RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表達(dá)及其臨床意義分析
發(fā)布時(shí)間:2017-05-06 21:15
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【摘要】:目的喉癌是最常見的頭頸部腫瘤之一,其分子機(jī)制仍未明確,因此,從分子水平上進(jìn)行喉癌發(fā)生、發(fā)展機(jī)制的研究將為喉癌的診治提供新的方向。最近的研究表明,lnc RNA在腫瘤發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中扮演重要角色。既往有研究發(fā)現(xiàn)lnc RNA與頭頸部腫瘤關(guān)系密切,但缺乏喉癌相關(guān)lnc RNA的研究,尤其喉癌相關(guān)的lnc RNA表達(dá)譜仍是空白。發(fā)現(xiàn)并鑒定與喉癌相關(guān)的lnc RNA對(duì)于提高我們對(duì)喉癌發(fā)病機(jī)制的認(rèn)識(shí)將有重要的意義。本研究擬先揭示喉癌相關(guān)lnc RNA表達(dá)譜,并探索RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表達(dá)及其臨床意義。方法1.用基因芯片技術(shù)比較喉癌組織、癌旁正常組織中l(wèi)nc RNA的表達(dá)譜,通過(guò)lnc RNA表達(dá)芯片,獲得喉癌相關(guān)lnc RNA表達(dá)圖譜并進(jìn)行基因本體(Gene Ontology,GO)分析。2.采用實(shí)時(shí)定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,q RT-PCR)檢測(cè)87對(duì)喉癌患者的喉癌組織和癌旁正常組織、淋巴結(jié)組織中l(wèi)nc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的表達(dá)情況。3.通過(guò)克隆測(cè)序技術(shù)證實(shí)PCR產(chǎn)物中l(wèi)nc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的存在。4.分析lnc RNA RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001表達(dá)水平與喉癌患者臨床病理因素、生存時(shí)間的關(guān)系,揭示其可能的臨床意義。結(jié)果1.通過(guò)基因芯片分析喉癌相關(guān)lnc RNA表達(dá)譜,我們發(fā)現(xiàn)了684種lnc RNA在喉癌組織中表達(dá)上調(diào)差異2倍,747種lnc RNA在喉癌組織中表達(dá)下調(diào)差異2倍。2.RP11-169D4.1-001在芯片結(jié)果中表達(dá)上調(diào)5.26倍(P=0.002),AC026166.2-001在芯片表達(dá)譜中表達(dá)下調(diào)13.01倍(P=0.008)。3.RP11-169D4.1-001在喉癌組織中顯著低表達(dá)(P0.001),且在轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)中顯著低表達(dá)(P0.05)。伴隨淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者RP11-169D4.1-001表達(dá)水平顯著低于不伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移患者(P=0.007)。RP11-169D4.1-001在腫瘤組織中的表達(dá)水平和年齡、腫瘤位置、病理類型、吸煙史無(wú)顯著相關(guān)性。4.與癌旁正常組織比較發(fā)現(xiàn),AC026166.2-001在喉癌組織中顯著低表達(dá)(P0.05),且在轉(zhuǎn)移淋巴結(jié)中顯著低表達(dá)(P0.001)。AC026166.2-001在腫瘤組織中的表達(dá)水平和年齡、腫瘤位置、病理類型、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、吸煙史無(wú)顯著相關(guān)性。5.結(jié)合生存曲線分析,RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在腫瘤組織中的表達(dá)水平和生存時(shí)間相關(guān)(P0.05)。結(jié)論本研究是國(guó)內(nèi)外首個(gè)較系統(tǒng)研究喉鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)lnc RNA表達(dá)譜的研究。RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中可能起重要作用,為喉癌的診斷和靶向治療提供思路,并為喉鱗狀細(xì)胞癌的預(yù)后判斷提供新線索。
【關(guān)鍵詞】:喉癌 長(zhǎng)鏈非編碼RNA 表達(dá)譜 RP11-169D4.1-001 AC026166.2-001
【學(xué)位授予單位】:寧波大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R739.65
【目錄】:
- 摘要5-7
- Abstract7-11
- 引言11-13
- 1 研究?jī)?nèi)容和技術(shù)路線13-15
- 1.1 研究?jī)?nèi)容13-14
- 1.1.1 建立喉鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)lnc RNA的表達(dá)譜13
- 1.1.2 基因克隆測(cè)序技術(shù)驗(yàn)證q RT-PCR產(chǎn)物13
- 1.1.3 分析喉癌組織中RP11-169D4.1-001的表達(dá)水平與臨床意義13
- 1.1.4 分析喉癌組織中AC026166.2-001的表達(dá)水平與臨床意義13-14
- 1.2 技術(shù)路線14-15
- 2 材料與方法15-23
- 2.1 材料15-17
- 2.1.1 主要儀器設(shè)備15
- 2.1.2 主要試劑15-16
- 2.1.3 入組的患者情況16-17
- 2.1.4 患者知情同意情況17
- 2.2 方法17-23
- 2.2.1 組織樣本的收取與保存17-18
- 2.2.2 總RNA定量與純度分析18
- 2.2.3 lnc RNA表達(dá)芯片分析18
- 2.2.4 研究差異表達(dá)lnc RNA所涉及的GO條目分析18
- 2.2.5 實(shí)時(shí)定量RT-PCR引物合成18-19
- 2.2.6 q RT-PCR技術(shù)檢測(cè)lnc RNA的水平19-21
- 2.2.7 PCR產(chǎn)物純化21-22
- 2.2.8 克隆測(cè)序22
- 2.2.9 統(tǒng)計(jì)分析22-23
- 3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果23-37
- 3.1 建立喉鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)的lnc RNA的表達(dá)譜23-26
- 3.2 差異表達(dá)lnc RNA所涉及的GO條目分析26-27
- 3.3 RP11-169D4.1-001在喉癌芯片表達(dá)譜中的表達(dá)情況27-28
- 3.4 RP11-169D4.1-001在喉癌組織大樣本中的表達(dá)水平28-29
- 3.5 AC026166.2-001喉癌芯片表達(dá)譜中的表達(dá)情況29-30
- 3.6 AC026166.2-001在喉癌組織大樣本中的表達(dá)水平30-31
- 3.7 對(duì)RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序31-32
- 3.8 RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001的表達(dá)水平與喉癌患者臨床病理因素的關(guān)系32-34
- 3.9 RP11-169D4.1-001和AC026166.2-001的表達(dá)水平和生存時(shí)間的關(guān)系34-37
- 4 討論37-40
- 5 結(jié)論40-41
- 參考文獻(xiàn)41-43
- 附錄A 綜述43-60
- 參考文獻(xiàn)54-60
- 附錄B 縮略詞60-61
- 在學(xué) 研究成果61-62
- 致謝62
【參考文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 胡安;金曉杰;;mir-21與mir-375在喉鱗狀細(xì)胞癌中的表達(dá)[J];臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志;2012年18期
本文關(guān)鍵詞:RP11-169D4.1-001、AC026166.2-001在喉癌中的表達(dá)及其臨床意義分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):349173
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