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肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體的構(gòu)建及應(yīng)用研究

發(fā)布時間:2017-03-27 17:21

  本文關(guān)鍵詞:肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體的構(gòu)建及應(yīng)用研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:作為最早在哲學范圍內(nèi)探討的一個專業(yè)術(shù)語,本體(ontology)為哲學家們用以描述客觀世界內(nèi)一切實際存在的現(xiàn)象、行為及事物的本質(zhì)。隨著計算機科學相關(guān)技術(shù)的發(fā)展,本體對客觀事物本質(zhì)的描述功能逐漸被計算機、人工智能等領(lǐng)域的研究學者所關(guān)注并被逐步引入到相關(guān)領(lǐng)域。在哲學領(lǐng)域本體含義的基礎(chǔ)上,計算機領(lǐng)域的學者對“本體”的定義作了進一步的延伸,將其定義為描述知識的術(shù)語及關(guān)系。在計算機、信息組織等領(lǐng)域,本體的功能是作為一種知識組織體系,本體不僅準確定義并描述了領(lǐng)域知識范圍內(nèi)的重要概念,同時對概念間的語義關(guān)系也進行了準確的定義與描述,從而實現(xiàn)了知識表示與組織的多樣化、語義化。近年來,國內(nèi)外在本體理論與應(yīng)用兩方面的研究都迅速發(fā)展,,無論是理論研究、實證研究,還是技術(shù)手段的實現(xiàn)和應(yīng)用都方興未艾。 本文介紹了國內(nèi)外領(lǐng)域本體的研究現(xiàn)狀,探討了本體的相關(guān)理論與構(gòu)建方法和工具。為了驗證用本體進行知識組織與管理的可行性及現(xiàn)有本體建模方法與工具的有效性,本文以斯坦福大學開發(fā)的“七步法”為本體構(gòu)建方法,利用其開發(fā)的本體構(gòu)建工具Protégé進行了肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體的構(gòu)建試驗。通過建立概念、概念之間的語義關(guān)系表達了肝炎病毒蛋白的領(lǐng)域知識。通過具體的本體構(gòu)建流程印證了領(lǐng)域本體構(gòu)建工具與方法的可行性,在此基礎(chǔ)上總結(jié)出一套本體構(gòu)建的具體流程,為本體構(gòu)建的相關(guān)方法與工具在生物醫(yī)學領(lǐng)域的應(yīng)用提供了樣例。本文的研究內(nèi)容主要包括本體相關(guān)理論研究,領(lǐng)域本體構(gòu)建方法與構(gòu)建工具的研究,肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體的構(gòu)建,以及肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體在檢索中的應(yīng)用。
【關(guān)鍵詞】:本體 本體構(gòu)建 語義檢索 查詢擴展
【學位授予單位】:上海交通大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:G254.2;R512.6
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • ABSTRACT7-9
  • 目錄9-11
  • 第一章 序言11-20
  • 1.1 研究背景及意義11-12
  • 1.2 本體概述12-14
  • 1.2.1 本體12-13
  • 1.2.2 領(lǐng)域本體13-14
  • 1.3 本體研究現(xiàn)狀14-17
  • 1.3.1 國外本體研究現(xiàn)狀14-16
  • 1.3.2 國內(nèi)本體研究現(xiàn)狀16-17
  • 1.4 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫研究與應(yīng)用現(xiàn)狀17-18
  • 1.5 研究內(nèi)容與章節(jié)安排18-20
  • 第二章 本體相關(guān)理論20-33
  • 2.1 本體描述語言20-24
  • 2.1.1 基于 AI 的本體描述語言20-22
  • 2.1.2 基于 Web 的本體描述語言22-24
  • 2.2 本體建模方法24-30
  • 2.2.1 骨架法24-25
  • 2.2.2 TOVE 法25-26
  • 2.2.3 Methontology 方法26-27
  • 2.2.4 七步法27-30
  • 2.3 本體構(gòu)建原則30-31
  • 2.4 本體構(gòu)建工具31-32
  • 2.5 本章小結(jié)32-33
  • 第三章 本體在信息檢索中的應(yīng)用33-36
  • 3.1 基于本體的跨語言檢索33-34
  • 3.2 基于本體的自然語言檢索34
  • 3.3 基于本體的查詢擴展檢索34-36
  • 第四章 肝炎病毒蛋白領(lǐng)域本體的構(gòu)建36-45
  • 4.1 本體構(gòu)建工具選擇36
  • 4.2 本體構(gòu)建方法選擇36-37
  • 4.3 本體構(gòu)建流程與步驟37-44
  • 4.4 本章小結(jié)44-45
  • 第五章 基于肝炎病毒蛋白本體的語義檢索設(shè)計與試驗45-68
  • 5.1 實驗平臺和工具47
  • 5.2 系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn)47-61
  • 5.2.1 基于本體的語義擴展模塊47-51
  • 5.2.2 信息檢索模塊51-59
  • 5.2.3 用戶界面模塊59-61
  • 5.3 檢索功能試驗61-67
  • 5.4 本章小結(jié)67-68
  • 第六章 總結(jié)和展望68-70
  • 6.1 論文研究工作總結(jié)68-69
  • 6.1.1 本文的主要工作68-69
  • 6.1.2 本文的創(chuàng)新點69
  • 6.2 下一步工作展望69-70
  • 參考文獻70-73
  • 致謝73-74
  • 攻讀碩士學位期間已發(fā)表的論文74

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本文編號:270773

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