異常能量代謝狀態(tài)下小鼠肝臟microRNA的差異表達
發(fā)布時間:2020-09-17 14:50
背景/目的:MicroRNA(miRNA)是一類新近發(fā)現(xiàn)的內(nèi)源性非編碼小RNA分子,在器官發(fā)育與分化、細胞增殖與凋亡、腫瘤形成、免疫反應(yīng)等病理生理過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。已有的研究表明,miRNA也參與了機體能量代謝平衡的調(diào)節(jié),但miRNA與肝臟能量代謝相關(guān)的研究還很少。盡管“二次打擊”學說等病理生理學機制可以部分解釋非酒精性肝臟脂肪變性和脂肪性肝炎中肝臟損害逐漸進展的過程,但非酒精性脂肪性肝病發(fā)病和進展的很多具體機制尚不清楚。為了探索miRNA在非酒精性脂肪性肝病等肝臟異常代謝狀態(tài)下的調(diào)控作用,本研究對非酒精性脂肪性肝病和1型糖尿病模型小鼠肝臟的miRNA表達譜進行了分析研究。 方法:采用miRNA芯片對10只非酒精性脂肪性肝病模型ob/ob小鼠,8只鏈脲霉素造模的1型糖尿病模型小鼠,以及8只正常對照C57BL/6小鼠的肝臟miRNA表達譜進行檢測,并用微陣列顯著性分析和聚類分析軟件對芯片結(jié)果進行統(tǒng)計分析。miRNA芯片結(jié)果采用實時定量RT-PCR進行驗證。本研究中發(fā)現(xiàn)的差異表達miRNA應(yīng)用生物信息學miRNA靶基因預(yù)測算法軟件進行靶基因預(yù)測分析。 結(jié)果:與正常對照小鼠相比,ob/ob小鼠發(fā)生脂肪變的肝臟miRNA中8個miRNA(miR-34a,miR-31,miR-103,miR-107,miR-194,miR-335-5p,miR-221,miR-200a)發(fā)生了顯著上調(diào),4個miRNA(miR-29c,miR-451,miR-2 1,miR-1 22)發(fā)生了顯著下調(diào);鏈脲霉素造模的1型糖尿病小鼠肝臟miRNA中,miR-34a發(fā)生了顯著上調(diào),miR-122發(fā)生了顯著下調(diào)。比較ob/ob小鼠和鏈脲霉素造模的糖尿病小鼠肝臟miRNA表達譜,發(fā)現(xiàn)ob/ob小鼠肝組織中4個miRNA(miR-103,miR-31,miR-107,miR-126-3p)顯著上調(diào),2個miRNA(miR-100,miR-29c)顯著下調(diào)。Ob/ob小鼠肝組織具有獨特的miRNA表達譜形式,聚類分析可以將ob/ob小鼠肝臟樣本與正常對照小鼠以及鏈脲霉素造模糖尿病小鼠的肝臟樣本明確地區(qū)分開來。對本研究中發(fā)現(xiàn)差異表達miRNA的靶基因進行生物信息學預(yù)測,獲得了一系列與非酒精性脂肪肝以及肝臟能量代謝相關(guān)的可能靶基因。 結(jié)論:本研究發(fā)現(xiàn)了一系列在非酒精性脂肪性肝病和1型糖尿病這兩種肝臟異常能量代謝狀態(tài)疾病模型中發(fā)生差異表達的miRNA,提示miRNA在肝臟能量代謝過程中發(fā)揮了重要的調(diào)控作用,并可能參與了非酒精性脂肪性肝病的病理生理學過程。擴展了我們對非酒精性脂肪性肝病生物學機制的認識,為今后可能的miRNA靶向治療提供了線索。
【學位單位】:浙江大學
【學位級別】:博士
【學位年份】:2009
【中圖分類】:R575
【部分圖文】:
/ob組與正常對照(C57BL/6)組小鼠肝臟miRNA芯片結(jié)果聚類分樣本,正常對照組8只小鼠樣本。兩組間差異最大的60個miRN級聚類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹將ob八)b組與正常對照組明確地區(qū)分信號強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化.色彩表示每個miRNA表達水平中表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色表示高于均數(shù),綠色表表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;互微陣列顯著性分析或?qū)崟r定著性變化的m1RNA。
脈霉素(STz)組與正常對照(C57BL/6)組小鼠肝臟miRNA素組8只小鼠樣本,正常對照組8只小鼠樣本。兩組間差異最大行二維等級聚類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹沒有將鏈脈霉素組與正以均數(shù)為中心的信號強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化。色彩表該m1RNA在各樣本中表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色于低于均數(shù),黑色表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;勢微陣列Rl;PCR分析中有顯著性變化的miRNA。
ob/ob組與鏈脈霉素(STZ)組小鼠肝臟miRNA芯片結(jié)果聚類分析本,鏈脈霉素組8只小鼠樣本。兩組間差異最大的60個miRNA類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹將ob/ob組與鏈脈霉素組明確地區(qū)分開強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化。色彩表示每個miRNA表達水平表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色表示高于均數(shù),綠色表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;互微陣列顯著性分析或?qū)崟r定量變化的miRNA。
本文編號:2820859
【學位單位】:浙江大學
【學位級別】:博士
【學位年份】:2009
【中圖分類】:R575
【部分圖文】:
/ob組與正常對照(C57BL/6)組小鼠肝臟miRNA芯片結(jié)果聚類分樣本,正常對照組8只小鼠樣本。兩組間差異最大的60個miRN級聚類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹將ob八)b組與正常對照組明確地區(qū)分信號強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化.色彩表示每個miRNA表達水平中表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色表示高于均數(shù),綠色表表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;互微陣列顯著性分析或?qū)崟r定著性變化的m1RNA。
脈霉素(STz)組與正常對照(C57BL/6)組小鼠肝臟miRNA素組8只小鼠樣本,正常對照組8只小鼠樣本。兩組間差異最大行二維等級聚類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹沒有將鏈脈霉素組與正以均數(shù)為中心的信號強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化。色彩表該m1RNA在各樣本中表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色于低于均數(shù),黑色表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;勢微陣列Rl;PCR分析中有顯著性變化的miRNA。
ob/ob組與鏈脈霉素(STZ)組小鼠肝臟miRNA芯片結(jié)果聚類分析本,鏈脈霉素組8只小鼠樣本。兩組間差異最大的60個miRNA類?梢钥吹綐颖鞠到y(tǒng)樹將ob/ob組與鏈脈霉素組明確地區(qū)分開強度均進行2為底數(shù)的109轉(zhuǎn)化。色彩表示每個miRNA表達水平表達水平均數(shù)相比的相對表達水平(紅色表示高于均數(shù),綠色表示接近均數(shù))。m,雄性;f,雌性;互微陣列顯著性分析或?qū)崟r定量變化的miRNA。
【引證文獻】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 秦曉玉;苗向陽;董曉;汪文鑫;;脂肪細胞中微RNA的研究進展[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2013年01期
本文編號:2820859
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/xiaohjib/2820859.html
最近更新
教材專著