目的:本研究對(duì)非動(dòng)脈炎性前部缺血性視神經(jīng)病變患者與健康正常人血樣進(jìn)行高通量測序并對(duì)其轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選出差異表達(dá)的LncRNA并分析其表達(dá)譜,研究LncRNA與NAION發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,以期發(fā)現(xiàn)可作為NAION診斷與治療靶點(diǎn)的Lnc RNA。方法:提取6例NAION患者和5例健康對(duì)照組外周血細(xì)胞中RNA,應(yīng)用高通量測序方法進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,篩選出差異表達(dá)的LncRNA,并對(duì)得到的LncRNA進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜分析,通過生物信息學(xué)方法對(duì)差異表達(dá)的LncRNA進(jìn)行功能分析、聚類分析和生物學(xué)預(yù)測。根據(jù)生物信息學(xué)結(jié)果,經(jīng)qRT-PCR技術(shù)進(jìn)一步驗(yàn)證篩選出的Lnc RNA的表達(dá)情況。結(jié)果:(1)通過高通量測序,發(fā)現(xiàn)NAION患者外周血中996個(gè)表達(dá)差異顯著的LncRNA。其中上調(diào)LncRNA有317個(gè),下調(diào)Lnc RNA有679個(gè)(變化倍數(shù)>2倍(2)通過GO數(shù)據(jù)庫分析,差異表達(dá)的LncRNA參與NAION相關(guān)的多種生物學(xué)過程,如細(xì)胞凋亡,脂質(zhì)代謝,MAPK信號(hào)通路,炎癥反應(yīng),氧化應(yīng)激等。(3)經(jīng)qRT-PCR方法將篩選出的6個(gè)Lnc RNA在細(xì)胞水平進(jìn)行表達(dá)驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)與基因芯片檢測結(jié)果...

【文章頁數(shù)】：39 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 材料和方法
    2.1 主要試劑和儀器設(shè)備
        2.1.1 主要試劑
        2.1.2 主要儀器設(shè)備
    2.2 研究對(duì)象和分組
        2.2.1 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
    2.3 提取外周血RNA
    2.4 基因芯片數(shù)據(jù)分析
    2.5 熒光定量PCR驗(yàn)證
    2.6 GO和 KEGG富集分析
    2.7 共表達(dá)分析
3 結(jié)果
    3.1 測序結(jié)果匯總統(tǒng)計(jì)
    3.2 基因表達(dá)差異分析
    3.3 差異基因GO富集分析
    3.4 差異基因KEGG富集分析
    3.5 互作網(wǎng)絡(luò)
    3.6 qRT-PCR驗(yàn)證差異表達(dá)的Lnc RNA
4 討論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡歷



本文編號(hào)：3806074