云南地區(qū)冠心病患者的腸道菌群特征分析
發(fā)布時間:2020-04-30 14:53
【摘要】:目的:人類皮膚和粘膜表面和腸道分布的無數(shù)微生物,由細菌、古細菌,病毒,真菌,和其他原生動物組成,統(tǒng)稱為微生物群。人類的腸道,大約有1000種微生物定居。細菌傾向于相互關(guān)聯(lián)和互惠共生或寄生的方式。在所有的工業(yè)化國家,心血管疾病發(fā)病率和死亡率持續(xù)居高不下。中國近年來呈明顯上升趨勢,每年新發(fā)至少50萬,現(xiàn)患至少200萬,許多患者正經(jīng)歷著持續(xù)發(fā)病,最終發(fā)展為心力衰竭,甚至死亡。國內(nèi)外研究已經(jīng)證實腸道菌群代謝物磷脂酰膽堿可以促進心血管疾病,同時,磷脂酰膽堿衍生物三甲胺(TMA)可導致動脈粥樣硬化,并促進心血管疾病的發(fā)生。對冠心病患者腸道菌群多樣性、結(jié)構(gòu)、豐度的研究,可明確冠心病患者腸道菌群是否發(fā)生了改變。設想以研究所得冠心病患者腸道菌群豐度、分布作為對照,與入院病人腸道菌群對比,相似性較高者,可提示其患冠心病風險較高,可為下一步以腸道微生物作為生物標記物,并且為進一步治療提供理論依據(jù),對臨床應用提供參考。方法:根據(jù)2016年WHO的診斷標準納入云南地區(qū)67名急性心肌梗死患者、91名冠心病不穩(wěn)定型心絞痛患者、47名冠心病穩(wěn)定型心絞痛患者、37名冠脈粥樣硬化患者、64名冠脈無異常者,提取糞便DNA,采用菌屬16sr RNA v3、v4序列特異性引物,進行實時熒光定量PCR,進行Illumina測序,對五組各目標的菌屬多樣性、結(jié)構(gòu)、豐度進行對比。結(jié)果:腸道菌群比較1、五組人群細菌分類的比較五組的有效序列數(shù)沒有顯著差異。五組分別在門、綱、目、科、屬物種分類上沒有顯著差異。2、五組人群各自菌屬所占總細菌的比例厚壁菌門在五組中閱讀豐度最高,擬桿菌門閱讀豐度第二高。與對照組(D組)相比,急性心;颊(A組)的梭桿菌增多。冠心病不穩(wěn)定心絞痛患者(B組)的擬桿菌減少,變形桿菌、放線菌增多。冠心病穩(wěn)定心絞痛患者(C組)的擬桿菌減少,變形桿菌、梭桿菌增多。冠脈粥樣硬化患者(E組)變形桿菌增多。結(jié)論:急性心肌梗死組、冠心病不穩(wěn)定型心絞痛組、冠心病穩(wěn)定型心絞痛組、冠脈粥樣硬化組與對照組腸道菌群的多樣性、結(jié)構(gòu)以及豐度不同。急性心肌梗死患者、冠心病不穩(wěn)定型心絞痛患者、冠心病穩(wěn)定型心絞痛患者、冠狀動脈粥樣硬化患者腸道中存在不同程度的菌群失調(diào)。
【圖文】:
6 PCR 產(chǎn)物定量和均一化文庫質(zhì)檢合格后,使用 Qubit 進行文庫定量,并根據(jù)每個樣品的數(shù)據(jù)量要,,進行相應比例的混合。7 Illumina 測序使用 Illumina HiSeq PE250 進行上機測序。
生物分析流程圖
【學位授予單位】:云南中醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R541.4
本文編號:2645888
【圖文】:
6 PCR 產(chǎn)物定量和均一化文庫質(zhì)檢合格后,使用 Qubit 進行文庫定量,并根據(jù)每個樣品的數(shù)據(jù)量要,,進行相應比例的混合。7 Illumina 測序使用 Illumina HiSeq PE250 進行上機測序。
生物分析流程圖
【學位授予單位】:云南中醫(yī)學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R541.4
【參考文獻】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 黃旭東;鄭曉鵬;鄭趙利;;2型糖尿病患者腸道菌群的研究[J];河北醫(yī)學;2011年08期
本文編號:2645888
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