本文選題：轉移性肝細胞癌 + 差異基因表達��； 參考：《基因組學與應用生物學》2017年04期

【摘要】：本研究旨在篩選與乙肝陽性轉移性肝細胞癌相關的基因并揭示其潛在的分子機制。利用GEO數據庫中GSE364數據集,篩選在肝內擴散轉移組和門靜脈癌栓轉移組都差異表達的基因,DAVID對差異表達基因進行GO與信號通路富集分析,并用STRING和Cytoscape構建蛋白互作網絡,隨后用mi Rwalk 2.0篩選可能參與肝細胞癌轉移的miRNAs,構建miRNA-樞紐基因調控網絡。之后使用Smoami R DB 2.0和c Bio Portal分析樞紐基因突變與circRNA和肝細胞癌預后的關系。我們獲得在肝內擴散轉移組和門靜脈癌栓轉移組都差異表達的基因701個,富集分析發(fā)現這些基因主要涉及血管生成和血管內皮生長因子信號轉導等信號通路。從構建的蛋白互作網絡中獲得參與蛋白互作模式1的15個樞紐基因,GO分析發(fā)現其主要參與RNA加工、代謝、剪接等生物過程。構建的miRNA-樞紐基因調控網絡中有4個miRNA參與兩個樞紐基因的調控,此外肝細胞癌中SRSF1基因有突變并可轉錄為hsa_circ_0044757,SNRNP200基因突變與患者預后相關。本研究發(fā)現的差異表達基因和樞紐基因,有助于我們認識乙肝相關性肝細胞癌轉移的分子機制,并可作為新的用于診斷和預后判斷的分子標志物。
[Abstract]:The aim of this study was to screen genes associated with hepatitis B positive metastatic hepatocellular carcinoma (HCC) and to reveal its potential molecular mechanism.Using the GSE364 data set in GEO database, the differential expression genes were screened in both intrahepatic diffusive metastasis group and portal vein tumor thrombus metastasis group. The differentially expressed genes were enriched by go and signal pathway, and protein interaction network was constructed by STRING and Cytoscape.Then the miRNA-hinge gene regulatory network was constructed by using mi Rwalk 2.0 to screen the miRNA-pivot gene regulatory network that might be involved in the metastasis of hepatocellular carcinoma.Smoami R DB 2.0 and c Bio Portal were used to analyze the relationship between gene mutation and prognosis of circRNA and hepatocellular carcinoma.We obtained 701 differentially expressed genes in intrahepatic diffusion metastasis group and portal vein tumor thrombus metastasis group. Enrichment analysis revealed that these genes were mainly involved in signal pathways such as angiogenesis and vascular endothelial growth factor signal transduction.Fifteen pivotal genes involved in protein interaction mode 1 were obtained from the constructed protein interaction network. It was found that these genes were mainly involved in biological processes such as RNA processing, metabolism, splicing and so on.In the constructed miRNA-hinge gene regulatory network, four miRNA were involved in the regulation of two pivotal genes. In addition, the mutation of SRSF1 gene in hepatocellular carcinoma was related to the prognosis of patients.The differentially expressed genes and pivot genes found in this study are helpful for us to understand the molecular mechanism of Hepatitis B related hepatocellular carcinoma metastasis and can be used as new molecular markers for diagnosis and prognosis judgment.
【作者單位】： 桂林醫(yī)學院生物化學與分子生物學教研室;
【基金】：國家自然科學基金地區(qū)基金(31660317) 廣西壯族自治區(qū)教育廳科學技術研究項目(YB2014269)共同資助
【分類號】：R512.62;R735.7

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 王家(馬龍),李紹白,楊大國,唐望先,過晉源;肝細胞癌與乙型肝炎病毒感染關系的再探討[J];臨床內科雜志;1987年02期

