺血再灌注損傷影響研究[D];天津醫(yī)科大學;2011年

6 劉波;激活cAMP信號通路抑制CTGF表達對小鼠心肌梗死后心肌纖維化調控的研究[D];華中科技大學;2015年

7 陳蓉;蛇床子素抑制異丙腎上腺素誘導小鼠心肌纖維化及其機制研究[D];蘇州大學;2012年

8 邸若岷;雷帕霉素改善小鼠心肌梗死后心室重構的分子機制研究[D];南京醫(yī)科大學;2010年

9 凌樹寬;高糖和壓力過負荷誘導心肌重塑的調控機制研究[D];哈爾濱工業(yè)大學;2016年

10 王振華;新生小鼠心肌再生機制的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2013年

相關碩士學位論文 前10條

1 黃耀孟;缺失SM22α促進小鼠心肌纖維化[D];河北醫(yī)科大學;2019年

2 孫靜;運動誘導miR-126對db/db小鼠心肌的保護作用及機制研究[D];武漢體育學院;2019年

3 史卓;小鼠心肌肥厚密切相關基因的篩選與鑒定[D];錦州醫(yī)科大學;2019年

4 李碩;漆樹酸改善壓力過載致小鼠心肌肥厚的組蛋白乙�；{控機制[D];遵義醫(yī)科大學;2019年

5 顧信建;間歇性缺氧誘導apoE~(-/-)小鼠心肌纖維化的可能機制探討[D];福建醫(yī)科大學;2018年

6 王雪晴;維生素B6在小鼠心肌梗死后心功能恢復中的作用及機制研究[D];山東大學;2019年

7 趙文靜;調節(jié)性T細胞參與調控新生小鼠心肌再生[D];山西醫(yī)科大學;2019年

8 張會;雙酪氨酸誘導小鼠心肌損傷和能量代謝障礙的研究[D];江南大學;2018年

9 姜媛媛;胞內HMGB1調控EAM小鼠心肌浸潤Mφ極化的機制研究[D];江蘇大學;2018年

10 高源;心安顆粒對病毒性心肌炎小鼠心肌NF-κB信號通路及細胞凋亡的影響[D];西南醫(yī)科大學;2017年

本文編號：2875454