本文從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)GSE10140-10141的225個(gè)肝癌組織高顯著性表達(dá)分子中分別篩選出甲狀旁腺激素(PTHLH)的四個(gè)單分子網(wǎng)絡(luò)即低表達(dá)感染HBV或HCV的非腫瘤肝炎及肝硬化組織激活與抑制網(wǎng)絡(luò),高表達(dá)肝癌組織的激活與抑制網(wǎng)絡(luò)。建立四個(gè)分子網(wǎng)絡(luò)的GO數(shù)據(jù)庫(kù),分別從整體上比較非腫瘤肝炎及肝硬化組織與肝癌各激活組和抑制組分子網(wǎng)絡(luò)GO生物過(guò)程的差異。進(jìn)一步計(jì)算四個(gè)網(wǎng)絡(luò)各自的上、下游或反饋生物過(guò)程,上下游反饋整合分析各激活組和抑制組分子網(wǎng)絡(luò)整體比較后的GO生物過(guò)程,確定各功能及其特殊機(jī)制并提出假說(shuō),驗(yàn)證假說(shuō)通過(guò)相應(yīng)的其他生物過(guò)程或重復(fù)出現(xiàn)的次數(shù)(倍數(shù)≥2)或其上下游、反饋網(wǎng)絡(luò)。利用GRNInfer和自編程序構(gòu)建各功能和機(jī)制的新分子網(wǎng)絡(luò),為肝癌組織的診斷和治療研究奠定基礎(chǔ)。 本博士論文研究課題受到國(guó)家自然基金項(xiàng)目(NO.60871100)資助,部分科研成果在包括Integrative Biology, Cell Biochemistry and Biophysics, Immunologic Research, Journal of Cellular Biochemistry, Cellul...

【文章頁(yè)數(shù)】：140 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第—章 緒論
    1.1 本文的研究意義
    1.2 甲狀旁腺激素(PTHLH)簡(jiǎn)介
    1.3 PTHLH的國(guó)內(nèi)外研究現(xiàn)狀及發(fā)展動(dòng)態(tài)分析
    1.4 本文研究方法概述
        1.4.1 數(shù)據(jù)來(lái)源與研究思路
        1.4.2 PTHLH研究方法
            1.4.2.1 建立PTHLH的四個(gè)分子網(wǎng)絡(luò)
            1.4.2.2 建立并分析PTHLH四個(gè)網(wǎng)絡(luò)中分子GO數(shù)據(jù)庫(kù)
    1.5 本文的研究?jī)?nèi)容與創(chuàng)新點(diǎn)
第二章 激活的PTHLH在非腫瘤肝炎及肝硬化組織上下游反饋整合比較肝癌相同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    2.1 激活的PTHLH反饋的有絲分裂與下游的DNA復(fù)制誘導(dǎo)緩慢增長(zhǎng)細(xì)胞數(shù)目網(wǎng)絡(luò)
        2.1.1 結(jié)果
        2.1.2 討論
    2.2 激活的PTHLH偶聯(lián)下游的腺苷酸環(huán)化酶到雄激素受體信號(hào)誘導(dǎo)細(xì)胞間粘附網(wǎng)絡(luò)
        2.2.1 結(jié)果
        2.2.2 討論
    2.3 激活的PTHLH耦合反饋的磷酸肌醇到G蛋白受體信號(hào)誘導(dǎo)細(xì)胞分化網(wǎng)絡(luò)
        2.3.1 結(jié)果
        2.3.2 討論
    2.4 激活的PTHLH耦合下游的正調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)泛素化到復(fù)制后修復(fù)誘導(dǎo)上皮細(xì)胞分化網(wǎng)絡(luò)
        2.4.1 結(jié)果
        2.4.2 討論
    2.5 激活的PTHLH耦合下游的負(fù)調(diào)節(jié)Wnt受體信號(hào)到脂肪酸合成誘導(dǎo)調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        2.5.1 結(jié)果
        2.5.2 討論
    2.6 本章小結(jié)
