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毛南族和漢族人群LIPC rs1532085 SNP與血脂水平的關(guān)系

發(fā)布時間:2020-04-26 00:08
【摘要】:背景與目的:心血管疾病(CVD)是死亡率、發(fā)病率、殘疾、功能下降以及醫(yī)療保健成本增加的主要原因。世界上心血管疾病的發(fā)病率增加與血脂異常有關(guān),人們普遍認(rèn)為血脂異常是心血管疾病的一個重要的危險因素,是由遺傳、環(huán)境因素引起的多因素和復(fù)雜疾病,包括脂質(zhì)相關(guān)基因變異和環(huán)境因素及其相互作用。最近,基因組廣泛聯(lián)系研究(GWASs)已確定肝脂酶基因(LIPC)rs1532085的單核苷酸多態(tài)性(SNP)與血清高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)和甘油三酯(TG)水平相關(guān)。LIPC在脂質(zhì)和脂蛋白代謝途徑中起重要作用,但LIPC rs1532085 SNP與血清脂質(zhì)譜的關(guān)聯(lián)以前未在不同的種族/族群中報道過。本研究將廣西毛南族和漢族人群作為研究對象,比較兩民族人群中的LIPC rs1532085 SNP以及一些環(huán)境因素與血脂參數(shù)關(guān)系的差異。方法:本研究對象在先前分層(性別和年齡)隨機(jī)的樣本庫中,隨機(jī)選擇毛南族居民833人和漢族居民801人進(jìn)行研究。其中漢族男性305名(38.07%),女性496名(61.93%);毛南族男性335名(40.22%),女性498名(59.78%)。他們均居住在廣西壯族自治區(qū)河池市環(huán)江毛南族自治縣境內(nèi)。祖宗三代均為毛南族或者漢族。流行病學(xué)調(diào)查采用國際標(biāo)準(zhǔn)化方法,遵循共同議定書。通過標(biāo)準(zhǔn)化問卷收集有關(guān)人口統(tǒng)計學(xué)、社會經(jīng)濟(jì)狀況和生活方式因素的信息。測量了幾個參數(shù),例如血壓、身高、體重、腰圍和計算體重指數(shù)(BMI)。從參與者中抽取空腹靜脈血樣本。將一部分樣品收集到玻璃管中用于測定血清脂質(zhì)水平。另一部分樣品轉(zhuǎn)移到含有抗凝血劑的試管中用于提取脫氧核糖核酸(DNA)。根據(jù)酚-氯仿法從外周血白細(xì)胞中分離樣品的基因組DNA。通過聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)和瓊脂糖凝膠電泳法進(jìn)行LIPC rs1532085 SNP的基因分型。統(tǒng)計分析用統(tǒng)計軟件包SPSS 24.0(SPSS Inc.,Chicago,Illinois)進(jìn)行。結(jié)果:(1)毛南族人群的腰圍、吸煙、收縮壓、舒張壓、脈壓、TG及載脂蛋白(Apo)B水平比漢族人群高(P0.05-0.001),但毛南族人群飲酒的百分比、HDL-C水平和Apo A1/Apo B比值則低于漢族人群(P0.05-0.001)。兩個民族之間的性別比例、年齡結(jié)構(gòu)、身高、體重、BMI、總膽固醇(TC)、低密度脂蛋白膽固醇(LDL-C)和Apo A1水平比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。(2)毛南族和漢族人群的基因型分布遵循哈迪溫-伯格平衡(HWE,P0.05)。漢族人群A和G等位基因頻率分別為46.19%和53.80%,毛南族人群分別為50.66%和49.33%(P0.05)。漢族人群AA、AG和GG基因型頻率分別為22.34%、47.70%和29.96%,毛南族分別為24.96%、51.38%和23.64%(P0.05)。漢族男性和女性之間的基因型和等位基因頻率比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.01),但在毛南族男性和女性之間比較差異則無統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。(3)漢族人群血清TC、TG、LDL-C、Apo A1和Apo B水平在AA與AG/GG基因型之間比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05-0.001),而毛南族人群則沒有。在漢族人群中G等位基因攜帶者(AG/GG基因型)的血清TC、TG、LDL-C、Apo A1和Apo B水平較非G等位基因攜帶者(AA基因型)低。性別亞組分析顯示,漢族女性AG/GG基因型者血清TC、TG、LDL-C和Apo A1水平比AA基因型者低(P0.05-0.001)。(4)多元線性回歸分析顯示,漢族人群血清TC和LDL-C水平與LIPC rs1532085 SNP的基因型呈顯著相關(guān)(均P0.05)。根據(jù)兩種性別分析血脂參數(shù)與基因型的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)漢族女性血清TC、LDL-C和Apo A1與基因型呈顯著相關(guān)(均P0.05)。(5)除此之外,兩民族人群及不同性別亞組的血脂參數(shù)還與多種環(huán)境因素呈顯著相關(guān),如性別、身高、BMI、年齡、體重、飲酒、吸煙、腰圍、收縮壓、舒張壓、脈壓和空腹血糖等(P0.05-0.001)。結(jié)論:本研究表明,在廣西毛南族和漢族人群中,以及男性和女性之間的LIPC rs1532085 SNP和血脂水平的關(guān)系不同。這些結(jié)果表明LIPC rs1532085 SNP與血清脂質(zhì)水平的關(guān)系可能存在種族/民族和/或性別特異性。
【圖文】:

樣本,電泳,產(chǎn)物,片段


2. PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果和限制性核酸內(nèi)切酶基因分型比較2.1 PCR 產(chǎn)物成像PCR擴(kuò)增LIPC rs1532085所在目的基因片段 337bp 熒光條帶,見圖1。圖 1 樣本 DNA PCR 產(chǎn)物電泳, 泳道 M 是 100-600 bp 標(biāo)記;泳道 1-6 為樣本目的基因片段, 小為337 bpFigure 1. Electrophoresis of polymerase chain reaction products of the samples. Lane M is the 100-600bpmarker ladder; Lanes 1-6 are samples, the 337 bp bands are the target genes.

基因分型,基因型


2.2.1 酶切分型原理及成像結(jié)果Bsh1236I 限制性快切酶特異性識別酶切位點(diǎn)(5’-A^CCRC^G-3’)。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物用快切酶(Bsh1236I)切割成不同堿基數(shù)的片段,電泳時形成不同的條帶。根據(jù)條帶數(shù)確定基因型如下。1) AA 基因型(野生型)是酶切位點(diǎn)的純野生型,成像圖為(337-的條帶);2) AG 基因型則是酶切位點(diǎn)與非酶切位點(diǎn)并存的雜合型為(337-,187-和 150-bp 的條帶);3) GG 基因型是缺乏酶切位點(diǎn)的純合子, 成像圖為(187-和 150-bp 的條帶), 如圖 2。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R54

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本文編號:2640852


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