發(fā)布時間：2020-03-28 09:49

【摘要】：肝硬化是由不同病因引起的慢性、進(jìn)行性、彌漫性肝病,其病理特點(diǎn)為廣泛的肝臟細(xì)胞變性壞死、纖維組織增生、肝細(xì)胞結(jié)節(jié)再生及假小葉形成。為了解肝硬化發(fā)生的基因組學(xué)基礎(chǔ),本文用Rat Genome 230 2.0芯片檢測了大鼠肝硬化的3、6和9周時肝臟細(xì)胞的基因表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)304個基因與大鼠肝硬化發(fā)生相關(guān)。用生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)等方法分析肝臟細(xì)胞基因表達(dá)譜與肝硬化發(fā)生的相關(guān)性表明,與肝硬化發(fā)生相關(guān)的16種生理活動包括刺激、炎癥、免疫等反應(yīng),信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因轉(zhuǎn)錄、物質(zhì)運(yùn)輸、糖類、脂類、氨基酸、蛋白質(zhì)等代謝,氧化應(yīng)激、內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定、細(xì)胞增殖、生長、分化、發(fā)育、建成、凋亡、遷移、粘附等細(xì)胞活動。其中,炎癥反應(yīng)、細(xì)胞增殖、凋亡活動增強(qiáng),免疫反應(yīng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、氧化應(yīng)激、細(xì)胞分化、發(fā)育、粘附等生理活動減弱。為從基因轉(zhuǎn)錄水平探明肝再生與肝硬化發(fā)生的本質(zhì)異同,本文用大鼠全基因組基因表達(dá)譜芯片Rat Genome 230 2.0檢測了大鼠肝硬化的3、6和9周和再生肝恢復(fù)0、2、6、12、24、30、36、72、120和168h的肝組織基因表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)肝硬化發(fā)生中304個基因和肝再生中948個基因發(fā)生了有意義表達(dá)變化。H-clustering樹形分析顯示兩者的轉(zhuǎn)錄譜差異較大。K-means根據(jù)基因表達(dá)相似性將上述兩者除去重復(fù)后共1096個基因分為6種表達(dá)模式。GO分類和功能聚類分析發(fā)現(xiàn),在肝硬化和肝再生中,免疫反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞遷移、粘附等生理活動增強(qiáng),各種物質(zhì)代謝活動減弱。其中,肝硬化的刺激反應(yīng)在C2中強(qiáng)于肝再生,在C6中弱于肝再生,而DNA修復(fù)、細(xì)胞增殖、脂類代謝、內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài)和氧化應(yīng)激等弱于肝再生。為從基因轉(zhuǎn)錄水平了解JNK、ERK1/2信號通路在大鼠肝再生和大鼠肝硬化中的作用異同,本文用Rat Genome 230 2.0芯片檢測兩者的基因表達(dá)譜,用生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)等方法分析基因表達(dá)譜預(yù)示的生理活動。分析表明,JNK信號通路涉及42條途徑,其中的37條途徑調(diào)控大鼠肝再生的細(xì)胞增殖和凋亡,對大鼠肝硬化的調(diào)控作用則不顯著。JNK信號通路涉及的302個基因中,Rat Genome 230 2.0芯片含有240個,其中,79個基因發(fā)生有意義表達(dá)變化,涉及肝再生的52個基因,肝硬化的5個基因,兩者共有的22個基因。ERK1/2信號通路包括14條途徑,其中6條途徑調(diào)控大鼠肝再生和大鼠肝硬化發(fā)生中的細(xì)胞增殖。ERK1/2信號通路共涉及165個基因,Rat Genome 230 2.0芯片含有161個基因,其中,46個基因發(fā)生有意義表達(dá)變化,涉及肝再生的35個基因,肝硬化的4個基因,兩者共有的7個基因。
【圖文】：

