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白介素-6基因多態(tài)性與HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌遺傳易感性研究

發(fā)布時間:2020-08-11 21:42
【摘要】:目的:研究白細(xì)胞介素-6(interleukin-6,IL-6)基因啟動區(qū)三個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點(diǎn)rs1800795、rs1800796、rs1800797在廣西地區(qū)人群的分布;分析rs1800795、rs1800796、rs1800797基因多態(tài)性與HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化及肝癌遺傳易感性的聯(lián)系。通過此項(xiàng)研究,探索在廣西地區(qū)人群IL-6基因多態(tài)性的分布規(guī)律;IL-6基因多態(tài)性與HBV背景下慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌遺傳易感性的關(guān)系。獲得具有重要意義的與HBV背景下肝臟疾病易感性相關(guān)的SNP和(或)單倍型,為HBV背景下肝臟疾病的人群預(yù)防和治療提供新的遺傳標(biāo)記和生物靶標(biāo)。方法:采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)和DNA測序法,分別對來自廣西地區(qū)192例健康體檢者(對照組),185例慢性乙型肝炎患者(CHB組)、92例肝硬化患者(LC組)、192例肝細(xì)胞癌患者(HCC組)檢測其IL-6基因啟動區(qū)三個SNP位點(diǎn)rs1800795、rs1800796和rs1800797在各組研究對象的基因頻率,并同時采用SHEsis軟件構(gòu)建IL-6基因啟動區(qū)三個SNP位點(diǎn)的單倍型;采用羅氏Cobas · e601檢測各組對應(yīng)的血清IL-6水平。統(tǒng)計(jì)分析IL-6基因啟動區(qū)rs1800795、rs1800796和rs1800797三個SNP位點(diǎn)在廣西地區(qū)人群的分布情況。采用哈-溫平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)檢驗(yàn)各組研究對象是否具有可比性和群體代表性;χ2檢驗(yàn)比較各位點(diǎn)基因型和等位基因在各病例組和對照組的差異;logistic回歸分析校正性別與年齡因素后計(jì)算比值比(Odds ration,OR)和95%可信區(qū)間(Confidence Interval,CI);方差分析比較對照組與各病例組間血清IL-6水平差異;配對t檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析肝癌患者手術(shù)前、后血清IL-6水平差異。上述統(tǒng)計(jì)分析均采用SPSS13.0軟件計(jì)算。結(jié)果:1.經(jīng)HWE統(tǒng)計(jì),對照組與各病例組IL-6基因啟動區(qū)rs1800795、rs1800796和rs1800797三個位點(diǎn)的基因型頻率分布均符合HWE平衡,所納入各組研究對象均具有可比性和群體代表性(P0.05)。2.廣西地區(qū)人群IL-6基因rs1800795、rs1800797位點(diǎn)突變率低,rs1800795僅發(fā)現(xiàn)GG、GC兩種基因型,未發(fā)現(xiàn)CC基因型;rs1800797位點(diǎn)僅發(fā)現(xiàn)GG、GA兩種基因型,未發(fā)現(xiàn)有AA基因型。兩位點(diǎn)三種基因型頻率在對照組和病例組間差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05)。3.廣西地區(qū)人群IL-6基因啟動區(qū)rs1800796可見CC、CG、GG三種基因型,經(jīng)logistic回歸分析校正性別與年齡因素后發(fā)現(xiàn):IL-6 rs1800796可能與HBV背景下CHB、HCC的遺傳易感性有關(guān)。CHB組CG、GG基因型患病風(fēng)險(xiǎn)分別增加至1.5倍(OR=1.526)、3.2倍(OR=3.211),G等位基因的患病風(fēng)險(xiǎn)增加至1.6倍(OR=1.561);肝癌組CG、GG基因型患病風(fēng)險(xiǎn)分別增加至1.8倍(OR=1.854)、4.8倍(OR=4.742),G等位基因的患病風(fēng)險(xiǎn)增加至1.9倍(OR=1.881)。4.按性別因素進(jìn)行分層分析,無論是男性或是女性人群,IL-6基因啟動區(qū)rs1800795和rs1800797位點(diǎn)在各病例組與對照組間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。rs1800796GG突變純合子基因型在男性CHB和HCC中患病風(fēng)險(xiǎn)增高,rs1800796CG雜合子在女性CHB中患病風(fēng)險(xiǎn)增高,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。5.廣西地區(qū)人群IL-6基因rs1800795、rs1800796、rs1800797基因型和等位基因頻率與東南亞區(qū)域、黃種人群結(jié)果相似(p0.05);而與歐美地區(qū)、白種人群結(jié)果差異較顯著(p0.05)。6.IL-6 基因啟動區(qū) rs1800795、rs1800796、rs1800797 三個 SNP 位點(diǎn)GGG單倍型與廣西地區(qū)人群HBV背景下CHB、HCC的發(fā)生發(fā)展相關(guān),OR值分別約 1.67(OR=1.669)和 1.83(OR=1.827)。.7.各病例組血清IL-6水平較對照組顯著增高(p0.05);在CHB組和HCC組中,rs1800796 CC、CG、GG三種基因型血清IL-6平均濃度比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p0.05),GG基因型血清IL-6濃度顯著高于CC、CG兩種基因型濃度。在肝癌切除手術(shù)后,血清IL-6濃度較手術(shù)前顯著降低(p0.05)。結(jié)論:1.廣西地區(qū)人群IL-6基因啟動區(qū)rs1800795、rs1800796和rs1800797基因型和等位基因頻率與東南亞區(qū)域、黃種人群結(jié)果相似;而與歐美地區(qū)、白種人群基因頻率分布差異較顯著。2.IL-6基因啟動區(qū)rs1800796 GG基因型和G等位基因可能是廣西地區(qū)慢性乙型肝炎、肝癌的危險(xiǎn)因素。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R512.62;R575.2;R735.7
【圖文】:

