本文關(guān)鍵詞：腸炎和腸炎相關(guān)結(jié)直腸癌miRNA表達(dá)檢測及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：背景與目的:炎癥性腸病(inflammatory bowel diseases,IBD)為一組慢性腸道疾病,包括潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)與克羅恩病(Crohn’s disease,CD)。腸炎相關(guān)性結(jié)直腸癌(colitis-associated colorectal cancers,CAC)是由IBD癌化形成的一種惡性腫瘤。該研究通過檢測UC、CD和CAC組織中相關(guān)微小核糖核酸(mi RNA)的水平,初步探討其作為腸炎癌轉(zhuǎn)化分子標(biāo)志物的可能性,并對(duì)在腸炎和CAC中顯著變化的一組mi RNAs進(jìn)行靶基因歸集和生物信息學(xué)分析,為以mi RNAs為靶點(diǎn)的基因治療提供理論和實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。方法:采用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)技術(shù),檢測13例UC組織、3例CD患者組織、12例CAC組織及8例正常腸組織中16種mi RNAs的表達(dá)。通過生物信息學(xué)對(duì)顯著變化的一組mi RNA進(jìn)行靶基因分析,將文獻(xiàn)中已報(bào)導(dǎo)的所有靶基因進(jìn)行匯總,并利用DAVID數(shù)據(jù)庫對(duì)靶基因進(jìn)行功能富集分析(GO-analysis)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析(KEGG-analysis,BIOCARTA-analysis)。結(jié)果:炎癥相關(guān)mi R-146a和癌癥相關(guān)mi R-27a、mi R-29a、mi R-20a、mi R-21在UC、CD和CAC中的表達(dá)都顯著高于正常結(jié)腸組織,且這一組mi RNA的靶基因都富集在癌癥相關(guān)通路、免疫信號(hào)相關(guān)通路和炎癌轉(zhuǎn)換相關(guān)通路上。結(jié)論:mi R-146a、mi R-27a、mi R-29a、mi R-20a和mi R-21可能是參與腸炎向結(jié)直腸癌轉(zhuǎn)化的一組mi RNA。
【作者單位】： 江南大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤研究所;南京軍區(qū)南京總醫(yī)院檢驗(yàn)科;美世大學(xué)藥學(xué)院制藥科學(xué)系癌癥納米醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 微小核糖核酸 潰瘍性結(jié)腸炎 克羅恩病 腸炎相關(guān)結(jié)直腸癌 實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈反應(yīng) GO分析 KEGG分析 BIOCARTA分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81301784,81272299,81000867)
【分類號(hào)】：R735.34;R574
【正文快照】： 3.美世大學(xué)藥學(xué)院,制藥科學(xué)系,癌癥納米醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室,佐治亞州亞特蘭大30341炎癥性腸病(inflammatory bowel diseases,I B D)為一組慢性腸道疾病,包括潰瘍性結(jié)腸炎(ulcerative colitis,UC)與克羅恩病(Crohn’sdisease,CD)[1-2]。IBD是一類病因不明的腸道慢性非特異性炎癥,其診斷

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