本文關(guān)鍵詞：廣州地區(qū)鼻咽癌和健康人群中EB病毒BARF1和vIL-10基因多態(tài)性研究

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【摘要】：背景和目的EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)BARF1基因具有致癌潛能,在多數(shù)EBV相關(guān)上皮性腫瘤中表達(dá),在上皮性腫瘤中可能發(fā)揮重要作用。EBV BCRF1基因編碼的病毒白介素IL-10(v IL-10)與人IL-10(h IL-10)有高度同源性,具有免疫抑制活性,在EBV免疫逃逸和維持病毒的潛伏感染過程中發(fā)揮作用。我們以往對山東地區(qū)鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)、EBV相關(guān)胃癌和健康人群EBV基因多態(tài)性的檢測表明不同人群中BARF1和v IL-10基因變異存在一定的差異。本研究旨在了解我國NPC高發(fā)區(qū)廣州地區(qū)NPC和健康人群中BARF1和v IL-10基因變異特征,通過廣州地區(qū)和山東地區(qū)實驗數(shù)據(jù)的對比分析,進(jìn)一步探討B(tài)ARF1和v IL-10基因變異與NPC的相關(guān)性,為最終明確EBV基因多態(tài)性與EBV相關(guān)腫瘤的關(guān)系提供實驗依據(jù)。方法收集NPC高發(fā)區(qū)廣州地區(qū)NPC組織標(biāo)本和健康人群咽漱液(Throat washing,TW)標(biāo)本,提取DNA,采用PCR和DNA測序分別檢測BARF1和v IL-10基因序列,應(yīng)用DNAStar軟件對BARF1和v IL-10基因核苷酸及氨基酸(Amino acid,aa)序列進(jìn)行對比分析,應(yīng)用MEGA軟件繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹,同時與EBV標(biāo)準(zhǔn)株B95-8序列比較,根據(jù)兩種基因出現(xiàn)的特征性改變對變異進(jìn)行分類。比較NPC和健康人群之間以及廣州地區(qū)和山東地區(qū)之間BARF1和v IL-10基因變異型的分布情況。同時采用PCR結(jié)合酶切檢測EBV Bam HI F片段(F/f分型),并對Bam HI F、BARF1和v IL-10基因變異進(jìn)行連鎖分析。結(jié)果①廣州地區(qū)50例NPC和73例健康人群標(biāo)本成功擴(kuò)增BARF1基因并進(jìn)行測序。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹及特征性突變,出現(xiàn)共有錯義突變V29A的序列被分類為V29A變異型,與標(biāo)準(zhǔn)株B95-8 aa序列一致但出現(xiàn)共有同義突變t165545c(aa14)的被分類為B95-8t42c,與標(biāo)準(zhǔn)株B95-8 DNA序列一致或僅出現(xiàn)散在突變的被分類為B95-8P型。廣州地區(qū)NPC中B95-8t42c的檢出率(76.0%,38/50)高于健康人群(50.7%,37/73),差異有顯著性(χ2=7.992,P=0.005)。廣州地區(qū)NPC中B95-8t42c的檢出率高于山東地區(qū)NPC(26.4%,24/91),而V29A的檢出率(4.0%,2/50)低于山東地區(qū)(23.1%,21/91),差異有顯著性(χ2=32.856,P0.0001);廣州地區(qū)健康人群中B95-8t42c的檢出率高于山東地區(qū)(7.6%,6/79),差異有顯著性(χ2=34.726,P0.0001)。②廣州地區(qū)50例NPC和70例健康人群標(biāo)本成功完成v IL-10基因測序。42例(84.0%,42/50)NPC和60例(85.7%,60/70)健康人群標(biāo)本與B95-8 aa序列一致,分類為B95-8型;而8例(16.0%,8/50)NPC和10例(14.3%,10/70)健康人群標(biāo)本在信號肽區(qū)域發(fā)生aa突變,分類為SPM變異型。廣州地區(qū)NPC和健康人群之間v IL-10變異類型的分布無顯著性差異(χ2=0.067,P=0.795)。廣州地區(qū)v IL-10變異特點與山東地區(qū)類似,兩地區(qū)NPC之間以及健康人群之間v IL-10基因變異類型的分布均無顯著性差異(NPC:P=0.073;健康人群:P=0.691)。③廣州地區(qū)NPC中f型EBV的檢出率(70.9%,39/55)高于健康人群(39.4%,28/71),差異有顯著性(χ2=12.329,P=0.0004)。對F/f分型、BARF1和v IL-10變異均成功檢測且均為單一基因型的樣本序列連鎖分析發(fā)現(xiàn)了12種不同的連鎖基因型,其在NPC和健康人群之間的分布及兩地區(qū)之間的分布均不同(P0.0001)。Type f/B95-8c42t/B95-8在廣州地區(qū)NPC中的比率(62.0%,31/50)高于健康人群(32.8%,21/64),亦高于山東地區(qū)NPC(1.2%,1/81)。F型和f型EBV毒株中BARF1/v IL-10基因型的分布不同(P0.0001),廣州地區(qū)f型EBV主要對應(yīng)B95-8t42c/B95-8,占91.2%(52/57),而F型EBV則對應(yīng)多種變異類型。結(jié)論①廣州地區(qū)NPC和健康人群中BARF1基因變異與山東地區(qū)存在一定差異。B95-8t42c變異型是廣州地區(qū)BARF1的主要型別,可能與NPC尤其是高發(fā)區(qū)NPC相關(guān)。②廣州地區(qū)NPC和健康人群中v IL-10基因變異與山東地區(qū)類似,B95-8型是廣州地區(qū)v IL-10的主要型別,v IL-10變異可能與NPC無關(guān)。③Bam HI F、BARF1和v IL-10基因變異存在關(guān)聯(lián)性,廣州地區(qū)f型EBV主要對應(yīng)B95-8t42c/B95-8基因型,Type f/B95-8t42c/B95-8連鎖基因型在廣州地區(qū)NPC檢出率高,提示其與NPC相關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：EB病毒 BARF1 vIL-10 鼻咽癌 基因多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R739.63
【目錄】：

• 摘要2-4
• Abstract4-7
• 引言7-9
• 第一章 材料與方法9-14
• 1.1 儀器、試劑和耗材9
• 1.2 研究對象9-10
• 1.3 核酸提取10-12
• 1.4 BARF1和vIL-10基因序列多態(tài)性檢測12-13
• 1.5 BamHI F片段F/f分型檢測13
• 1.6 統(tǒng)計學(xué)分析13-14
• 第二章 結(jié)果14-28
• 2.1 BARF1序列多態(tài)性14-22
• 2.2 vIL-10基因序列多態(tài)性22-24
• 2.3 F/f分型檢測結(jié)果及與山東地區(qū)的比較24-25
• 2.4 BamHI F、BARF1和vIL-10基因變異連鎖分析25-28
• 第三章 討論28-33
• 研究結(jié)論33-34
• 參考文獻(xiàn)34-38
• 綜述38-51
• 參考文獻(xiàn)45-51
• 攻讀學(xué)位期間的學(xué)術(shù)成果51-52
• 致謝52-53

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李友瓊;張雪怡;曾健;陳巧林;李良菊;成靜;訾瑞峰;周天戟;;EB病毒BARF1基因表達(dá)對胃癌細(xì)胞株SGC7910生物學(xué)行為的影響[J];江蘇大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版);2009年03期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 于傳亭;EB病毒編碼的病毒白介素-10基因多態(tài)性研究[D];青島大學(xué);2013年

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本文編號：814512