研究資料,地理分布,全球,病人


圖1邋HBV人群感染流行的全球地理分布逡逑研究資料顯示:鑒于中國主要是以CHB及LC病人居多,中國男齡標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)病率約為40/10萬,女性約僅為14/10萬;而在歐美地肝癌年齡標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)病率為6.2/10萬,女性為1.7/10萬,兩地區(qū)肝男性均明顯高于女性,在肝癌發(fā)病率和致死率方面,中國長期高均水平。此外,肝癌因隱匿發(fā)病、高惡行性和轉(zhuǎn)移率、預(yù)后較差,

示意圖,基因分型,引物設(shè)計(jì),位點(diǎn)


采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性內(nèi)切酶片段長度多態(tài)性技術(shù)(PCR-RFLP)技逡逑術(shù)對IL-6基因啟動區(qū)rs邋1800795、rsl800796和rsl800797三個SNP位點(diǎn)進(jìn)逡逑行基因分型,其技術(shù)路線見圖2所示。逡逑樣本A(r/i)邐樣本i3(m)邐樣本c(\a)逡逑—CXST邋■'逡逑CCTTACC'?—邐ii.i邋GG邋.ADL...邋.逡逑Kpnl_邐Kpn邋丨抽切邐Kpnl_逡逑-CCTA邋"i邋mQG邋ACC邋ii邋GG邋ACC—逡逑CC一邐邐GGTA邐HOT)逡逑CC—逡逑}帟}沐逡逑M邋抒本A作本B邋MC逡逑B逡逑圖2邋PCR-RFLP技術(shù)基因分型示意圖逡逑3.4.2引物設(shè)計(jì)逡逑rsl800795[2Q,211、rsl800796邋C/G[22]和邋rsl800797G/A丨2G]位點(diǎn)擴(kuò)增引物參照逡逑文獻(xiàn)設(shè)計(jì),引物相關(guān)信息見下表4:逡逑18逡逑

電泳圖,位點(diǎn),電泳圖,電泳


結(jié)果逡逑1.PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果逡逑1.1IL-6基因rsl800795位點(diǎn)擴(kuò)X棽鍥緯ざ任保叮保猓穡跡乘盡e義賢跡沖澹潁螅戾澹福埃埃罰梗滴壞憷┰霾锏纈就煎義希ǎ保保壩鏡牢潁簀澹保福埃埃罰梗滴壞憷┰霾錚保庇鏡牢恚幔潁耄澹潁╁義希保插澹桑蹋痘潁潁螅歟福埃埃罰梗段壞憷┰霾鍥緯ざ任保福玻猓穡鸚 4所示。逡逑圖4邋rsl邋800796位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物電泳閣逡逑(6泳道為marker,其余為rsl邋800796位點(diǎn)擴(kuò)增產(chǎn)物)逡逑23逡逑

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前4條

1 何凱亮;李永平;呂勇剛;張丹杰;王輝;;IL-6基因啟動子多態(tài)性與乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性[J];細(xì)胞與分子免疫學(xué)雜志;2011年11期

2 盧曉明;華立新;王進(jìn)峰;;蘇皖地區(qū)漢族人群IL-6-572C>G多態(tài)性與前列腺癌易感性的關(guān)系[J];中華男科學(xué)雜志;2011年08期

3 ;原發(fā)性肝癌的臨床診斷與分期標(biāo)準(zhǔn)[J];肝臟;2004年S1期

4 黃志碧,鄔質(zhì)彬,徐國誠;廣西肝癌高發(fā)區(qū)人群多種肝炎病毒感染的流行病學(xué)研究[J];廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2000年01期



本文編號:2789596

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