2 Kew MC;程翠薇;;吸煙作為肝細胞癌的一個危險因素——南非黑人病例對照研究[J];右江醫(yī)學;1987年03期

3 李思翹;;丙型肝炎病毒感染對肝硬變患者構成轉變?yōu)楦渭毎┑奈ｋU因素[J];國外醫(yī)學情報;1992年12期

4 郭俊奇;郭玉敏;史潔;曹詠;;丙型肝炎病毒感染與肝細胞癌的關系[J];大連大學學報;1993年03期

5 劉克洲,Dennin RH;肝細胞癌與丙型肝炎病毒感染關系的研究進展[J];國外醫(yī)學(流行病學傳染病學分冊);1995年03期

6 王義成;李建忠;;青島地區(qū)乙型肝炎病毒基因型分布及其與肝細胞癌的相關性[J];中國醫(yī)療前沿;2009年09期

7 袁偉雄;肖酰德;;乙型肝炎與肝細胞癌及藥物有關的肝細胞癌的鑒別診斷[J];廣東醫(yī)藥資料;1978年10期

8 楊紹基;;在慢性肝病臨床隨訪中發(fā)現肝細胞癌[J];國外醫(yī)學參考資料(內科學分冊);1978年Z2期

9 岡部和彥 ,王地槐 ,劉德午;非甲非乙型肝炎和肝細胞癌[J];微生物學免疫學進展;1989年02期

10 郭思源,王能進,張松平;性別與肝細胞癌關系的探討[J];新醫(yī)學;1990年10期

相關會議論文 前2條

1 朱明華;祝峙;劉曉紅;林靜;曲建慧;陳穎;曹曉哲;王力;倪燦榮;;乙型肝炎病毒感染與肝細胞癌發(fā)生關系的分子病理學研究[A];中華醫(yī)學會病理學分會2009年學術年會論文匯編[C];2009年

2 顧星;戚鵬;周飛國;吉強;王皓;竇同海;趙云鵬;高春芳;;三個HCV相關HCC危險因子與中國人HBV相關HCC的關聯分析[A];全國臨床免疫檢驗研討會暨第六屆全國臨床免疫學術會議論文匯編[C];2009年

相關重要報紙文章 前1條

1 劉毅峰;姑息治療未占主導地位[N];醫(yī)藥經濟報;2003年

相關博士學位論文 前7條

1 白蘭;乙肝病毒捕獲細胞因子和信號級聯以逃避宿主免疫并維持持續(xù)感染[D];武漢大學;2014年

2 高霞;PNPLA3基因單核苷酸多態(tài)性及基因表達與乙肝病毒感染易感性及乙肝相關肝細胞癌的關聯性研究[D];河北醫(yī)科大學;2016年

3 張海英;PNPLA3基因多態(tài)性與乙型肝炎病毒相關性肝細胞癌的相關性及其機制研究[D];青島大學;2016年

4 劉雅明;高表達β2糖蛋白Ⅰ在乙型肝炎病毒入侵肝細胞初始環(huán)節(jié)中的作用研究[D];吉林大學;2014年

5 王棟;乙型肝炎病毒介導載脂蛋白和NQO1對肝細胞脂肪化的作用及機制研究[D];福建醫(yī)科大學;2013年

6 劉紅艷;慢性乙型肝炎患者肝細胞中調控HBV復制基因的篩選及作用機制研究[D];復旦大學;2012年

7 劉俊英;PHB表達與HBV感染關系及對細胞生理功能影響研究[D];重慶醫(yī)科大學;2013年

相關碩士學位論文 前10條

1 徐斌;瞬時彈性測定評估慢性乙肝患者原發(fā)性肝細胞癌發(fā)生風險的研究[D];第三軍醫(yī)大學;2015年

2 邢時龍;2型糖尿病與乙型肝炎病毒相關肝細胞癌的相關性研究[D];山西醫(yī)科大學;2016年

3 邱警鋒;乙肝表面抗原水平在乙肝相關性肝細胞癌根治術后預后的研究[D];廣西醫(yī)科大學;2016年

4 羅磊;乙型病毒性肝炎相關性肝細胞癌T淋巴細胞受體譜系初步研究[D];新鄉(xiāng)醫(yī)學院;2016年

5 李包根;Ⅱ型毛玻璃樣肝細胞在乙肝相關型肝細胞癌癌旁組織中的表達及意義[D];南昌大學醫(yī)學院;2015年

6 陳輝;乙型肝炎病毒影響肝細胞干擾素誘生的初步研究[D];復旦大學;2008年

7 楊霞;乙型肝炎病毒X基因C1485T變異與肝細胞癌發(fā)生相關性研究[D];山東大學;2009年

8 潘亞杰;肝脂肪酸結合蛋白在乙型肝炎相關性肝細胞癌中的作用及機制[D];中南大學;2014年

9 呂維紅;肝細胞凋亡相關蛋白FasL與乙肝病毒感染相關性研究[D];青島大學;2005年

10 項文清;乙肝病毒X蛋白誘導白介素6的表達依賴MyD88信號通路[D];浙江大學;2010年

，

本文編號：1765302