第三章 激活的PTHLH在肝癌組織上下游反饋整合比較非腫瘤肝炎及肝硬化相同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    3.1 激活的PTHLH反饋的有絲分裂和DNA復(fù)制誘導(dǎo)快速增長(zhǎng)細(xì)胞數(shù)目網(wǎng)絡(luò)
        3.1.1 結(jié)果
        3.1.2 討論
    3.2 激活的PTHLH上游的白細(xì)胞遷移介導(dǎo)的雄激素受體信號(hào)誘導(dǎo)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)網(wǎng)絡(luò)
        3.2.1 結(jié)果
        3.2.2 討論
    3.3 激活的PTHLH耦合下游的腺苷酸環(huán)化酶到正調(diào)節(jié)IκB激酶/NFκB級(jí)聯(lián)反應(yīng)誘導(dǎo)趨化性網(wǎng)絡(luò)
        3.3.1 結(jié)果
        3.3.2 討論
    3.4 激活的PTHLH耦合反饋的磷酸肌醇到G蛋白受體信號(hào)誘導(dǎo)細(xì)胞粘附網(wǎng)絡(luò)
        3.4.1 結(jié)果
        3.4.2 討論
    3.5 激活的PTHLH上游的DNA損傷應(yīng)答介導(dǎo)的正調(diào)節(jié)從蛋白質(zhì)泛素化偶聯(lián)復(fù)制后修復(fù)到轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)正調(diào)節(jié)生存基因網(wǎng)絡(luò)
        3.5.1 結(jié)果
        3.5.2 討論
    3.6 激活的PTHLH耦合負(fù)調(diào)節(jié)從上游的脂肪酸合成和Wnt受體信號(hào)到下游的肽酶誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        3.6.1 結(jié)果
        3.6.2 討論
    3.7 本章小結(jié)
第四章 激活的PTHLH在非腫瘤肝炎及肝硬化組織上下游反饋整合比較肝癌不同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    4.1 激活的PTHLH耦合上游的正調(diào)節(jié)表皮生長(zhǎng)因子受體信號(hào)通路到蛋白運(yùn)輸誘導(dǎo)細(xì)胞衰老網(wǎng)絡(luò)
        4.1.1 結(jié)果
        4.1.2 討論
    4.2 激活的PTHLH耦合下游的微管解聚到中間纖維細(xì)胞骨架組裝和合成誘導(dǎo)胞吐網(wǎng)絡(luò)
        4.2.1 結(jié)果
        4.2.2 討論
    4.3 本章小結(jié)
第五章 激活的PTHLH在肝癌組織上下游反饋整合比較非腫瘤肝炎及肝硬化不同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    5.1 激活的PTHLH上游的藥物應(yīng)答介導(dǎo)的蛋白質(zhì)異戊二烯化和分泌偶聯(lián)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子β和環(huán)-磷酸鳥(niǎo)嘌呤信號(hào)到DNA代謝誘導(dǎo)正調(diào)節(jié)微管聚合網(wǎng)絡(luò)
        5.1.1 結(jié)果
        5.1.2 討論
    5.2 激活的PTHLH下游的中性粒細(xì)胞免疫介導(dǎo)的MAPK,磷脂酶A2和NFκB活化偶聯(lián)鉀離子運(yùn)輸?shù)街|(zhì)代謝到肌動(dòng)蛋白絲組裝誘導(dǎo)調(diào)節(jié)血管新生網(wǎng)絡(luò)
        5.2.1 結(jié)果
        5.2.2 討論
    5.3 激活的PTHLH耦合反饋的微管細(xì)胞骨架組織到核酸代謝誘導(dǎo)調(diào)節(jié)細(xì)胞生長(zhǎng)網(wǎng)絡(luò)
        5.3.1 結(jié)果
        5.3.2 討論
