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基于文獻計量學心肌梗死模型大鼠血清代謝組學的特點

發(fā)布時間:2018-06-08 12:52

  本文選題:心肌梗死 + 代謝組學 ; 參考:《中國組織工程研究》2017年04期


【摘要】:背景:研究證實,代謝組學可以從一個總體輪廓上對大鼠心肌梗死病理代謝產(chǎn)物進行分析,從全面總體的角度對大鼠心肌梗死機制進行觀察。目的:進一步分析大鼠心肌梗死模型血清代謝組生物信息學通路。方法:從中國知網(wǎng)、萬方數(shù)據(jù)庫、維普數(shù)據(jù)庫、Embase、PubM ed數(shù)據(jù)庫中檢索大鼠心肌梗死的實驗研究。對納入研究代謝產(chǎn)物進行匯總。信號通路分析采用KEGG,代謝產(chǎn)物分子注釋、相關(guān)的酶或轉(zhuǎn)運蛋白及其相關(guān)性質(zhì)分析采用HMDB,代謝產(chǎn)物路徑可視化采用metP A網(wǎng)絡(luò)軟件。結(jié)果與結(jié)論:(1)共有10篇文獻納入分析,有26個代謝產(chǎn)物在這些文獻中重復出現(xiàn),主要參與了29條代謝路徑;(2)通過通路拓撲分析選出了5條代謝通路作為大鼠心肌梗死代謝通路,分別是:氨酰tR NA生物合成、甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的生物合成、不飽和脂肪酸的生物合成、苯丙氨酸,酪氨酸和色氨酸生物合成;(3)大鼠心肌梗死代謝組生物信息分析顯示心肌梗死發(fā)病機制涉及到糖類、脂肪、蛋白質(zhì)、RNA等物質(zhì)代謝及其代謝通路。
[Abstract]:Background: studies have confirmed that metabolomics can be used to analyze the pathological metabolites of myocardial infarction in rats from a global profile and to observe the mechanism of myocardial infarction in rats from a comprehensive perspective. Objective: to further analyze the bioinformatics pathway of serum metabolism group in rat myocardial infarction model. Methods: an experimental study of myocardial infarction in rats was carried out from the databases of China Zhiwang, Wanfang, Weipu, Embase and PubMed. The metabolites included in the study were summarized. The signal pathway was analyzed by KEGG, the metabolites were annotated, the related enzymes or transporters and their related properties were analyzed by HMDB.MetP A network software was used to visualize the pathway of metabolites. Results and conclusion A total of 10 articles were included in the analysis. 26 metabolites were repeated in these literatures, mainly involved in 29 metabolic pathways. 5 metabolic pathways were selected as metabolic pathways of myocardial infarction in rats by topological analysis of the pathways. They are: biosynthesis of amino acid tr na, metabolism of glycine, serine and threonine, biosynthesis of valine, leucine and isoleucine, biosynthesis of unsaturated fatty acids, phenylalanine, phenylalanine, Tyrosine and Tryptophan biosynthesis: bioinformatics analysis of metabolic group showed that the pathogenesis of myocardial infarction was related to the metabolism of carbohydrate, fat, protein and RNA and its metabolic pathway.
【作者單位】: 廣西中醫(yī)藥大學研究生院;廣西中醫(yī)藥大學附屬瑞康醫(yī)院心血管內(nèi)科;
【基金】:國家自然科學基金(81360535) 廣西科學研究與技術(shù)開發(fā)計劃項目(桂科攻1598012-55) 廣西壯族自治區(qū)教育廳,廣西高等學校優(yōu)秀中青年骨干教師培養(yǎng)工程資助(桂教人[2013]16號)~~
【分類號】:R542.22

【相似文獻】

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本文編號:1995857


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