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心臟血管影像形態(tài)及功能智能化分析

發(fā)布時間:2020-06-23 05:15
【摘要】:在醫(yī)學領域中,醫(yī)學影像的分析和處理在醫(yī)生進行疾病診斷起到了重要的輔助作用。近年來,越來越多的研究者開始關注醫(yī)學圖像處理中的模式識別、分類以及分割等處理技術(shù)。機器學習技術(shù)使研究人員能夠開發(fā)和利用復雜的模型來分類或預測各種異;蚣膊,或者進行醫(yī)學病灶的識別和分割。近幾年來,深度學習的快速發(fā)展使得醫(yī)學圖像的輔助診斷作用發(fā)展到了巔峰。本文基于深度學習的方法對醫(yī)學圖像中的心臟血管圖像的形態(tài)和功能進行了分析,對進一步分析疾病進行輔助診斷有著重大的意義。本文中遇到的研究挑戰(zhàn)一個是由于醫(yī)學圖像的復雜性和保密性,目前用于公開的數(shù)據(jù)集比較少,而且由于醫(yī)學圖像的標注需要專業(yè)性的評估,因此帶標簽的數(shù)據(jù)集更少。另一個就是由于醫(yī)學圖像一般為灰度圖像,蘊含的特征比較少,在傳統(tǒng)的機器學習中大多用到的是基于灰度紋理等特征,使得分析十分具有局限性;诖,本文的主要工作有以下三個:(1)構(gòu)造了血管內(nèi)超聲圖像的一些系列數(shù)據(jù)集,本文中的數(shù)據(jù)是采集自醫(yī)院的臨床數(shù)據(jù),十分具有臨床意義。首先是人類正常血管和分叉血管的數(shù)據(jù)集,此數(shù)據(jù)集中包括2288張圖像,其中正常血管圖像1144張,分叉血管圖像1144張,在專業(yè)醫(yī)生的指導下對分叉血管和正常血管進行標注。然后分別構(gòu)造了分叉血管和正常血管的內(nèi)外膜分割數(shù)據(jù)集,其中分叉血管數(shù)據(jù)有1144張,正常血管數(shù)據(jù)有5216張,數(shù)據(jù)集中內(nèi)外膜的標注是由專業(yè)的醫(yī)學生進行標注,具有一定的醫(yī)學可信度。最后構(gòu)造的心臟血管圖像功能性分析數(shù)據(jù)集是基于醫(yī)院生物實驗數(shù)據(jù),采集了兔子動脈粥樣硬化模型的23個血管病理切片和相應的3535張血管內(nèi)超聲圖像。(2)提出了一個基于深度學習的血管內(nèi)超聲圖像處理系統(tǒng),在此系統(tǒng)中將深度學習的方法應用到血管內(nèi)超聲圖像的分類及內(nèi)外膜分割中。首先是基于四種經(jīng)典分類網(wǎng)絡AlexNet、VGG、ResNet以及DenseNet對分叉血管和正常血管進行分類處理,并對四種分類模型進行評估得到最優(yōu)分類模型;然后將此最優(yōu)分類模型中得到的分類結(jié)果即分叉血管和正常血管分別利用四種分割網(wǎng)絡FCN、DeepLab v2、DeepLabv3+以及GAN進行內(nèi)外膜的分割,對這四種分割網(wǎng)絡評估其分割性能,將分割效果最好的網(wǎng)絡保存并輸出分割結(jié)果;最后將得到的內(nèi)外膜分割結(jié)果進行三維重建,以便進行下一步的分析,輔助醫(yī)生進行疾病分析和診斷。(3)基于深度學習提出了一種確定區(qū)分易損斑塊和穩(wěn)定斑塊易損性指數(shù)分界點的新方法,對醫(yī)學圖像進一步進行了分析。首先,收集兔子動脈粥樣硬化斑塊模型的血管內(nèi)超聲圖像,然后將相應的血管制成病理切片以計算易損性指數(shù),確定一個易損指數(shù),并以易損指數(shù)為依據(jù)制作標簽。在此易損指數(shù)之上,它被標記為易破裂的斑塊也就是不穩(wěn)定的斑塊,在此易損指數(shù)之下,則視為穩(wěn)定斑塊。根據(jù)得到的標簽和血管內(nèi)超聲圖像,利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡進行分類,然后連續(xù)替換易損指數(shù)點,可以分別得到相應的分類準確率。根據(jù)易損性指數(shù)與準確率的擬合關系,找到分類精度最高的易損指數(shù)?梢哉J為這是最佳的易損指數(shù)分類點。根據(jù)實驗結(jié)果,該最優(yōu)易損指數(shù)的臨界點是1.022。然而當試圖擴大易損指數(shù)范圍時,發(fā)現(xiàn)該擬合曲線不再適用。因此,將擬合函數(shù)換為傅里葉變換,此擬合曲線具有一定的周期性。在對驗證集進行驗證后,發(fā)現(xiàn)驗證集的分類精度在易損指數(shù)為2.398時達到最大值。當數(shù)據(jù)源由血管內(nèi)超聲圖像改變?yōu)榘邏K成分數(shù)據(jù)作為分類數(shù)據(jù)時,可以發(fā)現(xiàn)該規(guī)則仍然存在。但是此時發(fā)現(xiàn)的最佳易損指數(shù)略有下降,變?yōu)?.198。最終基于驗證集上對獲得的易損指數(shù)分類點做驗證,最高準確率為76.5%。這表明該方法在尋找最佳分類易損指數(shù)點方面具有一定的效果。
【學位授予單位】:山東大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:TP391.41;R540.4
【圖文】:

