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APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究

發(fā)布時間:2016-11-16 06:13

  本文關(guān)鍵詞:APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《南方醫(yī)科大學(xué)》 2013年

APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究

游志毅  

【摘要】:研究背景: 乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus, HBV)感染是全球范圍內(nèi)嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題之一。據(jù)世界衛(wèi)生組織報道,全球約20億人具有HBV感染史,其中3.5億人為慢性感染者。HBV感染是造成慢性肝炎、肝硬化和肝細(xì)胞癌的主要原因之一,而且每年有將近100萬人由于HBV感染而最終死亡。從80年代中期以來,新發(fā)的后天獲得性乙型肝炎的數(shù)量逐漸在減少,而且乙型肝炎疫苗的成功使用,也降低了急性乙型肝炎和慢性乙型肝炎的發(fā)生率。但是,HBV感染仍然是造成肝臟疾病最主要的致病因素之一,F(xiàn)有研究表明,生活環(huán)境、病毒特征及其宿主自身素質(zhì)等方面的差異會造成乙型肝炎出現(xiàn)不同的疾病過程和臨床結(jié)果,特別是宿主本身的年齡和性別差異或者合并HIV、HCV感染時,對疾病的發(fā)展具有相當(dāng)大的影響。 由于宿主的天然免疫在機(jī)體抵御HBV感染的過程中非常關(guān)鍵,宿主對HBV的遺傳易感性在乙型肝炎發(fā)病和預(yù)后等方面尤為重要,因此,研究乙型肝炎的宿主遺傳易感性具有十分重要的意義。載脂蛋白B mRNA編輯酶催化多肽(APOBEC)家族成員,是近年來發(fā)現(xiàn)的具有抗病毒作用的天然免疫分子。載脂蛋白B mRNA編輯酶催化多肽3G (APOBEC3G)是該家族中的成員之一,又稱為CEM15,它具有胞苷脫氨酶活性,誘導(dǎo)病毒基因組發(fā)生堿基突變,可使胞嘧啶(C)脫氨基變?yōu)槟蜞奏?U),能抑制vif缺陷(△vif)人類免疫缺陷病毒-1及HBV復(fù)制。APOBEC3G基因定位于22號染色體長臂22q12-q13.2,含有8個外顯子和7個內(nèi)含子,編碼384個氨基酸。現(xiàn)有研究提示,APOBEC3G在人肝癌細(xì)胞系HepG2和HuH7中對HBV的復(fù)制有抑制作用,慢性HBV感染患者的APOBEC3G表達(dá)升高,但有關(guān)4POBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究目前尚未見報道,為探索APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性之間可能的相關(guān)性,本研究檢測了病例組和對照組中APOBEC3G基因rs185983011和rs5757465兩位點的多態(tài)性分布,以期確定這兩位點的多態(tài)性是否同慢性乙型肝炎發(fā)病有關(guān)。 研究目的: 1.檢測APOBEC3G基因rs185983011和rs5757465兩位點在人群中的多態(tài)性分布。 2.確定rs185983011和rs5757465兩位點的基因型和等位基因及其頻率的分布情況。 3.探討rs185983011和rs5757465兩位點的多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性之間的關(guān)系。 研究方法: 1.選取APOBEC3G基因序列最長的第3個外顯子作為目標(biāo)序列。運用Primer Premier5.0軟件,在目標(biāo)基因序列上下游及其內(nèi)部設(shè)計引物,并進(jìn)行篩選。 2.采用病例對照研究的方法。從南方醫(yī)院感染內(nèi)科選取159例慢性乙型肝炎患者作為病例組、186例HBsAg和HBeAg皆陰性的個體作為對照組,并分別收集各研究對象的血液樣本及其臨床資料。運用康為世紀(jì)試劑盒提取各自血液樣本基因組總DNA。 3.應(yīng)用篩選好的引物對樣本基因組總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并采取Sanger法對PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序。 4.應(yīng)用Sequencher4.10.1Demo軟件對測序結(jié)果進(jìn)行多序列比對,尋找和確定SNP位點。 5.