目的:在中國人群中探討Holliday交叉識別蛋白(Holliday Junction Recognition Protein,HJURP)基因單核苷酸多態(tài)性位點(Single nucleotide polymorphism,SNP)與乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)相關(guān)的肝細胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)易感性的關(guān)系,進一步闡述影響肝癌發(fā)生的生物學(xué)機制。 方法:本研究采用候選基因的關(guān)聯(lián)研究策略,涉及兩個病例對照人群(廣西肝癌病例-對照人群和江蘇肝癌病例-對照人群,總共包括448個病例和462個對照)。應(yīng)用酚氯仿法從5 ml EDTA抗凝的外周血中提取DNA。利用GenomeLab SNPstream分型平臺結(jié)合Taqman基因分型方法對HJURP基因的24個標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性位點進行基因分型;通過RT-PCR半定量實驗和免疫組化實驗研究關(guān)聯(lián)位點rs3771333基因型與HJURP基因表達差異的相關(guān)性。利用SNPStats (http://bioinfo.iconcologia.net/snpstats/start.htm)和SPSS (version 13.0, Chicago, Illinois)軟件,對每個SNP位點的基因型和單體型進行l(wèi)ogistic回歸分析,采用Bonferroni法進行多重檢驗校正。以比值比(odds ratios, ORs)及其95%可信區(qū)限(confidence intervals, CIs)表示相對風(fēng)險度。遺傳易感性分析校正性別、年齡、吸煙、飲酒、家族史等影響因素。比較rs3771333位點基因型與HJURP mRNA表達量的差異用Mann-Whitney U-檢驗。比較癌組織和癌旁組織HJURP表達水平差異用Wilcox秩和檢驗;比較rs3771333位點基因型與HJURP蛋白表達水平的差異用Mann-Whitney U-檢驗。 結(jié)果:本研究發(fā)現(xiàn)rs3771333與HBV相關(guān)HCC易感性有顯著性關(guān)聯(lián),相對于A/A基因型,A/C和C/C基因型是風(fēng)險基因型。在合并人群中的OR值為1.82 (95%可信區(qū)間, 1.33-2.49; P = 0.00019);攜帶rs3771333位點風(fēng)險C等位的HJURP表達量顯著低于A/A基因型攜帶者(P = 0.0078和0.0077,分別為mRNA水平和蛋白水平)。 結(jié)論:本項研究首次揭示了在中國人群中HJURP基因多態(tài)性與HBV相關(guān)HCC易感性之間具有遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)。對于HJRUP-rs3771333位點,相對于A/A基因型,A/C和C/C基因型是風(fēng)險基因型。同時,通過RT-PCR半定量實驗和免疫組化實驗證實了rs3771333與HJURP基因的mRNA和蛋白表達水平相關(guān),從而影響HBV相關(guān)HCC的遺傳易感性?傊,我們的研究結(jié)果提示,HJURP基因是中國人群HBV相關(guān)HCC的易感基因,HJURP基因的SNP位點rs3771333在此易感性中發(fā)揮重要的作用。
【學(xué)位單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2011
【中圖分類】:R512.62;R735.7
【部分圖文】:
X/X基因型質(zhì)控圖

X/Y基因型質(zhì)控圖

Y/Y基因型質(zhì)控圖
【參考文獻】
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本文編號:
2892153
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