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基于高通量蛋白組學的OSAHS發(fā)病機制的初步探討

發(fā)布時間:2020-12-29 18:00
  目的:本實驗通過高通量蛋白組學篩選出OSAHS患者相比于健康對照組血清中發(fā)生變化的生物蛋白因子,然后擴大樣本量,評估血清中上調(diào)/下調(diào)蛋白因子的表達與OSAHS病情嚴重程度之間的關(guān)系,分析其與PSG各參數(shù)之間的聯(lián)系。初步探究OSAHS的發(fā)病機制,及其與高血壓、脂代謝之間的關(guān)系,以期為臨床治療提供指導。方法:第一部分:OSAHS患者血清與對照組血清中蛋白質(zhì)組學定量分析:選取2018年8月至2018年12月就診與吉林大學第二醫(yī)院耳鼻喉科的OSAHS成年男性患者10例,同時選取10例健康成年男性作為對照組?崭共扇⊥庵莒o脈血,采用高通量蛋白組學定量分析方法,檢測OSAHS組相比于對照組血清中變化的生物蛋白分子,計算其上調(diào)/下調(diào)的比率。從中找出與OSAHS發(fā)病可能相關(guān)的上調(diào)/下調(diào)因子。第二部分:血清SOD、CAT表達水平與OSAHS發(fā)病的相關(guān)性分析:選取2018年12月至2019年11月就診于吉林大學第二醫(yī)院耳鼻喉科的OSAHS患者,根據(jù)PSG結(jié)果,選取33例中重度患者,同時選取在我院體檢中心的健康對照組25例。留取空腹外周靜脈血血清,采用比色法檢測血清中SOD、CAT濃度,用統(tǒng)計學軟件SPSS... 

【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:59 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于高通量蛋白組學的OSAHS發(fā)病機制的初步探討


圖2.1質(zhì)譜鑒定到肽段的長度分布??

譜圖,覆蓋度,質(zhì)譜,分子量


第.2章OSAHS患者血清及對照詛血清定量蛋白=.膚組學僉析??②蛋S質(zhì)覆蓋度與分子量的關(guān)系??如r下圖2.2所不,.蛋_的分子量與疆盡獻呈現(xiàn)負相關(guān)。.厲為分子量:絞太的??蛋白理論上能夠產(chǎn)生更多的酶解肽段,所以達到同樣的覆蓋率,大蛋每所需要??鑒定到的肽段更多a??100?1??£?90?-??I?8〇?-??^?70?-??I?60?-?〇??|?50?-?°?〇〇?。??|?40?-?〇?〇〇?<x?〇??,齡v。':。。。??£?l〇〇?▲〇&§〇?〇〇?oSoo?o??0?100?200?300?400??Protein?mass?[kDa]??圖2.?2質(zhì)譜鑒定到的蛋白分子量與覆蓋度的關(guān)系??③質(zhì)譜儀的質(zhì)量精度分布??如下圖2.3所示,絕大多數(shù)譜圖的一級質(zhì)量誤差在lOppm以內(nèi),符合軌??道阱質(zhì)譜的高精度特性。表明質(zhì)譜儀的質(zhì)量精度正常,不會由于質(zhì)暈偏差過大??而影響到蛋白的定性定量分析。譜圖匹配肽段的得分(表征肽段鑒定的可信度)??與質(zhì)量偏差的分布成負相關(guān)關(guān)系。因而得分越高,質(zhì)量偏差越校??13??

質(zhì)量圖,質(zhì)譜,蛋白,樣本


第2章OSAHS患者血清及對照組血清定量蛋白質(zhì)組學分析??305?-I??8°〇??1?邊??秦5?_??I?I?I?I?5?I?I?I?I??-20?-15?-10?-5?0?5?10?15?20??Peptide?mass?error?[ppm]??圖2.?3質(zhì)譜數(shù)據(jù)的質(zhì)量精度分布??(8)差異表達蛋白的計算??通過三次全蛋&的定:量重復實驗,分別得到了每個樣本在三次重復中的??定量值。第一步計算比較組中兩個樣本間蛋白的差異表達量,首先計算出每個??樣本在三次重復中定量值的平均值,然后再計算兩個樣本之間平均值的比值,??該比值作為比較組最終的差異表達量。第=步計算該蛋&在兩個樣本中的差??異表達顯著性P-value,首先將各個樣本的相對定量值。欤铮纾?(以使得數(shù)據(jù)符??合正態(tài)分布),然后用雙樣本雙尾T檢驗方法計算p-value。當p-value<0.05??時,以差異表達暈變化超過1.2作為顯著上調(diào)的變化閾值,小于1/1.2作為顯??著下調(diào)的變化閾值。??2.3結(jié)果??(1)?OSAHS組和對照組之間基本資料分析:兩組研宄對象年齡分布大??致相當,未見統(tǒng)計學差異。OSAHS組體重指數(shù)BMI高于對照組,P<0.05,差??異有統(tǒng)計孿意義(見表2.4)。??14??

【參考文獻】:
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本文編號:2946052

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