應(yīng)用Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢驗病例組和對照組基因型的平衡情況,并進(jìn)行比較。 6.根據(jù)測序成功樣本的峰圖結(jié)果確定位點基因型和等位基因,并計算其頻率。運用SPSS13.0對收集的兩組樣本資料的實驗結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計分析,探討各位點的多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性的關(guān)系。 結(jié)果: 1.將成功測序的樣本結(jié)果通過Sequencher4.10.1Demo軟件與Genebank人類APOBEC3G標(biāo)準(zhǔn)序列(NCBI Reference Sequence:NM_021822.3)進(jìn)行多序列比對,以及在NCBI dbSNP數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行核對,確定了rs185983011和rs5757465兩基因多態(tài)性位點。根據(jù)峰圖判斷突變位點的基因型和等位基因,從而得到兩位點在檢測人群中的多態(tài)性分布。 2. rs185983011位點的基因型和基因頻率:病例組和對照組樣本PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序結(jié)果顯示,該位點包括C/C和C/T兩種基因型,其中以C/C為主(占兩組研究對象總數(shù)的97.7%)。在病例組中,C/C基因型154例,占96.9%;C/T基因型5例,占3.1%。在對照組中,C/C基因型183例,占98.4%;C/T基因型3例,占1.6%。兩組基因型分布運用Fisher確切概率法進(jìn)行比較,結(jié)果差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=0.888,P=0.4780.05)。等位基因C、T在病例組中的頻率分別是97.5%、2.5%;在對照組中頻率分別是98.9%、1.1%。運用Fisher確切概率法對兩組等位基因頻率進(jìn)行比較,結(jié)果差異也沒有統(tǒng)計學(xué)意義(x2=1.041,P=0.4200.05)。rs185983011位點的基因型分布和等位基因頻率在男性中和女性中、各年齡層中的分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。 3.rs5757465位點的基因型和基因頻率:病例組和對照組樣本PCR產(chǎn)物測序結(jié)果顯示,該位點包括C/C、C/T和T/T三種基因型。在病例組中,C/C基因型10例,占6.3%;C/T基因型52例,占32.7%,T/T基因型97例,占61.0%。在對照組中,C/C基因型7例,占3.8%;C/T基因型58例,占31.2%,T/T基因型121,占65.0%。對兩組基因型頻率進(jìn)行χ2檢驗,結(jié)果差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=1.394,P=0.4980.05)。在病例組中,等位基因C、T的頻率分別是16.4%、83.6%。在對照組中,等位基因C、T的頻率分別是9.7%、90.3%。對兩組等位基因頻率進(jìn)行χ2檢驗,結(jié)果差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=3.432,P=0.0640.05)。rs5757465基因型分布和等位基因頻率在男性中與女性中、各年齡層中的分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義。 結(jié)論: 1.rs185983011位點在人群中的基因型是C/C和C/T,以C/C為主(占兩組研究對象總數(shù)的97.7%),rs5757465位點在人群中的出的基因型為C/T和T/T。 2.本次研究鑒于rs185983011位點在NCBI的dpSNP數(shù)據(jù)庫的基因多態(tài)數(shù)據(jù)未見報道,首次檢測了rs185983011位點在中國人群中的基因型分布只有是C/C(97.7%)和C/T。雖然受樣本量和抽樣方法所限,該結(jié)果可能不具絕對代表性,但還是可為進(jìn)一步探索和確定APOBECE3G存在于中國人群中的SNP位點及其分布提供一定的依據(jù)。 3.本研究中,rs185983011和rs5757465兩位點的多態(tài)性與慢性乙型肝炎不存在相關(guān)性。可能由于樣本量過小,或者研究過程出現(xiàn)誤差造成的,也可能是這兩位點多態(tài)性確實與慢性乙型肝炎沒有相關(guān)性。若要進(jìn)一步證明該研究結(jié)果,要考慮進(jìn)行大規(guī)模、大樣本、多中心的人群資料流行病學(xué)調(diào)查。

