目的探討轉(zhuǎn)錄因子SOX11在視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤（RB）中的表達(dá)及與其表達(dá)相關(guān)的基因和細(xì)胞通路。方法在美國國家生物技術(shù)信息中心的GEO數(shù)據(jù)庫中下載包含76例RB患者癌組織全mRNA表達(dá)譜的公共數(shù)據(jù)集gse59983。根據(jù)15個標(biāo)記基因表達(dá)情況將其分為細(xì)胞周期標(biāo)記基因組（組1）、椎光感受器標(biāo)記基因組（組2）及視桿光感受器標(biāo)記基因（組3）。組1、組2、組3分別包含26、4、46例患者。利用R2生物信息平臺（http://r2.amc.nl）分析gse59983公共數(shù)據(jù)集,觀察3組患者癌組織中SOX11的表達(dá),同時確定SOX11相關(guān)基因。根據(jù)基因相關(guān)性,繪制聚類熱圖,通過京都基因與基因組百科全書（KEGG）通路分析工具、基因注釋（GO）分析法對SOX11的相關(guān)基因及通路進(jìn)行初步分析。結(jié)果組1患者癌組織中SOX11表達(dá)明顯高于組2、組3,差異均有統(tǒng)計學(xué)意義（P<0.001）;組3患者癌組織中SOX11表達(dá)明顯高于組2,差異有統(tǒng)計學(xué)意義（P<0.001）。共檢測出與SOX11表達(dá)顯著相關(guān)的基因4524個;其中,正相關(guān)基因2139個,負(fù)相關(guān)基因2385個。篩選SOX11及與其關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的16... 

【文章來源】：中華眼底病雜志. 2020,36(06)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁


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