3 結(jié)果3.1 肝組織顯微結(jié)構(gòu)（HE 染色）正常大鼠的肝組織顯微結(jié)構(gòu)：肝小葉結(jié)構(gòu)清晰，中央靜脈半充盈，肝細(xì)胞呈索狀整齊緊密排列，肝血竇清晰完整。肝細(xì)胞呈多角形，核圓，藍(lán)色深染，核仁清晰。胞質(zhì)豐富、均勻（圖 2-1 A）。建模第 3 周的肝組織顯微結(jié)構(gòu)：肝竇狹窄，中央靜脈淤血明顯，細(xì)胞水樣變性加劇，部分可見點(diǎn)灶狀壞死（圖 2-1 B）。建模第 6 周的肝組織顯微結(jié)構(gòu)：脂肪變性繼續(xù)加劇，小葉間膽管明顯增生，部分區(qū)域開始形成假小葉，出現(xiàn)彌漫性纖維組織增生（圖 2-1 C）。建模第 9 周的肝組織顯微結(jié)構(gòu)：炎細(xì)胞浸潤進(jìn)一步加重，纖維組織及膠原逐漸增粗，并向肝小葉內(nèi)呈鋒芒狀蔓延，纖維間隔形成，假小葉廣泛形成，內(nèi)可見纖維束，并出現(xiàn)肝再生結(jié)節(jié)（圖 2-1 D）。

圖 2-2 CCl4誘導(dǎo)的大鼠肝硬化發(fā)生中相關(guān)基因的表達(dá)變化實(shí)線示 RT-PCR 檢測結(jié)果，虛線示 Rat Genome 230 2.0 芯片檢測結(jié)果3.3 大鼠肝硬化發(fā)生中肝臟細(xì)胞的基因表達(dá)譜用 Rat Genome 230 2.0 芯片、從基因組范圍檢測大鼠肝硬化發(fā)生 3、6、9 周時肝臟細(xì)胞的基因表達(dá)變化表明，肝硬化發(fā)生中 304 個基因發(fā)生有意義表達(dá)變化，相應(yīng)時間有意義表達(dá)變化基因數(shù)為 65、205、195，總有意義表達(dá)上調(diào)和下調(diào)的基因數(shù)分別為 148 和 156，共涉及 16 種生理活動。在肝硬化發(fā)生的 3 周，，炎癥反應(yīng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞發(fā)育等相關(guān)的 49 個基因表達(dá)上調(diào)，運(yùn)輸、脂類代謝、基因轉(zhuǎn)錄等相關(guān)的 43 個基因表達(dá)下調(diào)。在 6 周，刺激反應(yīng)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因轉(zhuǎn)錄等相關(guān)的 166 個基因表達(dá)上調(diào)，運(yùn)輸、脂類代謝、氧化應(yīng)激等相關(guān)的 178 個基因表達(dá)下調(diào)。在 9 周，蛋白質(zhì)代謝、細(xì)胞增殖、凋亡等相關(guān)的 182 個基因表達(dá)上調(diào)，刺激反應(yīng)、脂類代謝、運(yùn)輸?shù)认嚓P(guān)的155 個基因表達(dá)下調(diào)（表 2-1）。
【學(xué)位授予單位】：河南師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2011
【分類號】：R575.2

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 歐志穗;劉友章;陳裕杲;;健脾益肝方對肝硬化大鼠AQP8的影響[J];中華中醫(yī)藥學(xué)刊;2011年07期

2 王世美;鄭素軍;邢欣悅;鄧志華;劉梅;俞豪;李長勇;段鐘平;;TGF-β1對大鼠肝細(xì)胞系BRL-3A凋亡和細(xì)胞周期的影響[J];世界華人消化雜志;2011年16期

3 荊宏生;楊瑞琦;;NTCP在去迷走神經(jīng)大鼠肝細(xì)胞中的表達(dá)及臨床意義[J];心血管病防治知識(學(xué)術(shù)版);2011年03期

