英夫利西單抗治療克羅恩病黏膜愈合的血清差異蛋白質(zhì)表達研究
發(fā)布時間:2020-02-18 19:03
【摘要】:目的:尋找與英夫利西單抗(infliximab,IFX)治療克羅恩病(Crohn’s disease,CD)黏膜愈合(mucosal healing,MH)相關(guān)的血清蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物。方法:采集7例經(jīng)IFX治療獲得MH的CD患者治療前(0周,A組)和治療后(14周,B組)的血清,以及7例未獲得MH的CD患者(0周為C組,14周為D組)的血清。采用熒光標(biāo)記雙向差異凝膠電泳的方法,比較A組與B組之間、C組與D組之間、A組與C組之間以及B組與D組之間的蛋白質(zhì)組學(xué)差異,并對差異表達的蛋白質(zhì)斑點進行基質(zhì)輔助激光解吸/電離飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜初步鑒定和生物信息學(xué)分析。結(jié)果:(1)A組與B組、C組與D組、A組與C組以及B組與D組之間比較分別存在36、3、10和31個差異表達的蛋白質(zhì)斑點,共計存在44個顯著差異表達的蛋白質(zhì)斑點。(2)上述各組之間的差異斑點分別初步鑒定出17、2、2和15種蛋白質(zhì),共計存在19種差異表達的蛋白質(zhì),包括載脂蛋白E、載脂蛋白A-I、補體因子H等。(3)基于STRING數(shù)據(jù)庫繪制了蛋白質(zhì)網(wǎng)狀功能圖。結(jié)論:IFX治療獲得MH的CD患者治療前后的血清蛋白質(zhì)表達譜存在差異,獲得MH和未獲得MH的患者血清表達譜亦存在差異,其中19種蛋白質(zhì)有可能成為預(yù)測CD患者使用IFX獲得MH的生物標(biāo)志物。
【圖文】:
.2凝膠圖像差異分析經(jīng)DeCyder6.0軟件處理后Cy2、Cy3和Cy5染色在圖像中分別為藍色、綠色和紅色。經(jīng)DeCyder6.0軟件分析檢測到1505±177個蛋白質(zhì)斑點,獲得的凝膠間匹配率為72.0%±0.2%。以斑點平均體積差異大于1.5倍(表達差異上調(diào)或下調(diào)1.5倍),t檢驗P<0.05的蛋白質(zhì)點為有顯著差異的蛋白質(zhì)點,經(jīng)軟件統(tǒng)計分析,A組與B組之間、C組與D組之間、A組與C組之間以及B組與D組之間比較分別存在36、3、10和31個差異表達的蛋白質(zhì)斑點,共計發(fā)現(xiàn)44個顯著差異表達的蛋白質(zhì)斑點。顯著差異的蛋白斑點在2D-DIGE凝膠上的具體位置見圖2。Figure2.Mergedimageof2D-DIGE.圖2融合的2D-DIGE凝膠圖像3質(zhì)譜分析結(jié)果差異表達的44個蛋白質(zhì)點進行MALDI-TOF/TOF-MS質(zhì)譜分析,以Mascot得分≥56分認(rèn)為是可信結(jié)果,共鑒定出與27個差異點對應(yīng)的19種蛋白質(zhì),見表2。A組和B組比較鑒定出與25個差異點相對應(yīng)的17種差異蛋白質(zhì),其中在B組上調(diào)表達的蛋白有6種,包括中心體蛋白57kD樣1(centrosomalprotein57kD-like1,CEP57L1)、角蛋白2e(keratin,typeIIcytoskeletal2epidermal,CK-2e)、白蛋白(albumin,ALB)、載脂蛋白E(apolipoproteinE,APOE)、載脂蛋白A-I(apolipoproteinA-I,APOA1)和甲基化CpG結(jié)合域蛋白4(methyl-CpG-bindingdomainprotein4,MBD4),在B組下調(diào)表達的蛋白有11種,,包括補體因子H(complementfactorH,CFH)、銅藍蛋白(ceru-loplasmin,CP)、α1-抗胰蛋白酶(alpha-1-antitrypsin,SERPINA1)等。C組和D組比較鑒定出與3個差異點對應(yīng)的2種差異蛋白質(zhì),CEP57L1和ALB均在D組上調(diào)表達;A組和C組比較鑒定出與2個差異點相對應(yīng)的2種差異蛋白,Mago-Nashi同源蛋白(Mago-Nashiho-mologprotein,MAGOH)在A組上調(diào)表達,觸珠蛋白(haptoglobin,HP)?
