眼睛是視覺系統(tǒng)的器官,具有接收和處理視覺細節(jié)的能力。它們檢測到光信號后將其轉換為神經(jīng)元中的電化學脈沖,然后傳遞給大腦。先前的一些研究已經(jīng)揭示了視網(wǎng)膜內的細胞類型,但是,并沒有研究聚焦于眼球中的細胞類型以及它們在視覺系統(tǒng)中的作用。此外,還存在著許多遺傳性眼睛疾病,對于這些疾病的研究與認知尚需加深。在本文中,我們使用單細胞RNA測序的手段來處理實驗小鼠,通過剝取所需的實驗小鼠鞏膜以內眼睛組織,將其制備成單細胞懸液,進行單細胞RNA測序。獲得實驗數(shù)據(jù)后,我們對實驗組中表達量較高的基因進行了分析,并查閱相關文獻,找出了眼睛組織里不同的細胞類型已經(jīng)被報道過的標記基因和富集表達的基因。此外,我們將對照組小鼠鞏膜以內眼睛組織進行冰凍切片來做抗體驗證實驗,并重復相關驗證實驗,來了解不同的標記基因在眼睛組織各部位的表達情況,以期找到鞏膜以內眼睛組織的新標記基因,綜合探討小鼠鞏膜以內眼睛組織的主要細胞類型及闡明與眼睛疾病相關的視覺生物學和基因表達模式。通過單細胞RNA測序,我們從實驗組中獲得了鞏膜以內眼睛組織的1831個單細胞以及18237個表達的基因。在數(shù)據(jù)分析中通過t分布隨機鄰域嵌入發(fā)現(xiàn)了14個不同的... 

【文章來源】：電子科技大學四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：42 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

通過t-SNE識別的14個細胞簇以及鑒定出的細胞類型利用LoupeCellBrowser軟件，我們分析了每個細胞的差異表達基因，并得到了顯著差異表達基因的heatmap(熱圖，熱圖可以展現(xiàn)數(shù)據(jù)的差異性，特別是面對

電子科技大學碩士學位論文4細胞的數(shù)量之和最高，約占細胞總數(shù)的58%。RGCs和αRGCs數(shù)量之和約占細胞總數(shù)的18%，是第二大的細胞簇。VECs數(shù)量最少，僅占細胞總數(shù)的1.2%。圖2-214種細胞類型中顯著差異表達基因的熱圖圖2-314種細胞類型中的一些新標志物和已知標志物本文的研究還證實了眼球中14種細胞類型的細胞標記（如圖2-3所示），例如文獻中報道過的視錐細胞標志物Opn1mw[1]、Arr3[2]和Pde6c[10]，此外，筆者發(fā)現(xiàn)候選標記基因Gnat2，Kcne2和Pgc在視錐細胞中也有特異性表達。在本研究中還可以證實RGCs的標記基因Thy1[5]，并發(fā)現(xiàn)候選標記基因Clec3b在RGCs中富集表達。對于晶狀體細胞標志物，除了Bfsp1[11]、Crygn[12]和其他已報道過的晶體蛋白家族基因外，還篩選出了候選標記基因Lctl。此外，筆者利用測序獲得的數(shù)據(jù)結果證實了αRGCs的標記基因Spp1[13]和Kcng4[13]，并發(fā)現(xiàn)候選標記基因Edn3在

電子科技大學碩士學位論文4細胞的數(shù)量之和最高，約占細胞總數(shù)的58%。RGCs和αRGCs數(shù)量之和約占細胞總數(shù)的18%，是第二大的細胞簇。VECs數(shù)量最少，僅占細胞總數(shù)的1.2%。圖2-214種細胞類型中顯著差異表達基因的熱圖圖2-314種細胞類型中的一些新標志物和已知標志物本文的研究還證實了眼球中14種細胞類型的細胞標記（如圖2-3所示），例如文獻中報道過的視錐細胞標志物Opn1mw[1]、Arr3[2]和Pde6c[10]，此外，筆者發(fā)現(xiàn)候選標記基因Gnat2，Kcne2和Pgc在視錐細胞中也有特異性表達。在本研究中還可以證實RGCs的標記基因Thy1[5]，并發(fā)現(xiàn)候選標記基因Clec3b在RGCs中富集表達。對于晶狀體細胞標志物，除了Bfsp1[11]、Crygn[12]和其他已報道過的晶體蛋白家族基因外，還篩選出了候選標記基因Lctl。此外，筆者利用測序獲得的數(shù)據(jù)結果證實了αRGCs的標記基因Spp1[13]和Kcng4[13]，并發(fā)現(xiàn)候選標記基因Edn3在


本文編號：3341102