血管內(nèi)皮損傷相關(guān)circRNA與原發(fā)性高血壓的關(guān)聯(lián)性研究
【圖文】:
RNA 的序列數(shù)據(jù)可以通過circBase,CircNet 和CircInteractome 數(shù)據(jù)庫獲取,,而miRNA的相關(guān)序列也可以通過 miRbase,miRDB,miRanda等數(shù)據(jù)庫獲取,下面介紹下如何通過circBase(http://circrna.org/)以及 miRbase(http://www.mirbase.org/) 分別得到目標(biāo)circRNA和 miRNA的序列數(shù)據(jù):(1) circBase獲取目標(biāo) circRNA的序列首先進(jìn)入 circBase 數(shù)據(jù)庫(http://circrna.org/)的首頁,以 hsa_circ_0126991 為例,在檢索框中輸入hsa_circ_0126991 后,點(diǎn)擊“Search”,網(wǎng)站將自動(dòng)檢索數(shù)據(jù)庫中相對應(yīng)的結(jié)果,結(jié)果中我們可以看到目標(biāo)circRNA 的基本信息,包括來源基因組的信息,剪接體的信息以及現(xiàn)階段研究的相關(guān)注釋。隨后我們從結(jié)果界面中點(diǎn)擊“fasta”進(jìn)入 circRNA序列下載界面,其中circBase 提供兩種 circRNA的下載模式,一種是circRNA 的相對應(yīng)的來源基因組序列,模式名為“genomic”;另一種是成熟的 circRNA剪接體的序列,模式名為“spliced”,此處我們選擇成熟circRNA 剪接體模式,默認(rèn)其他參數(shù),點(diǎn)擊“Search”即可下載。
血管內(nèi)皮損傷相關(guān)circRNA與原發(fā)性高血壓的關(guān)聯(lián)性研究 miRbase獲取目標(biāo)miRNA 的序列首先輸入 miRbase的網(wǎng)址(http://www.mirbase.org/)進(jìn)入其主頁。在主會(huì)顯示目前 miRbase共收錄了 miRNA 的數(shù)量,截止目前為止已更新至條,在檢索框中我們輸入我們的目標(biāo) miRNA(以 miR-10a-5p 為例),“Go”,數(shù)據(jù)庫將檢索現(xiàn)存數(shù)據(jù)庫中所有物種的miR-10a-5p 的結(jié)果,下帶有“Hsa”的目標(biāo) RNA即為人類中的成熟 miRNA 序列。
【學(xué)位授予單位】:寧波大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R544.11
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本文編號:2706374
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