【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:南方醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R512.62
【目錄】:

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【參考文獻(xiàn)】

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7 安紀(jì)紅;李敏;新燕;;人類白細(xì)胞抗原-Ⅱ類等位基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎相關(guān)性研究進(jìn)展[J];中華實驗和臨床感染病雜志(電子版);2010年03期

8 張淑蘭;馮忠軍;魏晨玲;頡玉欣;;慢性乙型肝炎患者E-選擇素A561C基因多態(tài)性的研究[J];臨床肝膽病雜志;2006年03期

9 田珊紅;胡金華;;慢性乙型肝炎患者YMDD自然變異的檢測[J];現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué);2011年01期

10 張?zhí)K寧;趙守松;;慢性乙型肝炎與急性戊型肝炎重疊感染機(jī)制研究進(jìn)展[J];內(nèi)科;2011年01期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 莊輝;;美國慢性乙型肝炎治療流程修訂介紹[A];第三屆全國重型肝病及人工肝血液凈化學(xué)術(shù)年會論文集(上冊)[C];2007年

2 杜發(fā)斌;蔚林蘭;孫曉峰;馮明輝;張瑞;;芍地蘭片治療慢性乙型肝炎的臨床研究[A];第十二次全國中西醫(yī)結(jié)合肝病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2003年

3 程瑗;金曉芝;葉超;陳永平;章圣輝;洪煒龍;谷甸娜;張磊;鄭明華;;不同病程慢性乙型肝炎患者外周血CD4+CD25+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞數(shù)量變化[A];第四屆中國醫(yī)師協(xié)會感染科醫(yī)師大會暨傳染病診治高峰論壇、浙江省醫(yī)學(xué)會肝病、感染病學(xué)學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2011年

4 梁克為;劉雪林;王福生;;慢性乙型肝炎和性傳播疾病人群中輔助受體基因多態(tài)性的檢測及分布特點[A];中華醫(yī)院管理學(xué)會醫(yī)院感染管理專業(yè)委員會第九屆醫(yī)院感染管理學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2002年

5 趙召霞;許怡;侯軍良;劉玉珍;戴二黑;;阿德福韋酯治療后出現(xiàn)病毒學(xué)突破的慢性乙型肝炎患者的耐藥分析[A];中華醫(yī)學(xué)會第九次全國檢驗醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會議暨中國醫(yī)院協(xié)會臨床檢驗管理專業(yè)委員會第六屆全國臨床檢驗實驗室管理學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年

6 江宇泳;王融冰;孫靜媛;劉軍民;吳云忠;周桂琴;孫鳳霞;王曉靜;;慢性乙型肝炎中醫(yī)證型臨床分析[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會第十二屆內(nèi)科肝膽病學(xué)術(shù)會議暨第四次國家中醫(yī)肝病重點?茀f(xié)作組學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2006年

7 婁金麗;閆艷;李秀惠;;慢性乙型肝炎病毒攜帶的研究現(xiàn)狀與進(jìn)展[A];中華中醫(yī)藥學(xué)會第十三屆內(nèi)科肝膽病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2008年

8 程瑗;金曉芝;葉超;陳永平;章圣輝;洪煒龍;谷甸娜;張磊;鄭明華;;不同病程慢性乙型肝炎患者外周血CD4+CD25+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞數(shù)量變化[A];第二十次全國中西醫(yī)結(jié)合肝病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2011年

9 李旭明;魏爭;;三環(huán)療法治療慢性乙型肝炎的臨床觀察[A];中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會第十二次全國消化系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)研討會論文匯編[C];2000年

10 徐克成;吳建文;;慢性乙型肝炎的聯(lián)合治療[A];中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會第十三次全國消化系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)研討會論文匯編[C];2001年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 本報記者 高莎;[N];工人日報;2001年

