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NPC患者轉移相關lncRNAs表達分析

發(fā)布時間:2021-12-16 13:56
  目的發(fā)現和鑒定在NPC轉移與非轉移患者中差異表達的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs),并預測它們潛在的生物學功能。方法利用高通量測序技術分別檢測2位非轉移性NPC患者及3位轉移性NPC患者血清中l(wèi)ncRNAs的表達情況,并通過基因本體(GO)及京都基因和基因組百科全書(KEGG)通路分析并預測lncRNAs潛在的生物學機制。結果與非轉移性NPC患者血清比較,轉移組中有2條高表達及12條低表達的lncRNAs(P<0.05)。其中在轉移組中低表達的lncRNA ENST00000610778差異倍數較大。這些lncRNAs對應的周圍編碼蛋白質的基因富集于翻譯、核糖體大亞基組裝、病毒轉錄等生物學過程及核糖體通路。結論在轉移與非轉移NPC患者血清中,存在差異表達的lncRNAs,它們可能具有特定的生物學功能,成為轉移性NPC診治的新靶標。

【文章來源】: 安徽醫(yī)科大學學報. 2020,55(11)北大核心

【文章頁數】:5 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 標本收集
    1.2 RNA提取和鑒定
    1.3 文庫構建
    1.4 文庫質檢
    1.5 上機測序
    1.6 測序數據分析和基因功能分析
    1.7 統(tǒng)計學處理
2 結果
    2.1 文庫質量評估及測序數據質量控制
    2.2 lncRNAs相應基因的GO分析
    2.3 lncRNAs周圍對應mRNAs的KEGG通路分析
3 討論



本文編號:3538254

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