本文關鍵詞：基于分子調(diào)控網(wǎng)絡的復雜心臟疾病發(fā)生機制研究

  更多相關文章： 急性心肌梗塞 分子生物特征 差異表達基因 基因調(diào)控網(wǎng)絡 miRNAs

【摘要】：心臟疾病現(xiàn)今已經(jīng)是人類健康的最大敵人之一,而急性心肌梗塞疾病又是一種常見的心血管疾病,它的發(fā)病主要是由于動脈血管阻塞造成心肌細胞缺血壞死,對心臟會帶來永久性損傷,嚴重者甚至會威脅生命。該疾病在臨床上主要表現(xiàn)為胸腔劇烈疼痛,白細胞和血清酶均會升高,心電圖型也會發(fā)生變化。在急性心肌梗塞發(fā)病的過程中,也會引起房顫、心衰等其他心臟并發(fā)癥,嚴重威脅著人們的健康。由于急性心肌梗塞的突發(fā)性、高致死率以及發(fā)病前期癥狀不明顯,給疾病的預防、診斷和治療帶來很大困難。隨著微陣列技術的發(fā)展,人們獲得的微陣列芯片數(shù)據(jù)日益增多,分析和利用生物芯片數(shù)據(jù),可以在分子水平上理解疾病的發(fā)生發(fā)展。對于心肌梗塞疾病來說,利用基因表達譜進行早期診斷可以有效的預防該疾病的誘發(fā),而從基因層面上理解急性心肌梗塞的發(fā)病機制,能夠為治療該疾病提供一種新的思路。本文采用基因微陣列生物信息學分析方法,二次挖掘急性心肌梗塞外周血全基因組數(shù)據(jù),識別急性心機梗塞疾病相關的新生物特征,分析關鍵致病因子,為以后開展研究急性心肌梗塞分子機制提供參考和依據(jù),其主要內(nèi)容如下：(1)識別和分析急性心肌梗塞發(fā)病相關的差異表達基因,主要采用獨立t檢驗方式,提取了79個與急性心肌梗塞相關的差異表達基因；然后利用ROC曲線判斷所選的差異表達基因分類效果,對其可信度評估。(2)本文對上述選出的差異表達基因進行富集分析,提取并分析了與急性心肌梗塞相關的生物信息,發(fā)現(xiàn)了8個生物功能、12個生物過程、7個細胞組成成分及19個相關通道,其中包括已經(jīng)被證實與疾病相關生物信息與通道。然后通過閱讀文獻,查找與急性心肌梗塞相關的miRNAs,利用靶基因預測技術,構建miRNAs參與的基因調(diào)控網(wǎng)絡。通過分析發(fā)現(xiàn)了三個重要的miRNAs,利用GO分析和Pathway分析,觀察重要miRNA分子的生物意義,發(fā)現(xiàn)其主要作用在酶調(diào)節(jié)、蛋白結合,并且在細胞代謝、生理等過程有參與,以及參與了表皮生長因子受體信號轉導通路；又利用相關性模型和貝葉斯理論構建了兩個基因調(diào)控網(wǎng)絡;最后對三個網(wǎng)絡做節(jié)點分析,尋找到了6個重要節(jié)點,并且逐一分析位于重要節(jié)點的基因在疾病發(fā)生和發(fā)展中的功能與作用。
【關鍵詞】：急性心肌梗塞 分子生物特征 差異表達基因 基因調(diào)控網(wǎng)絡 miRNAs
【學位授予單位】：電子科技大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R541
【目錄】：

• 摘要5-6
• ABSTRACT6-10
• 第一章 緒論10-17
• 1.1 課題研究的意義和目的10-12
• 1.2 國內(nèi)外研究現(xiàn)狀12-15
• 1.2.1 急性心肌梗塞的國內(nèi)外現(xiàn)狀12-13
• 1.2.2 基因調(diào)控網(wǎng)絡的發(fā)展現(xiàn)狀13-15
• 1.3 本文的主要內(nèi)容及結構安排15-16
• 1.4 本文的創(chuàng)新點16-17
• 第二章 算法理論基礎及相關知識17-24
• 2.1 理論論述17-21
• 2.1.1 獨立樣本T檢驗與假陽性發(fā)現(xiàn)率17
• 2.1.2 ROC曲線分析17-18
• 2.1.3 貝葉斯網(wǎng)絡構建18-20
• 2.1.4 相關性網(wǎng)絡構建20-21
• 2.2 分析工具介紹21-22
• 2.2.1 富集分析21-22
• 2.2.2 miRNAs關聯(lián)數(shù)據(jù)庫22
• 2.3 本章小結22-24
• 第三章 急性心肌梗塞相關差異表達基因提取與分析24-37
• 3.1 引言24
• 3.2 數(shù)據(jù)介紹24-27
• 3.2.1 基因數(shù)據(jù)介紹24-26
• 3.2.2 miRNAs數(shù)據(jù)選取依據(jù)26-27
• 3.3 差異表達基因提取步驟與結果27-34
• 3.4 ROC曲線分析結果34-36
• 3.5 本章小結36-37
• 第四章 急性心肌梗塞的重要生物信息分析與基因網(wǎng)絡構建37-49
• 4.1 引言37-38
• 4.2 基于基因網(wǎng)絡的急性心肌梗塞相關生物信息分析38-42
• 4.2.1 GO分析38-40
• 4.2.2 信號通路推斷40-42
• 4.3 網(wǎng)絡構建步驟與結果42-47
• 4.3.1 貝葉斯網(wǎng)絡構造節(jié)點連接依據(jù)及網(wǎng)絡構建結果42-43
• 4.3.2 相關性構建節(jié)點連接及網(wǎng)絡構建結果43-44
• 4.3.3 關聯(lián)性miRNAs選取方式及網(wǎng)絡構建分析44-45
• 4.3.4 整體混合網(wǎng)絡構建與關鍵性節(jié)點分析45-47
• 4.4 本章小結47-49
• 第五章 總結和展望49-51
• 5.1 全文總結49-50
• 5.2 后續(xù)工作與展望50-51
• 致謝51-52
• 參考文獻52-55
• 攻讀碩士期間取得的研究成果55

【參考文獻】

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本文編號：1108701