2 曾歷;[N];健康報;2008年

3 石家莊市第五醫(yī)院感染五科主任 陳翠英;[N];石家莊日報;2009年

4 ;[N];大連日報;2005年

5 劍鐘;[N];上海中醫(yī)藥報;2002年

6 汪承柏教授;[N];中國中醫(yī)藥報;2003年

7 汪承柏;[N];中國中醫(yī)藥報;2003年

8 汪承柏;[N];中國中醫(yī)藥報;2003年

9 汪承柏教授;[N];中國中醫(yī)藥報;2003年

10 汪承柏教授;[N];中國中醫(yī)藥報;2003年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王立芹;慢性乙型肝炎發(fā)病趨勢及患者的生命質(zhì)量與相關(guān)影響因素的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2010年

2 辛桂杰;替諾福韋酯治療對慢性乙型肝炎療效及治療過程中宿主的免疫應(yīng)答研究[D];吉林大學(xué);2012年

3 于風(fēng)雪;白細(xì)胞介素28、P21活化激酶4基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎病人抗病毒治療應(yīng)答的關(guān)聯(lián)性分析[D];河北醫(yī)科大學(xué);2013年

4 吳剛;1.乙酰半胱氨酸治療慢性重度乙型肝炎臨床研究  2.高效復(fù)合干擾素對慢性乙型肝炎的治療研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2004年

5 馬利;中醫(yī)藥防治慢性乙型肝炎循證醫(yī)學(xué)工作平臺的構(gòu)建和應(yīng)用研究[D];湖北中醫(yī)藥大學(xué);2012年

6 王志宏;針刺治療慢性乙型肝炎的臨床與實驗研究[D];黑龍江中醫(yī)藥大學(xué);2002年

7 戚朝霞;RORα和RORγt在慢性乙型肝炎、慢加急性重型乙肝和原發(fā)性肝癌的表達(dá)和意義[D];山東大學(xué);2012年

8 南雪平;抗HBV治療對慢性乙型肝炎患者調(diào)節(jié)性免疫功能的影響[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2010年

9 褚瑞海;HLA-DRB1等位基因多態(tài)性和乙肝病毒基因型與慢性乙型肝炎α-干擾素抗病毒治療應(yīng)答的相關(guān)性研究[D];山東大學(xué);2005年

10 楊志軍;我國慢性傳染病預(yù)防與治療監(jiān)測的經(jīng)濟(jì)學(xué)分析[D];上海交通大學(xué);2008年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉琦;HBV基因型及前C區(qū)變異與慢性乙型肝炎病情關(guān)系研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年

2 潘菁;中國西南地區(qū)人群中IL-10-592和IFNAR1-17470多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性的相關(guān)性分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2011年

3 崔明芳;Tim-3基因多態(tài)性與HBV感染轉(zhuǎn)歸的相關(guān)性研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2011年

4 游志毅;APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2013年

5 夏淑林;CD24基因多態(tài)性與慢性HBV感染的遺傳易感性研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2011年

6 辛?xí)喳?慢性乙型肝炎肝組織學(xué)變化及其與血清生化和纖維化等指標(biāo)的關(guān)系[D];大連醫(yī)科大學(xué);2010年

7 李薇;乙肝凈方治療應(yīng)用核苷(酸)類藥物停藥復(fù)發(fā)的慢性乙型肝炎臨床觀察[D];湖北中醫(yī)藥大學(xué);2010年

8 李文聰;慢性乙型肝炎優(yōu)化治療方案的臨床研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2011年

9 厲晶萍;慢性乙型肝炎肝腎陰虛型的理法方藥研究[D];湖北中醫(yī)學(xué)院;2004年

10 姚紅梅;PI3K/PKB信號通路在慢性乙型肝炎患者外周血單個核細(xì)胞凋亡中的作用[D];河北醫(yī)科大學(xué);2011年


  本文關(guān)鍵詞:APOBEC3G基因多態(tài)性與慢性乙型肝炎易感性關(guān)系的研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:176718

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