4 郝賢;付雪艷;趙力維;;健脾活血法對2型糖尿病大鼠胰島素抵抗的影響[J];時珍國醫(yī)國藥;2011年07期

5 張士軍;張志偉;陳兆霓;林興;付書婕;黃仁彬;;復(fù)方六月青對實(shí)驗(yàn)性肝纖維化大鼠肝臟超微結(jié)構(gòu)的影響[J];時珍國醫(yī)國藥;2011年06期

6 周紅宇;周國華;;一氧化氮和內(nèi)毒素在肝硬化并發(fā)癥發(fā)病中的機(jī)制及益生菌的干預(yù)作用研究進(jìn)展[J];疑難病雜志;2011年07期

7 葉麗河;李鶴平;張冰;楊建勇;劉錦召;沈俊杰;;SD大鼠移植性CBRH-7919肝癌模型的建立[J];當(dāng)代醫(yī)學(xué);2011年14期

8 何秀敏;楊欽河;黎佩芳;陳忠;馮高飛;王文晶;劉海濤;張玉佩;紀(jì)桂元;;疏肝健脾方藥對非酒精性脂肪性肝病大鼠肝組織SREBP-1c mRNA及蛋白表達(dá)的影響[J];中藥材;2011年06期

9 蔣偉偉;趙金滿;于良立;;外源性血管內(nèi)皮生長因子對肝硬化大鼠門靜脈壓力的影響[J];中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2011年08期

10 ;本刊組織構(gòu)建欄目已出版“肝臟組織工程”研究的相關(guān)文章[J];中國組織工程研究與臨床康復(fù);2011年20期

相關(guān)會議論文 前10條

1 夏濤;王愛國;余日安;肖登峰;林青;楊克敵;;硒和維生素C對氟致大鼠肝細(xì)胞DNA損傷的影響[A];新世紀(jì)預(yù)防醫(yī)學(xué)面臨的挑戰(zhàn)——中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會首屆學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2002年

2 江青艷;張守全;勞全林;高淑靜;梅曼彤;;模擬微重力條件下大鼠肝細(xì)胞三維培養(yǎng)的研究[A];中國宇航學(xué)會航天醫(yī)學(xué)工程專業(yè)委員會、中國空間科學(xué)學(xué)會空間生命專業(yè)委員會聯(lián)合學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2001年

3 黃文方;康格非;楊明清;涂植光;陳宏礎(chǔ);唐中;蔣虹;顏英俊;;甘氨脫氧膽酸誘導(dǎo)大鼠肝細(xì)胞凋亡[A];西部大開發(fā) 科教先行與可持續(xù)發(fā)展——中國科協(xié)2000年學(xué)術(shù)年會文集[C];2000年

4 徐仁歡;金由辛;周霞青;;Caspase-3在大鼠肝細(xì)胞BRL-3A凋亡途徑中的作用研究[A];中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)會第八屆會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2001年

5 張志;方石崗;高毅;蔣澤生;孫爾維;;大鼠肝細(xì)胞癌形成過程中MMP-2mRNA的表達(dá)及應(yīng)用BB-94的影響[A];肝臟病防治學(xué)術(shù)研討會及新進(jìn)展學(xué)習(xí)班�？痆C];2005年

6 于向民;方麗華;;苯巴比妥投入對大鼠肝細(xì)胞增生的細(xì)胞化學(xué)研究[A];解剖學(xué)雜志——中國解剖學(xué)會2002年年會文摘匯編[C];2002年

7 裴彬;蔡雄;繆曉輝;范國榮;李爽;;五味子甲素對大鼠肝細(xì)胞色素P450 3A影響的研究[A];中華醫(yī)學(xué)會全國第九次感染病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

8 郭啟煜;高妍;叢琳;;游離脂肪酸對大鼠肝細(xì)胞胰島素信號傳導(dǎo)蛋白的影響[A];中華醫(yī)學(xué)會第六次全國內(nèi)分泌學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2001年

9 楊大國;吳其愷;樂曉華;何清;聶廣;;通里攻下法對急性肝衰竭大鼠肝細(xì)胞凋亡的影響(摘要)[A];第九次全國中西醫(yī)結(jié)合肝病學(xué)術(shù)會議論文集[C];2000年