示意圖,圖像,示意圖,斑塊


中不僅可以精確的丈量管腔直徑長度從而計算容積,還可以測量斑塊的大小,更逡逑重要的是可以提供斑塊的組織信息,從而輔助冠心病的診斷和有效的介入治療。逡逑下圖1-1是一幅IVUS圖像,從圖中可以看出黃色線標注的是血管外膜,紅色逡逑2逡逑

人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型,無連接,全連接,隱藏層


以及輸出層。輸入層主要是接收輸入信息,并將信息輸送到隱藏層;隱藏層的作逡逑用就是將接受到的輸入層的信息經(jīng)過操作之后傳到輸出層;輸出層則更為簡單,逡逑就是輸出整個的計算結(jié)果。人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型圖如下圖2-1所示:逡逑y逡逑▲逡逑輸出層逡逑i邋+l邋)邋隱藏層逡逑+i隱藏層逡逑Xi邋X2邋X3逡逑圖2-1人工神經(jīng)網(wǎng)絡模型圖逡逑如圖2-1所示,可以看出各層之間是全連接的關系,而同層之間無連接。在前逡逑向傳播過程中,假設輸入信號為X=[;^e7?D,那么輸出信號y的計算公式如下逡逑所示:逡逑外0/:邋0)邋=邋/⑵(Zf=1邋<2)/⑴邋+邋(過=1邐b⑴)+邋42))邐(2-1邋)逡逑在上述公式中,上標代表層索引,/⑵(?)、/⑴(■)代表指定層的非線性激活函逡逑數(shù),M代表隱藏層神經(jīng)元的數(shù)量,D是輸入信號的數(shù)量,0邋=邋{vv(1),邋w(2\邋fcW,邋M2)}是逡逑參數(shù)向量。由于整個計算過程是以前向方式進行的,因此這種網(wǎng)絡也稱為前饋神逡逑經(jīng)網(wǎng)絡。逡逑在神經(jīng)網(wǎng)絡的實驗過程中,主要就是學習參數(shù)向量的過程。這過程可以描述逡逑為誤差函數(shù)最小化。對于前饋神經(jīng)網(wǎng)絡來說,可以通過誤差反向傳播算法(Back逡逑Propagation)邋[3S]來評估梯度

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3 衣曉峰 施e

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