目的:通過生物信息學(xué)方法分析上皮細(xì)胞型和混合型葡萄膜黑色素瘤之間的差異表達(dá)基因及關(guān)鍵基因。方法:自GEO數(shù)據(jù)庫中下載基因芯片數(shù)據(jù)集GSE22138,從中篩選出上皮細(xì)胞型和混合型葡萄膜黑色素瘤之間的差異基因,通過DAVID數(shù)據(jù)庫對差異基因行功能富集分析;通過STRING及Cytoscape構(gòu)建蛋白-蛋白互作網(wǎng)絡(luò)并從中找出關(guān)鍵基因;cBioportal構(gòu)建關(guān)鍵基因的協(xié)作基因網(wǎng)絡(luò);應(yīng)用GEPIA數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵基因進行生存分析。結(jié)果:本研究共篩選到符合條件的差異基因241個。其中下調(diào)的基因116個和上調(diào)的125個。差異基因功能主要富集于細(xì)胞粘附、藥物反應(yīng)、凋亡的調(diào)控以及內(nèi)皮細(xì)胞的增殖等方面。共篩選出10個關(guān)鍵基因,生存分析顯示這些關(guān)鍵基因與葡萄膜黑色素瘤的預(yù)后有關(guān)。結(jié)論:通過生物信息學(xué)方法對差異基因和關(guān)鍵基因進行分析,有助于闡釋上皮細(xì)胞型和混合型葡萄膜黑色素瘤不同生物學(xué)特征及其機制。 

【文章來源】：國際眼科雜志. 2020,20(02)北大核心

【文章頁數(shù)】：7 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：2960068