本文選題：轉(zhuǎn)移性肝細(xì)胞癌 + 差異基因表達(dá)�。� 參考：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年04期

【摘要】：本研究旨在篩選與乙肝陽性轉(zhuǎn)移性肝細(xì)胞癌相關(guān)的基因并揭示其潛在的分子機(jī)制。利用GEO數(shù)據(jù)庫中GSE364數(shù)據(jù)集,篩選在肝內(nèi)擴(kuò)散轉(zhuǎn)移組和門靜脈癌栓轉(zhuǎn)移組都差異表達(dá)的基因,DAVID對差異表達(dá)基因進(jìn)行GO與信號通路富集分析,并用STRING和Cytoscape構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò),隨后用mi Rwalk 2.0篩選可能參與肝細(xì)胞癌轉(zhuǎn)移的miRNAs,構(gòu)建miRNA-樞紐基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。之后使用Smoami R DB 2.0和c Bio Portal分析樞紐基因突變與circRNA和肝細(xì)胞癌預(yù)后的關(guān)系。我們獲得在肝內(nèi)擴(kuò)散轉(zhuǎn)移組和門靜脈癌栓轉(zhuǎn)移組都差異表達(dá)的基因701個(gè),富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因主要涉及血管生成和血管內(nèi)皮生長因子信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等信號通路。從構(gòu)建的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中獲得參與蛋白互作模式1的15個(gè)樞紐基因,GO分析發(fā)現(xiàn)其主要參與RNA加工、代謝、剪接等生物過程。構(gòu)建的miRNA-樞紐基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中有4個(gè)miRNA參與兩個(gè)樞紐基因的調(diào)控,此外肝細(xì)胞癌中SRSF1基因有突變并可轉(zhuǎn)錄為hsa_circ_0044757,SNRNP200基因突變與患者預(yù)后相關(guān)。本研究發(fā)現(xiàn)的差異表達(dá)基因和樞紐基因,有助于我們認(rèn)識乙肝相關(guān)性肝細(xì)胞癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,并可作為新的用于診斷和預(yù)后判斷的分子標(biāo)志物。
[Abstract]:The aim of this study was to screen genes associated with hepatitis B positive metastatic hepatocellular carcinoma (HCC) and to reveal its potential molecular mechanism.Using the GSE364 data set in GEO database, the differential expression genes were screened in both intrahepatic diffusive metastasis group and portal vein tumor thrombus metastasis group. The differentially expressed genes were enriched by go and signal pathway, and protein interaction network was constructed by STRING and Cytoscape.Then the miRNA-hinge gene regulatory network was constructed by using mi Rwalk 2.0 to screen the miRNA-pivot gene regulatory network that might be involved in the metastasis of hepatocellular carcinoma.Smoami R DB 2.0 and c Bio Portal were used to analyze the relationship between gene mutation and prognosis of circRNA and hepatocellular carcinoma.We obtained 701 differentially expressed genes in intrahepatic diffusion metastasis group and portal vein tumor thrombus metastasis group. Enrichment analysis revealed that these genes were mainly involved in signal pathways such as angiogenesis and vascular endothelial growth factor signal transduction.Fifteen pivotal genes involved in protein interaction mode 1 were obtained from the constructed protein interaction network. It was found that these genes were mainly involved in biological processes such as RNA processing, metabolism, splicing and so on.In the constructed miRNA-hinge gene regulatory network, four miRNA were involved in the regulation of two pivotal genes. In addition, the mutation of SRSF1 gene in hepatocellular carcinoma was related to the prognosis of patients.The differentially expressed genes and pivot genes found in this study are helpful for us to understand the molecular mechanism of Hepatitis B related hepatocellular carcinoma metastasis and can be used as new molecular markers for diagnosis and prognosis judgment.
【作者單位】： 桂林醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金地區(qū)基金(31660317) 廣西壯族自治區(qū)教育廳科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(YB2014269)共同資助
【分類號】：R512.62;R735.7

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 王家(馬龍),李紹白,楊大國,唐望先,過晉源;肝細(xì)胞癌與乙型肝炎病毒感染關(guān)系的再探討[J];臨床內(nèi)科雜志;1987年02期

2 Kew MC;程翠薇;;吸煙作為肝細(xì)胞癌的一個(gè)危險(xiǎn)因素——南非黑人病例對照研究[J];右江醫(yī)學(xué);1987年03期

3 李思翹;;丙型肝炎病毒感染對肝硬變患者構(gòu)成轉(zhuǎn)變?yōu)楦渭?xì)胞癌的危險(xiǎn)因素[J];國外醫(yī)學(xué)情報(bào);1992年12期

4 郭俊奇;郭玉敏;史潔;曹詠;;丙型肝炎病毒感染與肝細(xì)胞癌的關(guān)系[J];大連大學(xué)學(xué)報(bào);1993年03期

5 劉克洲,Dennin RH;肝細(xì)胞癌與丙型肝炎病毒感染關(guān)系的研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué)(流行病學(xué)傳染病學(xué)分冊);1995年03期