10 張榮華;戴裕光;;三七總皂苷藥物血清對CFSC、肝纖維化大鼠肝細(xì)胞~3H-TdR、~3H-Pro摻入的影響[A];第十五次全國中西醫(yī)結(jié)合肝病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前6條

1 佳木斯大學(xué)微生態(tài)研究室 李麗秋;中藥提取物水蘇糖價值凸現(xiàn)[N];中國食品報(bào);2009年

2 史鳳芝;肝硬化終遇“殺手”[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

3 陶春祥;中藥治療乙肝的研究[N];中國醫(yī)藥報(bào);2002年

4 程書權(quán);大環(huán)內(nèi)酯類抗生素在與HP感染相關(guān)疾病中的應(yīng)用[N];中國醫(yī)藥報(bào);2001年

5 ;蟲草菌絲對實(shí)驗(yàn)性肝硬化大鼠肝組織胰島素酶活性的影響[N];中國醫(yī)藥報(bào);2003年

6 傅德明;柴胡與丹參配伍抗大鼠肝纖維化作用的實(shí)驗(yàn)研究[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2001年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 齊素文;HBV肝硬化不同階段血清代謝物組的研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

2 汪紀(jì)倉;鎘致大鼠肝細(xì)胞毒性機(jī)理研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2010年

3 袁斌;MiR-23b在大鼠肝再生終止階段的表達(dá)及作用機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

4 潘傳涌;MicroRNA-127在大鼠肝再生過程中的作用機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2012年

5 于華蕓;熱性、寒性中藥對大鼠肝全基因表達(dá)譜影響的研究[D];山東中醫(yī)藥大學(xué);2010年

6 陳曉光;大鼠肝再生中基因組范圍內(nèi)的竇內(nèi)皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄譜動態(tài)分析[D];新疆大學(xué);2011年

7 吳宇群;光活黃皮酰胺類化合物對肝P-450及谷胱甘肽的影響及其潛在的生物學(xué)意義[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);1997年

8 蒿艷蓉;銀杏葉提取物（EGb761）抑制黃曲霉毒素B1誘發(fā)大鼠肝癌過程中的作用及其機(jī)制[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2008年

9 宇汝勝;腺病毒介導(dǎo)NF-κB p65的siRNA抗大鼠移植肝缺血再灌注損傷的研究[D];蘇州大學(xué);2008年

10 劉東遠(yuǎn);大鼠谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶P基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制的研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);1998年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 張寧;內(nèi)源性硫化氫在大鼠肝硬化不同時期的濃度變化及機(jī)制探討[D];石河子大學(xué);2009年

2 鞠雷;水飛薊對大鼠肝細(xì)胞醋氨酚損傷的保護(hù)作用[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

3 馬曉明;大鼠肝再生時血清膽汁酸及肝臟CYP7Al mRNA表達(dá)的變化[D];山西醫(yī)科大學(xué);2010年

4 曾祥婧;肝硬化文獻(xiàn)及其5年住院患者回顧性研究[D];廣州中醫(yī)藥大學(xué);2011年

5 張鐵亮;采用3.0T磁共振彌散加權(quán)成像對肝硬化嚴(yán)重程度的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2010年

6 王正華;肝硬化疾病評分模型的價值研究[D];三峽大學(xué);2011年

7 吳梓苗;肝硬化自發(fā)性細(xì)菌性腹膜炎患者預(yù)后相關(guān)因素分析[D];浙江大學(xué);2010年

8 劉瑩瑩;能全素對肝硬化大鼠肝功能及營養(yǎng)狀態(tài)的影響[D];河北醫(yī)科大學(xué);2012年

9 澤塔多吉;肝硬化與胃腸動力障礙關(guān)系的研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2012年

10 宋玉東;巴馬香豬肝硬化形成過程中細(xì)菌移位的初步研究[D];西南大學(xué);2010年

本文編號：2604283