本文關鍵詞：人肌球蛋白7A基因非同義單核苷酸多態(tài)性位點潛在致聾突變的預測分析

  更多相關文章： 人肌球蛋白A 非同義單核苷酸多態(tài)性 遺傳性耳聾 基因型 表型

【摘要】：目的:人肌球蛋白7A(MYO7A)基因是遺傳性耳聾分子篩查的候選基因之一。從已知的MYO7A非同義單核苷酸多態(tài)性(ns SNPs)位點數(shù)據(jù)庫中篩選可能與致病表型相關的ns SNPs位點,以提高MYO7A基因耳聾分子診斷的有效性和準確率。方法:首先,從NCBI數(shù)據(jù)中心的db SNP數(shù)據(jù)庫(db SNP)和Deafness Variation Database數(shù)據(jù)庫獲得MYO7A基因的SNPs數(shù)據(jù)和基因的相關信息;然后,通過SIFT、Poly Phen-2、PANTHER、Ph D-SNP、Mutation Taster、SNPGO和Mut Pred軟件進行ns SNPs表型致病性分析,預測潛在致病位點;接著,應用Clustal X2和Gene Doc軟件進行同源氨基酸序列比對,分析潛在致病的ns SNPs位點保守性;最后,應用Swiss Model平臺選擇性地對某些突變蛋白質的三維結構進行建模,并分析結構域的變化。結果:預測出MYO7A的104個高風險致病的ns SNPs位點,包括25個已報道的耳聾相關ns SNPs位點;高風險致病的ns SNPs位點中,有42個位于肌球蛋白馬達(myosin motor)結構域,其中12個預測有致病風險的ns SNPs位點與MYO7A基因致聾的突變研究報道一致。肌球蛋白馬達結構域中包含30個新預測的潛在致病性ns SNPs位點,其中僅L366P位點在7個預測軟件中具有高度一致性。通過對L366P位點位點突變前后的三維模型構建,發(fā)現(xiàn)存在蛋白結構的改變,且同源性比對結果顯示了該位點的高度保守性。結論:MYO7A的L366P為潛在高風險致病性ns SNP位點,推測該基因突變可能與耳聾表型相關。本研究所采用的分析篩選方法對MYO7A基因突變的臨床篩查及其他致病基因的ns SNPs篩選具有重要的參考價值。
【作者單位】： 南京醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院生物技術系;
【關鍵詞】： 人肌球蛋白A 非同義單核苷酸多態(tài)性 遺傳性耳聾 基因型 表型
【分類號】：R764.43
【正文快照】： 人肌球蛋白7A(myosinⅦA,MYO7A)基因是人類較常見的致聾基因,包含55個外顯子。MYO7A蛋白由2215個氨基酸殘基構成,包含多個復雜的結構域[肌球蛋白馬達(myosin motor)結構域、IQ1~IQ5結構域、SH3結構域、2個My TH結構域和2個FERM結構域]。免疫定位法發(fā)現(xiàn)MYO7A蛋白存在于內耳毛細

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本文編號：643631