【圖文】:
.2凝膠圖像差異分析經(jīng)DeCyder6.0軟件處理后Cy2、Cy3和Cy5染色在圖像中分別為藍色、綠色和紅色。經(jīng)DeCyder6.0軟件分析檢測到1505±177個蛋白質(zhì)斑點,獲得的凝膠間匹配率為72.0%±0.2%。以斑點平均體積差異大于1.5倍(表達差異上調(diào)或下調(diào)1.5倍),t檢驗P<0.05的蛋白質(zhì)點為有顯著差異的蛋白質(zhì)點,經(jīng)軟件統(tǒng)計分析,A組與B組之間、C組與D組之間、A組與C組之間以及B組與D組之間比較分別存在36、3、10和31個差異表達的蛋白質(zhì)斑點,共計發(fā)現(xiàn)44個顯著差異表達的蛋白質(zhì)斑點。顯著差異的蛋白斑點在2D-DIGE凝膠上的具體位置見圖2。Figure2.Mergedimageof2D-DIGE.圖2融合的2D-DIGE凝膠圖像3質(zhì)譜分析結(jié)果差異表達的44個蛋白質(zhì)點進行MALDI-TOF/TOF-MS質(zhì)譜分析,以Mascot得分≥56分認(rèn)為是可信結(jié)果,共鑒定出與27個差異點對應(yīng)的19種蛋白質(zhì),見表2。A組和B組比較鑒定出與25個差異點相對應(yīng)的17種差異蛋白質(zhì),其中在B組上調(diào)表達的蛋白有6種,包括中心體蛋白57kD樣1(centrosomalprotein57kD-like1,CEP57L1)、角蛋白2e(keratin,typeIIcytoskeletal2epidermal,CK-2e)、白蛋白(albumin,ALB)、載脂蛋白E(apolipoproteinE,APOE)、載脂蛋白A-I(apolipoproteinA-I,APOA1)和甲基化CpG結(jié)合域蛋白4(methyl-CpG-bindingdomainprotein4,MBD4),在B組下調(diào)表達的蛋白有11種,,包括補體因子H(complementfactorH,CFH)、銅藍蛋白(ceru-loplasmin,CP)、α1-抗胰蛋白酶(alpha-1-antitrypsin,SERPINA1)等。C組和D組比較鑒定出與3個差異點對應(yīng)的2種差異蛋白質(zhì),CEP57L1和ALB均在D組上調(diào)表達;A組和C組比較鑒定出與2個差異點相對應(yīng)的2種差異蛋白,Mago-Nashi同源蛋白(Mago-Nashiho-mologprotein,MAGOH)在A組上調(diào)表達,觸珠蛋白(haptoglobin,HP)?
【參考文獻】
相關(guān)期刊論文 前1條
1 曾花;蔡道章;陳郁鮮;曾春;葉志強;莊澤;黎明濤;胡坤華;;人膝骨關(guān)節(jié)炎血清生物學(xué)標(biāo)志物的篩選[J];中國病理生理雜志;2012年05期
【共引文獻】
相關(guān)期刊論文 前7條
1 Gabrio Bassotti;Elisabetta Antonelli;Vincenzo Villanacci;Marianna Salemme;Manuela Coppola;Vito Annese;;Gastrointestinal motility disorders in inflammatory bowel diseases[J];World Journal of Gastroenterology;2014年01期
2 張青森;楊慶帆;陳白莉;何瑤;陳e
本文編號:2580787
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