乙肝母嬰阻斷母子血清HBV DNA檢測與序列分析
發(fā)布時(shí)間:2020-05-18 09:26
【摘要】: 目的:分析血清標(biāo)本檢測中HBsAg陰性,HBV DNA陽性結(jié)果的可能原因,完善乙肝母嬰阻斷措施評(píng)價(jià)檢測指標(biāo);描述氨基酸位點(diǎn)置換在母嬰阻斷成功和失敗兒童及母親中的分布,探討S區(qū)、C區(qū)氨基酸置換與母嬰阻斷效果的關(guān)系,推測可能與母嬰阻斷失敗相關(guān)的HBV氨基酸變異的位點(diǎn)。 方法:本次研究血清來自北京、蘭州、寧波三地進(jìn)行乙肝母嬰阻斷研究所收集的血清標(biāo)本,采用酶聯(lián)免疫吸附法檢測乙肝病毒感染的血清學(xué)指標(biāo)。血清HBsAg陽性,抗-HBs陰性兒童定義為母嬰阻斷失敗兒童,其母親為母嬰阻斷失敗母親。經(jīng)QIAamp DNA Blood Mini Kit提取HBV DNA,采用巢式PCR法擴(kuò)增HBV DNA S區(qū)基因片段,半巢式PCR法擴(kuò)增HBV DNA C區(qū)基因片段,分別純化測序。利用生物信息軟件DNA STAR將核苷酸序列與HBVA-H各基因型標(biāo)準(zhǔn)序列比對(duì)分析,進(jìn)行基因分型。利用軟件將核苷酸序列推導(dǎo)出氨基酸序列,進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)變異分析。應(yīng)用SAS9.0整理實(shí)驗(yàn)結(jié)果,并將符合分析要求的S區(qū)、C區(qū)序列數(shù)據(jù),以每個(gè)氨基酸位點(diǎn)為變量,結(jié)合HBV的分子生物學(xué)特點(diǎn)進(jìn)行分析。 結(jié)果:1、母嬰阻斷成功母親血清標(biāo)本273份,母嬰阻斷失敗母親血清標(biāo)本72份,兩組HBV DNA陽性數(shù)分別為123份、60份,HBV DNA檢出率分別為45.05%、83.33%;母嬰阻斷成功兒童血清標(biāo)本149份,母嬰阻斷失敗兒童血清標(biāo)本79份,HBV DNA陽性數(shù)分別為18份、69份,HBV DNA檢出率分別為12.08%、87.34%。2、HBV DNA檢測陽性標(biāo)本中221份測序得到S基因片段。HBV DNA檢測陽性兒童均列為母嬰阻斷失敗兒童,共72份,基因型分別為A型、B型、C型、D型。母嬰阻斷成功母親87例,母嬰阻斷失敗母親62例,兩組基因型均為B型、C型、D型構(gòu)成;在蘭州地區(qū)B型和C型母親母嬰阻斷成功率比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P=0.8682,。3、共得到179份S基因片段氨基酸序列,其中兒童序列63份,母嬰阻斷成功14份,母嬰阻斷失敗49份;母親序列116份,母嬰阻斷成功69份,母嬰阻斷失敗47份。138份C基因片段氨基酸序列可進(jìn)行氨基酸位點(diǎn)分析,其中兒童序列42份,母嬰阻斷成功10份,母嬰阻斷失敗32份;母親序列96份,母嬰阻斷成功62份,母嬰阻斷失敗34份。在S區(qū)氨基酸位點(diǎn)分析結(jié)果顯示,母嬰阻斷兒童中有60.3%(38/63)序列發(fā)生氨基酸位點(diǎn)置換,母嬰阻斷成功母親和失敗母親分別為72.5%(50/69)、74.5%(35/47),三者差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。4、在母嬰阻斷成功與失敗兒童中,單個(gè)氨基酸位點(diǎn)置換率比較有差異的氨基酸位點(diǎn)(OR值95%可信區(qū)間不包括1的位點(diǎn))有,preS區(qū)第27、38、65、87、88、114位氨基酸位點(diǎn),S區(qū)第46、122、133、159位氨基酸位點(diǎn),C區(qū)第15、30、33、86、109位氨基酸位點(diǎn);在母嬰阻斷成功與失敗母親中,單個(gè)氨基酸位點(diǎn)置換比較,在母嬰阻斷成功組和失敗組中有差異的氨基酸位點(diǎn)有,preS區(qū)第35、39、45、48、51、54、57、115、121、138、148、152、154位氨基酸位點(diǎn),S區(qū)第5、8、24、56、57、59、64、85、143、161位氨基酸位點(diǎn)。C區(qū)第61、80位氨基酸位點(diǎn)。其中某些位點(diǎn)在阻斷成功或失敗對(duì)象中有置換率為0的項(xiàng)。 結(jié)論:結(jié)合血清中HBV DNA檢測指標(biāo)共同評(píng)價(jià)母嬰阻斷措施效果;母嬰傳播與母親體內(nèi)HBV載量成正相關(guān);B型和C型HBV的母親,母嬰阻斷成功率無差別,還不能得出基因型與母嬰傳播及其阻斷效果的關(guān)系;在母嬰阻斷成功兒童(HBsAg陰性)和阻斷失敗兒童(HBsAg陽性)中氨基酸位點(diǎn)置換率無明顯差別,母親體內(nèi)HBV DNA preS和S區(qū)氨基酸位點(diǎn)置換可能與母嬰阻斷效果有關(guān)。
【圖文】:
3.2母嬰阻斷兒童及母親基因型構(gòu)成分布72例兒童基因型分布為A、B、C、D四個(gè)基因型,B型、C型較多;母嬰阻斷成功母親87例,母嬰阻斷失敗母親62例,兩者基因型分布均為B、C、D型,,且B、c型較多(圖4)。兒童.卜、匕72例阻斷成功母親阻斷失敗母親87例62例圖4母嬰阻斷母親和兒童基因型構(gòu)成圖 Fig4ThedistributionofgenotyPesinmothersandehildern
【學(xué)位授予單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號(hào)】:R512.62;R450
【圖文】:
3.2母嬰阻斷兒童及母親基因型構(gòu)成分布72例兒童基因型分布為A、B、C、D四個(gè)基因型,B型、C型較多;母嬰阻斷成功母親87例,母嬰阻斷失敗母親62例,兩者基因型分布均為B、C、D型,,且B、c型較多(圖4)。兒童.卜、匕72例阻斷成功母親阻斷失敗母親87例62例圖4母嬰阻斷母親和兒童基因型構(gòu)成圖 Fig4ThedistributionofgenotyPesinmothersandehildern
【學(xué)位授予單位】:中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號(hào)】:R512.62;R450
【參考文獻(xiàn)】
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1 張權(quán)一,張興義,葉世德,王庭志,徐桂珍,賈國富,田春生,宋益貴,任貴方,朱既明;乙型肝炎病毒基因重組疫苗免疫兒童成人效果及阻斷母嬰傳播的研究[J];病毒學(xué)報(bào);1991年S1期
2 劉海英,馬玉燕,崔保霞,戴e
本文編號(hào):2669514
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