結(jié)直腸癌在全球惡性腫瘤發(fā)病率中排第三名,有至少80%的結(jié)直腸癌由結(jié)腸息肉演變而來(lái)。結(jié)腸鏡是診斷結(jié)腸息肉的金標(biāo)準(zhǔn),但費(fèi)用高,操作繁瑣,患者接受度差,容易延誤診療時(shí)機(jī)。因此,探究簡(jiǎn)便有效的結(jié)腸息肉篩查方法對(duì)結(jié)直腸癌早診早治具有重要意義。新一代測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn),腸道微生態(tài)與人類的健康和疾病息息相關(guān),結(jié)腸腺瘤患者的腸道微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性均發(fā)生改變。本課題首先利用細(xì)菌16s rDNA和真菌ITS2高通量測(cè)序技術(shù),通過(guò)R語(yǔ)言分析方法探討結(jié)腸息肉患者腸道內(nèi)微生物群落結(jié)構(gòu),結(jié)果表明與健康人群對(duì)比,息肉患者腸道微生物群落結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯改變,即細(xì)菌、真菌的菌群多樣性下降,并且在不同分類水平上均發(fā)現(xiàn)了表達(dá)豐度顯著差異的菌落;其次,結(jié)合Lefse分析手段表明,息肉患者具有相對(duì)豐度較高的致病性細(xì)菌(如擬桿菌屬、副桿菌屬、梭桿菌屬等)和機(jī)會(huì)致病性真菌(如念珠菌屬、曲霉菌屬等);此外,進(jìn)一步探究不同病理類型和息肉數(shù)目的患者腸道微生物群落結(jié)構(gòu)的差異,發(fā)現(xiàn)多樣性和豐富度均無(wú)明顯改變;最后,構(gòu)建以上差異菌檢驗(yàn)?zāi)Ｐ?利用ROC曲線分析檢驗(yàn)結(jié)腸息肉的敏感性和特異性,得到曲線下面積達(dá)0.7以上。綜上所述,本課題探討了息肉患者腸道內(nèi)...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖３．１各樣品細(xì)菌群落測(cè)序深度情況

１．２數(shù)據(jù)分析??１．２．１結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組樣品測(cè)序深度分析??本次研宄繪制了結(jié)息肉組和健康對(duì)照組所有樣本的稀釋曲線（圖３．１）。兩組間各樣??本的稀釋曲線在５０００左右時(shí)出現(xiàn)拐點(diǎn)，后隨著測(cè)序深度的增加，曲線趨于平緩，至??２００００左右到達(dá)平臺(tái)期。說(shuō)明各樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)量合....

圖３．２（Ａ）結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組間腸道內(nèi)細(xì)菌群落ＡＮＯＳＩＭ相似性分析；（Ｂ）結(jié)腸息肉??—

品內(nèi)的微生物群落的豐富度（ＡＣＥ指數(shù)、Ｃｈａｏｌ指數(shù)、Ｏｂｓｅｒｖｅｄ?ｓｐｅｃｉｅｓ指數(shù)）、多樣性??（Ｓｈａｎｎｏｎ指數(shù)和Ｓｉｍｐｓｏｎ指數(shù)）以及均勾度（Ｊ指數(shù)），結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組樣品具??體的ｃｔ一多樣性參數(shù)比較見(jiàn)表４，并繪制成圖（圖３．２Ｂ）。結(jié)果顯示，結(jié)腸息肉組和....

圖３．３結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組樣品細(xì)菌群落Ｐ＿多樣性分析

道相關(guān)細(xì)菌群落組成具有顯著的差異性，那么在眾多的菌群種類里面，有哪些是結(jié)腸息??肉組所獨(dú)有的呢？于是，我們利用已獲得的兩組各樣品的ＯＴＵ數(shù)目進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，粗略比較??兩組間ＯＴＵ分布情況，以此反映兩組樣品間ＯＴＵ組成情況（圖３．４Ｂ）。從兩組間的??ＯＴＵ分布Ｖｅｎｎ圖可知，腸道相關(guān)....

圖３．４（Ａ）結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組樣品細(xì)菌群落ＮＭＤＳ分析；（Ｂ）結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照??

基于以上的分析結(jié)果，我們進(jìn)一步探究結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組間的細(xì)菌群落分布??情況。首先，我們對(duì)結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照組所有樣品數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)菌群落門水平構(gòu)成情??況分析。如圖３．５所示，結(jié)腸息肉組和健康對(duì)照間每個(gè)樣品的腸道糞便相關(guān)細(xì)菌群落組成??結(jié)構(gòu)是不同的�？傮w看來(lái)，結(jié)腸息肉組的厚壁....

本文編號(hào)：4006697