目的本文主要探究鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)發(fā)生的潛在關(guān)鍵基因和信號(hào)通路。方法 通過(guò)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中2個(gè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)以及1個(gè)芯片數(shù)據(jù),總計(jì)包括57例鼻咽癌數(shù)據(jù)和9個(gè)正常對(duì)照組數(shù)據(jù),篩選出差異表達(dá)的基因,再進(jìn)行GO和KEGG等分析。結(jié)果篩選得到580個(gè)共有上調(diào)表達(dá)基因,52個(gè)共有下調(diào)表達(dá)基因。上調(diào)基因主要與表皮、腺體和皮膚等與上皮發(fā)育相關(guān)的信號(hào)通路有關(guān)。下調(diào)基因主要與白細(xì)胞凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)控、Notch信號(hào)通路等有關(guān)。利用蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選,結(jié)果顯示這些關(guān)鍵蛋白主要與G-蛋白耦合受體信號(hào)通路,趨化因子傳導(dǎo)信號(hào)通路等有關(guān)。結(jié)論通過(guò)聯(lián)合分析轉(zhuǎn)錄組和芯片數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了與鼻咽癌的發(fā)生有關(guān)的信號(hào)通路和關(guān)鍵基因,為鑒定鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展提供了重要依據(jù)。

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圖4蛋白互作網(wǎng)絡(luò)排名最高的模塊分析。

圖1轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)GSE68799、GSE4174以及芯片數(shù)據(jù)GSE64634差異基因分析。

圖2鼻咽癌高表達(dá)基因GO富集分析。

圖3鼻咽癌高表達(dá)基因信號(hào)通路分析。

本文編號(hào)：3886855