目的：運用基因芯片及生物信息學(xué)技術(shù),研究刀豆蛋白A(ConA)誘導(dǎo)的小鼠暴發(fā)型肝炎(暴肝)在病情發(fā)展早期的內(nèi)在分子機制,尋找主導(dǎo)其進展的關(guān)鍵生物學(xué)過程或通路,同時探索MicroRNA (miRNA)在該過程中的調(diào)控作用,為臨床對暴肝的診治探索可供借鑒的思路。 方法：將12只Bald/C小鼠分為4組,一組在注射磷酸緩沖液(PBS)后立即處死作為0h對照組,而另外三組分別于ConA注射后1 h,3 h和6 h處死。取肝組織行表達譜和miRNA芯片實驗。對芯片實驗數(shù)據(jù)在歸一化處理(normalization)后通過顯著性檢驗對相鄰實驗組進行兩兩比較,得到差異表達基因/miRNA列表。通過查詢數(shù)據(jù)庫得到miRNA的靶基因信息。通過富集分析(enrichment analysis)找出差異表達的基因所顯著富集的功能類別,特別是通路信息。以卡方檢驗對差異表達miRNA的靶基因與實際差異表達基因的重合度進行檢驗。 結(jié)果：在0-1 h、1-3 h和3-6 h三個時間段,依次發(fā)現(xiàn)393、8354和11344個差異表達基因。并且在前兩個時間段,大多數(shù)為差異表達基因所富集的通路直接與免疫和炎癥反應(yīng)相關(guān)。其中...

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【學(xué)位級別】：博士

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圖2.1實驗總體技術(shù)路線圖

對每一個被檢測為差異表達的miRNA，我們都其靶基因同各階段差異表達基因一一進行上述富集測試，最后以卡方值之和排序。方法學(xué)部分總體技術(shù)路線如圖2.1所示:圖2.1實驗總體技術(shù)路線圖

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