6 王義成;李建忠;;青島地區(qū)乙型肝炎病毒基因型分布及其與肝細(xì)胞癌的相關(guān)性[J];中國醫(yī)療前沿;2009年09期

7 袁偉雄;肖酰德;;乙型肝炎與肝細(xì)胞癌及藥物有關(guān)的肝細(xì)胞癌的鑒別診斷[J];廣東醫(yī)藥資料;1978年10期

8 楊紹基;;在慢性肝病臨床隨訪中發(fā)現(xiàn)肝細(xì)胞癌[J];國外醫(yī)學(xué)參考資料(內(nèi)科學(xué)分冊);1978年Z2期

9 岡部和彥 ,王地槐 ,劉德午;非甲非乙型肝炎和肝細(xì)胞癌[J];微生物學(xué)免疫學(xué)進(jìn)展;1989年02期

10 郭思源,王能進(jìn),張松平;性別與肝細(xì)胞癌關(guān)系的探討[J];新醫(yī)學(xué);1990年10期

相關(guān)會議論文 前2條

1 朱明華;祝峙;劉曉紅;林靜;曲建慧;陳穎;曹曉哲;王力;倪燦榮;;乙型肝炎病毒感染與肝細(xì)胞癌發(fā)生關(guān)系的分子病理學(xué)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會病理學(xué)分會2009年學(xué)術(shù)年會論文匯編[C];2009年

2 顧星;戚鵬;周飛國;吉強(qiáng);王皓;竇同海;趙云鵬;高春芳;;三個(gè)HCV相關(guān)HCC危險(xiǎn)因子與中國人HBV相關(guān)HCC的關(guān)聯(lián)分析[A];全國臨床免疫檢驗(yàn)研討會暨第六屆全國臨床免疫學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2009年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前1條

1 劉毅峰;姑息治療未占主導(dǎo)地位[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2003年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前7條

1 白蘭;乙肝病毒捕獲細(xì)胞因子和信號級聯(lián)以逃避宿主免疫并維持持續(xù)感染[D];武漢大學(xué);2014年

2 高霞;PNPLA3基因單核苷酸多態(tài)性及基因表達(dá)與乙肝病毒感染易感性及乙肝相關(guān)肝細(xì)胞癌的關(guān)聯(lián)性研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2016年

3 張海英;PNPLA3基因多態(tài)性與乙型肝炎病毒相關(guān)性肝細(xì)胞癌的相關(guān)性及其機(jī)制研究[D];青島大學(xué);2016年

4 劉雅明;高表達(dá)β2糖蛋白Ⅰ在乙型肝炎病毒入侵肝細(xì)胞初始環(huán)節(jié)中的作用研究[D];吉林大學(xué);2014年

5 王棟;乙型肝炎病毒介導(dǎo)載脂蛋白和NQO1對肝細(xì)胞脂肪化的作用及機(jī)制研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2013年

6 劉紅艷;慢性乙型肝炎患者肝細(xì)胞中調(diào)控HBV復(fù)制基因的篩選及作用機(jī)制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2012年

7 劉俊英;PHB表達(dá)與HBV感染關(guān)系及對細(xì)胞生理功能影響研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2013年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 徐斌;瞬時(shí)彈性測定評估慢性乙肝患者原發(fā)性肝細(xì)胞癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的研究[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2015年

2 邢時(shí)龍;2型糖尿病與乙型肝炎病毒相關(guān)肝細(xì)胞癌的相關(guān)性研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2016年

3 邱警鋒;乙肝表面抗原水平在乙肝相關(guān)性肝細(xì)胞癌根治術(shù)后預(yù)后的研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2016年

4 羅磊;乙型病毒性肝炎相關(guān)性肝細(xì)胞癌T淋巴細(xì)胞受體譜系初步研究[D];新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院;2016年

5 李包根;Ⅱ型毛玻璃樣肝細(xì)胞在乙肝相關(guān)型肝細(xì)胞癌癌旁組織中的表達(dá)及意義[D];南昌大學(xué)醫(yī)學(xué)院;2015年

6 陳輝;乙型肝炎病毒影響肝細(xì)胞干擾素誘生的初步研究[D];復(fù)旦大學(xué);2008年

7 楊霞;乙型肝炎病毒X基因C1485T變異與肝細(xì)胞癌發(fā)生相關(guān)性研究[D];山東大學(xué);2009年

8 潘亞杰;肝脂肪酸結(jié)合蛋白在乙型肝炎相關(guān)性肝細(xì)胞癌中的作用及機(jī)制[D];中南大學(xué);2014年

9 呂維紅;肝細(xì)胞凋亡相關(guān)蛋白FasL與乙肝病毒感染相關(guān)性研究[D];青島大學(xué);2005年

10 項(xiàng)文清;乙肝病毒X蛋白誘導(dǎo)白介素6的表達(dá)依賴MyD88信號通路[D];浙江大學(xué);2010年

，

本文編號：1765302