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高血壓患者血漿中circRNAs表達(dá)譜研究

發(fā)布時(shí)間:2019-08-15 16:17
【摘要】:目的:采用環(huán)狀RNA(circRNA)芯片技術(shù)篩選高血壓患者與正常對(duì)照人群血漿中差異表達(dá)的circRNA,分析circRNA表達(dá)譜特征。并應(yīng)用q RT-PCR技術(shù)對(duì)差異表達(dá)的circRNA進(jìn)行驗(yàn)證,最后通過生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)其可能的發(fā)病機(jī)制,為進(jìn)一步探索circRNA作為高血壓診斷的生物標(biāo)志物以及治療靶點(diǎn)奠定基礎(chǔ)。方法:將5例高血壓患者和5例健康對(duì)照者作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象,分別收集各研究對(duì)象的外周靜脈血,分離出血漿后取總RNA,用circRNA芯片技術(shù)檢測(cè)各組circRNAs表達(dá)情況,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,篩選出差異表達(dá)的circRNAs。應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR,對(duì)部分上述差異表達(dá)的circRNAs在49例高血壓患者及49例正常對(duì)照者血漿樣本中進(jìn)行驗(yàn)證,明確其表達(dá)情況。最后我們預(yù)測(cè)了circRNAs相關(guān)的miRNAs和靶基因,通過GO分析和KEGG通路分析明確mRNA富集情況。結(jié)果:circRNA芯片結(jié)果顯示,與健康對(duì)照組相比,高血壓患者血漿中差異表達(dá)的circRNAs有59種,其中表達(dá)上調(diào)的有46種,表達(dá)下調(diào)的13種。應(yīng)用實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證2種表達(dá)上調(diào)的circRNAs(hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139)以及2種表達(dá)下調(diào)的circRNAs(hsa-circ-0005870、hsa-circ-0040809),結(jié)果顯示,hsa-circ-0005870在高血壓組表達(dá)下調(diào),和芯片結(jié)果一致。而hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139及hsa-circ-0040809表達(dá)在兩組之間沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。生物信息學(xué)分析結(jié)果示,與hsa-circ-0005870相結(jié)合的miRNAs有5個(gè),預(yù)測(cè)到849個(gè)靶基因,GO分析結(jié)果示靶基因參與細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)等過程,KEGG通路分析表明靶基因的主要通路包括TGF-β信號(hào)通路等。結(jié)論:獲得了高血壓患者血漿中circRNAs表達(dá)譜特征,并驗(yàn)證了高血壓患者血漿中hsa-circ-0005870表達(dá)下調(diào),生物信息學(xué)分析示hsa-circ-0005870可能通過TGF-β信號(hào)通路調(diào)控高血壓的發(fā)生。本研究為circRNAs作為高血壓的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)奠定了基礎(chǔ),為高血壓發(fā)病機(jī)制的研究供了新方向。
【圖文】:

表達(dá)水平


Hsa-circ-0005870在兩組間的表達(dá)水平(P=0.008)

表達(dá)水平,生物信息學(xué)分析,數(shù)據(jù)庫


圖 2. Hsa-circ-0000437、hsa-circ-0008139 及 hsa-circ-0040809 在兩組間表達(dá)水平3.生物信息學(xué)分析結(jié)果結(jié)合 TargetScan 和 miRanda 數(shù)據(jù)庫,,我們預(yù)測(cè)到 hsa-circ-0005870 具有的
【學(xué)位授予單位】:首都醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R544.1

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本文編號(hào):2527098

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