HBsAg、HBsAb陽(yáng)性慢性HBV感染者HBV基因多態(tài)性研究
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【摘要】:[目的]研究HBsAg、HBsAb雙陽(yáng)性的HBV感染者體內(nèi)HBV基因組準(zhǔn)種的分布特征,從HBV準(zhǔn)種異質(zhì)性角度探討HBsAg、HBsAb雙陽(yáng)性的發(fā)生機(jī)制。[方法]選擇HBsAg、HBsAb雙陽(yáng)性的慢性HBV感染者3例為實(shí)驗(yàn)組,單純HBsAg陽(yáng)性的慢性HBV感染者2例為對(duì)照組。取入組患者的血清,提取血清HBV-DNA, PCR擴(kuò)增HBV-DNA全長(zhǎng),將PCR產(chǎn)物回收后進(jìn)行克隆,對(duì)陽(yáng)性克隆進(jìn)行HBV-DNA基因組測(cè)序,應(yīng)用生物信息學(xué)的方法分析實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組HBV準(zhǔn)種系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)、準(zhǔn)種復(fù)雜度、準(zhǔn)種多樣度等。比較兩組HBV準(zhǔn)種pre-S1、pre-S2和S蛋白上單個(gè)氨基酸的變異。比較兩組間HBV準(zhǔn)種HBcAg、LHBsAg及HBxAg的氨基酸變異指數(shù)和單個(gè)位點(diǎn)的熵值變化。并統(tǒng)計(jì)所有克隆株插入和缺失的情況。[結(jié)果]1.5例患者共獲得50株全長(zhǎng)克隆,每名患者8-13個(gè)克隆株。實(shí)驗(yàn)組中兩名患者為C基因型,一名患者為B基因型;對(duì)照組中B基因型和C基因型各一名。實(shí)驗(yàn)組患者的HBV全基因組準(zhǔn)種復(fù)雜度高于對(duì)照組患者。實(shí)驗(yàn)組患者的LHBsAg(氨基酸水平)和MHBsAg(核苷酸水平)功能區(qū)段的準(zhǔn)種復(fù)雜度高于對(duì)照組患者,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。2.系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析發(fā)現(xiàn)不同患者的準(zhǔn)種克隆株分別聚在一起,并且所有克隆株分基因型聚在一起。在C基因型準(zhǔn)種中,來(lái)自HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)的兩個(gè)患者聚在一起,與HBsAg陽(yáng)性的患者分離。3. HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)HBV準(zhǔn)種相對(duì)于HBsAg陽(yáng)性HBV準(zhǔn)種多樣度的最大凈變化值出現(xiàn)在HBx基因(d(aa)和dN)和CP/C基因(d(nt)和dS)。4.對(duì)于基因HBsAg“熱點(diǎn)變異”aa126,只有C基因型的患者N23有4個(gè)克隆株發(fā)生了該變異。C基因型的患者N24有3個(gè)克隆株發(fā)生了pre-S2上aa33位點(diǎn)的變異,B基因型的實(shí)驗(yàn)組患者所有克隆株均發(fā)生了該位點(diǎn)的變異,對(duì)照組所有克隆株均未發(fā)生該位點(diǎn)的變異。5.在LHBsAg中,B基因型和C基因型的實(shí)驗(yàn)組患者的熵值顯著高于相應(yīng)的對(duì)照組患者(秩和檢驗(yàn),p0.05)。對(duì)于C基因型的實(shí)驗(yàn)組患者,pre-C/C蛋白的熵值顯著低于對(duì)照組患者(秩和檢驗(yàn),p0.05), HBx蛋白的熵值顯著高于對(duì)照組患者(秩和檢驗(yàn),p0.05)。[結(jié)論]1.HBV以準(zhǔn)種的形式存在于感染者體內(nèi),HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)性者較單純HBsAg陽(yáng)性者的HBV準(zhǔn)種構(gòu)成更復(fù)雜。2.不同患者的準(zhǔn)種克隆株具有獨(dú)立的起源。在C基因型HBV準(zhǔn)種中,HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)患者HBV準(zhǔn)種可能具有相似的進(jìn)化模式。3.Pre-S2蛋白上aa33是重要的B淋巴細(xì)胞表位位點(diǎn),該位點(diǎn)的變異可能是引起HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)性的重要因素。4. HBsAg和HBsAb雙陽(yáng)性患者的HBV可能通過(guò)提高LHBsAg上抗原表位內(nèi)的氨基酸變異頻率,以改變LHBsAg抗原性和與抗體的結(jié)合力,從而導(dǎo)致HBsAg和HbsAb雙陽(yáng)性的出現(xiàn)。
【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R512.62
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1206872
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