目的使用RNA測序技術(shù)比較原發(fā)性開角型青光眼（POAG）與正常人小梁網(wǎng)組織基因表達(dá)譜的差異,探討POAG可能的基因?qū)W病因。方法實(shí)驗(yàn)組小梁網(wǎng)組織來自汕頭國際眼科中心行小梁切除術(shù)的3例POAG患者,對照組小梁網(wǎng)組織來自汕頭眼庫的2例非POAG供體眼球。提取2個(gè)組小梁網(wǎng)組織RNA進(jìn)行測序獲得基因表達(dá)譜,用R軟件包edgeR分析實(shí)驗(yàn)組與對照組基因表達(dá)的差異,用DAVID生物信息分析網(wǎng)站對差異基因進(jìn)行基因本體（GO）及功能注釋聚類分析。采用KOBAS 3.0進(jìn)行PANTHER富集通路分析,揭示POAG可能的基因?qū)W病因。結(jié)果 （1）RNA測序共得到28 821條基因,2個(gè)組間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的基因22條[錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率（FDR）<0.05],其中轉(zhuǎn)錄表達(dá)上升的基因1條,轉(zhuǎn)錄表達(dá)下降的基因21條;（2）表達(dá)差異的基因功能集中,生物學(xué)過程涉及角化、表皮發(fā)育、中間絲細(xì)胞骨架組織等,細(xì)胞成分涉及角蛋白絲、中間絲、細(xì)胞外泌體、觸珠蛋白-血紅蛋白復(fù)合體等,分子功能涉及結(jié)構(gòu)分子活性、細(xì)胞骨架結(jié)構(gòu)組成等;（3）與差異基因相關(guān)的PANTHER富集通路主要包括纖溶酶原激活級聯(lián)反應(yīng)、p38 MAPK、氧化應(yīng)激反應(yīng)及p53... 

【文章來源】：中華實(shí)驗(yàn)眼科雜志. 2020,38(08)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：7 頁


本文編號：3126997