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雌激素受體基因多態(tài)性與原發(fā)性膽汁性肝硬化的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2020-07-31 17:26
【摘要】: 原發(fā)性膽汁性肝硬化(PBC)病因復(fù)雜,發(fā)病機(jī)制至今未明。目前一致認(rèn)為,PBC的致病因素包括遺傳、環(huán)境、感染等,其中,遺傳因素起決定作用。PBC這一自身免疫性肝病綜合了自身免疫反應(yīng)和膽管上皮細(xì)胞損傷、增生的特點(diǎn)。從流行病學(xué)角度觀察,本病具有明顯的女性性別優(yōu)勢(shì)(男女比例接近1:9),疾病高發(fā)階段(圍絕經(jīng)期)性激素水平的顯著變化則進(jìn)一步提示PBC可能與雌激素相關(guān)。由于本病隱匿遷延,多數(shù)患者確診時(shí)已發(fā)展至肝硬化階段,肝臟對(duì)雌激素的滅活功能障礙,導(dǎo)致無(wú)法僅憑雌激素水平準(zhǔn)確判斷其與疾病的關(guān)聯(lián)度。作為一種類固醇激素,雌激素在體內(nèi)主要通過(guò)雌激素受體(ER)發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),可以經(jīng)由多種途徑影響基因表達(dá)。近年大量研究表明,雌激素受體基因多態(tài)性能夠?qū)е翬R表達(dá)水平、結(jié)構(gòu)和功能改變,進(jìn)而影響雌激素發(fā)揮功能,如調(diào)節(jié)免疫、促進(jìn)增殖、抑制凋亡等等,但其是否與原發(fā)性膽汁性肝硬化的發(fā)生發(fā)展,尤其是是否與中國(guó)人患PBC相關(guān)尚不明確。 本研究旨在初步判斷雌激素受體基因多態(tài)性是否與中國(guó)人患原發(fā)性膽汁性肝硬化有關(guān)聯(lián)。研究方法采用焦磷酸測(cè)序技術(shù)檢測(cè)ESR1、ESR2上共5個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),通過(guò)比較組間基因型及等位基因型分布情況分析其在PBC患者與健康人之間是否存在顯著性差異,并進(jìn)行Logistic回歸分析,判斷等位基因與肝功各指標(biāo)之間的相對(duì)危險(xiǎn)度。結(jié)果初步提示如下: 1、本研究發(fā)現(xiàn)ESR2基因多態(tài)性與原發(fā)性膽汁性肝硬化有關(guān)。 2、ESR2 rs1256030 T等位基因型可能是原發(fā)性膽汁性肝硬化的危險(xiǎn)因素。 3、ESR1 rs2234693與PBC患者肝功膽道酶升高程度有關(guān),其T等位基因可能對(duì)PBC患者肝功能具有保護(hù)作用。 4、ESR1上rs2234693、rs2228480、rs3798577三個(gè)位點(diǎn)構(gòu)成所有單倍型中,TGC基因型是患PBC的潛在因素,TAC基因型可能是PBC的保護(hù)因素,TGT基因型對(duì)PBC患者肝臟功能具有保護(hù)性作用,TAT基因型則是PBC患者肝功能的危險(xiǎn)因素,TAC基因型可能具有加重PBC患者膽汁淤積的功能。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號(hào)】:R575.2
【圖文】:

位點(diǎn),單核苷酸多態(tài)性,標(biāo)簽,人類


3.5.1.1 在ESR1上選出可能與中國(guó)人疾病遺傳易感性相關(guān)的位點(diǎn)在 Pubmed 提供的 dbSNP 中查詢得出人類 ESR1 上共有 3119 個(gè) SNP 位點(diǎn)。根據(jù) Pubmed 已發(fā)表的關(guān)于 ESR1 單核苷酸多態(tài)性與疾病關(guān)聯(lián)性研究的文獻(xiàn),歸納出所有研究關(guān)注的功能 SNP 位點(diǎn)。應(yīng)用 SNPBrowser 軟件按照MAF threshold=5 percent. Pairwise r Squared threshold=80 percent 查詢中國(guó)人ESR1 上的標(biāo)簽 SNP,共有 45 個(gè)。參考既往研究結(jié)果、MAF 值及 SNP 所在位置,確定出 3 個(gè)研究位點(diǎn):rs223469(3T>C,MAF=0.4,Chr P=152163335intron1)、rs2228480(A>G,MAF=0.144,Chr P=152420095,cds-synon)、rs3798577(T>C,MAF=0.40,Chr P=152421130,UTR-3)。

位點(diǎn)


2 位點(diǎn)rs2234693查詢結(jié)果Fig 3.2 rs2234693 inquire result圖3.3 位點(diǎn)rs2228480查詢結(jié)果Fig 3.3 rs2228480 inquire result23

位點(diǎn),單核苷酸多態(tài)性


圖3.4 位點(diǎn)rs3798577查詢結(jié)果Fig 3.4 rs3798577 inquire result3.5.1.2 在ESR2上選出可能與中國(guó)人疾病遺傳易感性相關(guān)的位點(diǎn)在Pubmed提供的dbSNP中查詢得出人類ESR2上共有878個(gè)SNP位點(diǎn)。根據(jù)Pubmed已發(fā)表的關(guān)于ESR2單核苷酸多態(tài)性與疾病關(guān)聯(lián)性研究的文獻(xiàn),歸納出所有研究關(guān)注的功能SNP位點(diǎn)。應(yīng)用SNPBrowser軟件按照MAFthreshold=5 percent. Pairwise r Squared threshold=80 percent查詢中國(guó)人ESR1上的標(biāo)簽SNP,共有12個(gè)。參考既往研究結(jié)果、MAF值及SNP所在位置,確定出2個(gè)研究位點(diǎn):rs1256030(C>T,MAF=0.318,Chr P=64747170,intron)和rs1048315(T>C,MAF=0.375

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9 陳s

本文編號(hào):2776776


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