    5.4 激活的PTHLH下游的正調(diào)節(jié)免疫球蛋白和自然殺傷、肥大、T細(xì)胞毒介導(dǎo)的Rho信號(hào)耦合鈣離子運(yùn)輸誘導(dǎo)正調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        5.4.1 結(jié)果
        5.4.2 討論
    5.5 激活的PTHLH耦合上游的負(fù)調(diào)節(jié)caspase,微管解聚和轉(zhuǎn)錄誘導(dǎo)抗細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        5.5.1 結(jié)果
        5.5.2 討論
    5.6 本章小結(jié)
第六章 抑制的PTHLH在非腫瘤肝炎及肝硬化組織上下游反饋整合比較肝癌不同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    6.1 抑制的PTHLH下游的白細(xì)胞粘附介導(dǎo)的蛋白氨基酸N-連接糖基化偶聯(lián)Notch和JAK-STAT級(jí)聯(lián)信號(hào)到鐵硫簇裝配誘導(dǎo)衰老網(wǎng)絡(luò)
        6.1.1 結(jié)果
        6.1.2 討論
    6.2 抑制的PTHLH下游的應(yīng)激反應(yīng)介導(dǎo)的調(diào)節(jié)胰島素分泌到液體表面張力誘導(dǎo)調(diào)節(jié)細(xì)胞間粘附網(wǎng)絡(luò)
        6.2.1 結(jié)果
        6.2.2 討論
    6.3 抑制的PTHLH耦合下游的負(fù)調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附,有絲分裂細(xì)胞周期間的泛素連接酶和內(nèi)皮細(xì)胞分化誘導(dǎo)抗細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        6.3.1 結(jié)果
        6.3.2 討論
    6.4 本章小結(jié)
第七章 抑制的PTHLH在肝癌組織上下游反饋整合比較非腫瘤肝炎及肝硬化不同的分子網(wǎng)絡(luò)及分析
    7.1 抑制的PTHLH上游的T細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞因子,代謝能谷氨酸受體和NFKB啟動(dòng)激酶信號(hào)偶聯(lián)硫酸角質(zhì)素和多糖代謝到中間纖維細(xì)胞骨架組裝誘導(dǎo)細(xì)胞成熟網(wǎng)絡(luò)
        7.1.1 結(jié)果
        7.1.2 討論
    7.2 抑制的PTHLH下游的胰島素刺激介導(dǎo)的葡萄糖輸入耦聯(lián)T細(xì)胞穩(wěn)態(tài)到胞吞誘導(dǎo)生長(zhǎng)網(wǎng)絡(luò)
        7.2.1 結(jié)果
        7.2.2 討論
    7.3 抑制的PTHLH耦合反饋的微管解聚到膠原原纖維組織誘導(dǎo)細(xì)胞-基質(zhì)粘附網(wǎng)絡(luò)
        7.3.1 結(jié)果
        7.3.2 討論
    7.4 抑制的PTHLH耦合下游的正調(diào)節(jié)表皮生長(zhǎng)因子受體,成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子受體,MAPKKK級(jí)聯(lián),Notch,smoothened和IκB激酶/NFκB級(jí)聯(lián)信號(hào)到類固醇合成誘導(dǎo)調(diào)節(jié)生長(zhǎng)網(wǎng)絡(luò)
        7.4.1 結(jié)果
        7.4.2 討論
    7.5 抑制的PTHLH耦合下游的負(fù)調(diào)節(jié)表皮生長(zhǎng)因子受體,脂蛋白脂酶,MAPK,Ras信號(hào)和姐妹染色單體凝集誘導(dǎo)啟動(dòng)細(xì)胞凋亡網(wǎng)絡(luò)
        7.5.1 結(jié)果
        7.5.2 討論
    7.6 本章小結(jié)
第八章 總結(jié)與展望
    8.1 總結(jié)
    8.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間論文發(fā)表情況



本文編號(hào)：3845158