我國乙型肝炎病毒基因型別地區(qū)分布和變異研究
發(fā)布時(shí)間:2020-10-12 07:40
乙型肝炎是我國乃至全球嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題之一。世界衛(wèi)生組織報(bào)告,全球有20億人感染過乙型肝炎病毒(HBV),慢性(終生)HBV感染者超過3.5億。在全球范圍內(nèi)HBV基因型別分布存在地區(qū)差異,基因型別與疾病預(yù)防控制,病情預(yù)后以及抗病毒治療存在密切關(guān)系,同時(shí)基因變異與免疫預(yù)防接種和病情進(jìn)展也有密切聯(lián)系。因此進(jìn)行我國乙型肝炎病毒基因分型與突變特征的研究對(duì)于了解現(xiàn)今我國乙型肝炎病毒的基本情況,制定相應(yīng)的乙型肝炎預(yù)防控制策略和指導(dǎo)臨床治療提供了一定的參考依據(jù)。 本研究首先對(duì)采集于12個(gè)地區(qū)的HBV血清學(xué)樣品進(jìn)行感染指標(biāo)檢測(cè),隨機(jī)選擇其中表面抗原陽性的部分血清,擴(kuò)增S區(qū)段并進(jìn)行序列測(cè)定,通過將其與標(biāo)準(zhǔn)基因型別序列進(jìn)行進(jìn)化分析,確定HBV的基因型別和亞型以并通過基因序列推測(cè)血清型別,分析其分布特點(diǎn)。并對(duì)部分序列進(jìn)行C區(qū)段的序列測(cè)定,篩選分型不一致序列,并挑選特殊型別的病毒進(jìn)行全基因序列的克隆測(cè)定。為了了解HBV進(jìn)化趨勢(shì)和免疫接種對(duì)其序列變異影響,分別將1992年和2005年的來源于河北、河南、湖南和廣西地區(qū)的低年齡和成年表面抗原陽性人群的HBV基因序列進(jìn)行擴(kuò)增測(cè)定。分別對(duì)1992年和2005年的低年齡人群感染的HBV基因序列中a抗原決定簇和整個(gè)大S基因變異進(jìn)行比較,并分別對(duì)1992年和2005年的成年人群感染的HBV基因序列中a抗原決定簇變異情況進(jìn)行比較。最后選擇河南和黑龍江兩地對(duì)HBV的C基因序列區(qū)段中CP和BCP常見突變進(jìn)行描述和分析。 本研究的最終結(jié)果顯示,有913例S區(qū)序列被成功測(cè)序,進(jìn)行進(jìn)化分析后發(fā)現(xiàn),所測(cè)基因型別涉及到A~D四種型別,其中B和C型為主要型別,地區(qū)分布特點(diǎn)為:北方地區(qū)以C型為主,南方以B型為主,而D型主要分布在西部。在B型中B2亞型占優(yōu)勢(shì),在C型中C1和C2亞型占優(yōu)勢(shì),C3和C5在廣西也有發(fā)現(xiàn)。所測(cè)血清型別涉及ayr、ayw、adr和adw四種血清型別,其中adr和adw為主要血清型,病毒基因型與血清型有相關(guān)關(guān)系,C型與adr,B型和A型與adw,D型與ayw間有相關(guān)關(guān)系。C型基因感染個(gè)體中HbeAg陽性率有高于B型者的趨勢(shì),各地人群中a抗原決定簇分布沒有規(guī)律,各地平均a抗原決定簇的變異率為12.36%。在河南和黑龍江地區(qū)2~3%的序列為B型和C型分型差異的序列,而廣西地區(qū)首次在我國發(fā)現(xiàn)C/A重組的特殊型基因,并成功進(jìn)行了全基因的序列測(cè)定,并對(duì)湖南省的一例B型基因進(jìn)行了全基因克隆。 在基因變異研究方面,2005年低年齡組人群中a抗原決定簇的變異序列與所測(cè)序列百分比為14.93%高于1992年低年齡組的5.8%,特別是在S抗原第145位氨基酸發(fā)生的變異序列與所測(cè)序列的百分比,2005年組為5.82%遠(yuǎn)較1992年組0.72%為高。而從成年人群看,1992年組中a抗原決定簇變異序列與所測(cè)序列百分比為9.89%,2005年組變異率為9.43%,1992年與2005年相比變化沒有差別,在對(duì)比2005年與1992年低年齡人群大S基因的氨基酸變異時(shí)發(fā)現(xiàn),在S抗原區(qū)段內(nèi),單基因序列的氨基酸突變率為0.62次/序列,大于1992年的0.38次/序列。HBV的C基因區(qū)段變異常見的A1762T/G1764A雙位點(diǎn)變異和G1896A變異在河南地區(qū)的發(fā)生率為(59.49%),黑龍江地區(qū)為(30.21%),C型基因病毒的發(fā)生率高于B型。 通過對(duì)我國不同地區(qū)的HBV基因序列的分析,和對(duì)1992年與2005年基因序列變異的對(duì)比,我們?cè)谝欢ǔ潭壬狭私饬宋覈鳫BV基因分布的特點(diǎn)和序列特點(diǎn),了解了HBV基因變異的規(guī)律和特點(diǎn),為我國乙型肝炎的疾病預(yù)防控制和治療檢測(cè)提供了參考。
【學(xué)位單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2008
【中圖分類】:R512.6
【文章目錄】:
英文縮略語
中文摘要
英文摘要
前言
第一章 我國乙型肝炎病毒基因型地區(qū)分布
第一節(jié) 中國乙型肝炎病毒的基因分型
第二節(jié) 我國HBV基因重組篩選及全基因序列分析
討論
第二章 我國乙型肝炎病毒基因變異研究
第一節(jié) 大S基因變異速率估算
第二節(jié) 1992年與2005年低年齡人群大S基因變異比較
第三節(jié) 1992年與2005年成年人群大S基因變異比較
第四節(jié) HBV C區(qū)段變異情況分析
討論
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
綜述 乙型肝炎病毒的基因分型與變異研究
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷
致謝
【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2837851
【學(xué)位單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2008
【中圖分類】:R512.6
【文章目錄】:
英文縮略語
中文摘要
英文摘要
前言
第一章 我國乙型肝炎病毒基因型地區(qū)分布
第一節(jié) 中國乙型肝炎病毒的基因分型
第二節(jié) 我國HBV基因重組篩選及全基因序列分析
討論
第二章 我國乙型肝炎病毒基因變異研究
第一節(jié) 大S基因變異速率估算
第二節(jié) 1992年與2005年低年齡人群大S基因變異比較
第三節(jié) 1992年與2005年成年人群大S基因變異比較
第四節(jié) HBV C區(qū)段變異情況分析
討論
總結(jié)
參考文獻(xiàn)
綜述 乙型肝炎病毒的基因分型與變異研究
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷
致謝
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本文編號(hào):2837851
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