目的本文主要探究鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)發(fā)生的潛在關(guān)鍵基因和信號通路。方法 通過GEO數(shù)據(jù)庫中2個轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)以及1個芯片數(shù)據(jù),總計包括57例鼻咽癌數(shù)據(jù)和9個正常對照組數(shù)據(jù),篩選出差異表達的基因,再進行GO和KEGG等分析。結(jié)果篩選得到580個共有上調(diào)表達基因,52個共有下調(diào)表達基因。上調(diào)基因主要與表皮、腺體和皮膚等與上皮發(fā)育相關(guān)的信號通路有關(guān)。下調(diào)基因主要與白細胞凋亡過程的負調(diào)控、Notch信號通路等有關(guān)。利用蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選,結(jié)果顯示這些關(guān)鍵蛋白主要與G-蛋白耦合受體信號通路,趨化因子傳導(dǎo)信號通路等有關(guān)。結(jié)論通過聯(lián)合分析轉(zhuǎn)錄組和芯片數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了與鼻咽癌的發(fā)生有關(guān)的信號通路和關(guān)鍵基因,為鑒定鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展提供了重要依據(jù)。

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圖4蛋白互作網(wǎng)絡(luò)排名最高的模塊分析。

圖1轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)GSE68799、GSE4174以及芯片數(shù)據(jù)GSE64634差異基因分析。

圖2鼻咽癌高表達基因GO富集分析。

圖3鼻咽癌高表達基因信號通路分析。

本文編號：3886855