基于HCV E2序列保守性評(píng)估及B-cell表位預(yù)測(cè)篩選基因型特異性表位多肽
發(fā)布時(shí)間:2020-08-03 06:39
【摘要】:背景: 丙型肝炎是一種由HCV感染引起的全世界范圍的傳染病。HCV感染慢性化導(dǎo)致患者肝臟纖維化和肝硬化,甚至肝細(xì)胞癌。HCV基因組學(xué),尤其是E2區(qū)域序列的高突變率,使得基因分型越來(lái)越多樣化、HCV及基因分型的檢測(cè)要求越來(lái)越嚴(yán)格,慢性感染者對(duì)常規(guī)抗病毒治療應(yīng)答不佳以及預(yù)防HCV感染的疫苗研制工作舉步維艱;谛蛄械谋J匦栽u(píng)估和表位預(yù)測(cè)合成的表位多肽,由于具有高度的保守性及良好的抗原活性,成為當(dāng)今科學(xué)界研究的熱點(diǎn)。利用該技術(shù)構(gòu)建合成的HCV保守性表位多肽,在HCV感染性疾病的診斷、治療及預(yù)防的探索研究也已得到廣泛開展。 目的: 基于HCV E2區(qū)序列的保守性評(píng)估和B-cell表位預(yù)測(cè)合成表位多肽,分析其與HCV組和對(duì)照組血清結(jié)合性的差異,篩選基因型特異性表位多肽;基于此類表位多肽預(yù)期:建立HCV及基因分型血清學(xué)ELISA檢測(cè)技術(shù);識(shí)別此類表位多肽的特異性抗體通過(guò)抗原抗體結(jié)合,封閉HCV感染人體靶細(xì)胞的位點(diǎn)或滅活病毒,起到有效的抗病毒作用;通過(guò)誘導(dǎo)動(dòng)物產(chǎn)生中和抗體,而成為預(yù)防HCV感染的候選免疫原,為制備新型肽類疫苗提供依據(jù)。 方法: 本研究利用MEGAv5.05軟件,對(duì)NCBI protein數(shù)據(jù)庫(kù)中HCV1a、1b、4d基因型的各40條E2序列進(jìn)行保守性評(píng)估及B-cell表位預(yù)測(cè)和表位設(shè)計(jì),得到此3種基因型特異及共有的保守性B-cell表位序列,化學(xué)合成表位多肽。通過(guò)ELISA實(shí)驗(yàn),測(cè)定4種表位多肽分別與29例HCV感染者及25例非HCV感染者血清結(jié)合的OD450值,使用SPSS v20.0軟件進(jìn)行差異性分析,兩組間比較應(yīng)用t/t’檢驗(yàn)方法(P<0.05),明確HCV感染組與對(duì)照組數(shù)據(jù)差異及統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)果: 實(shí)驗(yàn)合成4條HCV B-cell表位多肽,分別為1a特異性序列DC-13(434-DTGWLAGLFYYHK-446)、1b特異性序列HC-13(434-HTGFLAALFYAKS-446)、4d特異性序列NC-13(434-NTGFLASLFYTHK-446)和共有序列FC-9(447-FNSSGCPER-455)。ELISA實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析顯示:DC-13、NC-13和FC-9與HCV感染組血清結(jié)合OD450值均高于對(duì)照組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;HC-13與HCV-1b感染組血清結(jié)合OD450值高于HCV-2a感染組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,但與HCV-1b感染組和對(duì)照組的血清結(jié)合OD450值差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)論: 實(shí)驗(yàn)合成4條HCV B-cell表位多肽,即1a、1b、4d型特異性表位多肽及共有表位多肽;其中,1a、4d型特異性表位多肽及共有表位多肽與HCV感染者血清結(jié)合性均高于非HCV感染者,1b型特異性表位多肽與HCV1b感染者血清結(jié)合性明顯高于HCV2a感染者。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.63
本文編號(hào):2779255
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R512.63
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1 祁凌霞;基于HCV E2序列保守性評(píng)估及B-cell表位預(yù)測(cè)篩選基因型特異性表位多肽[D];吉林大學(xué);2015年
本文編號(hào):2779255
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