競爭性內(nèi)源RNA網(wǎng)絡(luò)識別喉癌復(fù)發(fā)中的特征性微小RNA和長鏈非編碼RNA
發(fā)布時間:2020-12-14 09:26
背景喉癌是耳鼻咽喉科最多見的癌癥之一,聲門型最為多見,鱗狀細胞癌是其主要病理類型。世界衛(wèi)生組織(world health organization,WHO)官方的數(shù)據(jù)表明,雖然喉癌發(fā)病率和死亡率略有下降,但其發(fā)病人數(shù)在全球范圍內(nèi)卻不斷上升。隨著對生活質(zhì)量要求的提高、研究的不斷深入和科技的發(fā)展,我們對于喉的功能保留和重建有了更高的追求,治療方案在不斷改進。然而,這些努力并沒有提高總體生存率,在美國,喉癌是為數(shù)不多的在過去40年內(nèi)5年生存率下降的腫瘤。復(fù)發(fā)是喉癌治療失敗的主要表現(xiàn),復(fù)發(fā)喉癌患者的預(yù)后非常差。了解喉癌發(fā)病、復(fù)發(fā)的分子機制,尋找分子的靶向位點,有助于制定新的、更有效的治療策略。目的鑒別喉癌復(fù)發(fā)中的特征性微小核糖核酸(microRNA,miRNA)和長鏈非編碼核糖核酸(long non-coding RNA,lncRNA),并研究其與喉癌復(fù)發(fā)相關(guān)的調(diào)控機制。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫和GEO數(shù)據(jù)庫下載復(fù)發(fā)和非復(fù)發(fā)的喉癌樣本數(shù)據(jù)。檢測差異表達的miRNA(differentially expressed microRNA,DE-miR)、差異表達的lncRNA(differentiall...
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
篩選得到的DEG、DE-lncR及DE-miR的表達值熱圖
表達的 miRNA,如表 3-4 所示,最終構(gòu)建出 4 個疾病特征性的 lncR 7 個 miRNA 之間的調(diào)控關(guān)系。構(gòu)建的 lncRNA-miRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)如圖示。網(wǎng)絡(luò)中方形和菱形的節(jié)點分別表示 lncRNA 和 miRNA,紅色和綠別表示顯著上調(diào)和下調(diào)表達。表 3-4. 復(fù)發(fā)相關(guān)的 lncRNA 靶向調(diào)控的顯著差異表達的 miRNATable 3-4. DE-lncRNAs and tageted DE-miRNAslncRNA Targeted miRNAsEMX2OS miR-184,miR-124HCG4 miR-1,miR-33b,miR-133aHOTAIR miR-33b,miR-1,miR-208a,miR-499,miR-124,miR-133aTTTY15 miR-33b,miR-124,miR-1
競爭性內(nèi)源RNA網(wǎng)絡(luò)識別喉癌復(fù)發(fā)中的特征性微小RNA和長鏈非編碼RNA 博士學(xué)位論文ACTC1 ALPI POU4F1 MGST1 XIRP1hsa-miR-184 SOX1 ZDHHC22 CLDN6 LMAN1L FMN2 TAC4 SHISA6hsa-miR-208aRGS7 MYOZ2 C17orf64 LTF TTN PIK3C2G FLRT3 PRUNE2 CLDN22 TRDN TMC5GABRA2 ATP1A2 DMRTC1 TECRL SHISA6 AGR3hsa-miR-33bSLC30A8 CALCA MKRN3 MDGA2 ADAMTS19 ABRA AWAT2 CHRNA1 MAGEB1PPP1R3A PCP4 ADD2 SHISA6 IBSP SLC5A5 PKHD1 APOBEC2 AADACL3 VGLL2FGF5 OPCML MAGEA2 TSPY2 AMBN SLC1A6 C10orf82 CSMD3 CALCB MYPNTECRL MYOZ2 ZNF695 VWA3A EPO MYH1 DEFA5 ASB10 UPK1B PIK3C2GSLITRK4 KY FAM90A1 NEFL BEST3 NXF2 GDF6 CYP3A43 ANO4 DIRAS2 FAM9CTMEFF2 DLK1 BRDT ANKRD1 PTH2R GRIK2 NRK SERPINB11 TTN TSPY3MYO3A SCN5A BPY2 STATH HTN3 FMN2 CPNE4 MASP1 ZNF208
【參考文獻】:
期刊論文
[1]ABO blood group is a predictor of survival in patients with laryngeal cancer[J]. Ting Jin,Pei-Jing Li,Xiao-Zhong Chen,Wei-Han Hu. Chinese Journal of Cancer. 2016(12)
[2]miR-206 Inhibits Renal Cell Cancer Growth by Targeting GAK[J]. 衛(wèi)超,王珅,葉章群,陳志強. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2016(06)
[3]Competing endogenous RNA networks and gastric cancer[J]. Lei-Lei Guo,Chun-Hua Song,Peng Wang,Li-Ping Dai,Jian-Ying Zhang,Kai-Juan Wang. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
本文編號:2916199
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:109 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
篩選得到的DEG、DE-lncR及DE-miR的表達值熱圖
表達的 miRNA,如表 3-4 所示,最終構(gòu)建出 4 個疾病特征性的 lncR 7 個 miRNA 之間的調(diào)控關(guān)系。構(gòu)建的 lncRNA-miRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)如圖示。網(wǎng)絡(luò)中方形和菱形的節(jié)點分別表示 lncRNA 和 miRNA,紅色和綠別表示顯著上調(diào)和下調(diào)表達。表 3-4. 復(fù)發(fā)相關(guān)的 lncRNA 靶向調(diào)控的顯著差異表達的 miRNATable 3-4. DE-lncRNAs and tageted DE-miRNAslncRNA Targeted miRNAsEMX2OS miR-184,miR-124HCG4 miR-1,miR-33b,miR-133aHOTAIR miR-33b,miR-1,miR-208a,miR-499,miR-124,miR-133aTTTY15 miR-33b,miR-124,miR-1
競爭性內(nèi)源RNA網(wǎng)絡(luò)識別喉癌復(fù)發(fā)中的特征性微小RNA和長鏈非編碼RNA 博士學(xué)位論文ACTC1 ALPI POU4F1 MGST1 XIRP1hsa-miR-184 SOX1 ZDHHC22 CLDN6 LMAN1L FMN2 TAC4 SHISA6hsa-miR-208aRGS7 MYOZ2 C17orf64 LTF TTN PIK3C2G FLRT3 PRUNE2 CLDN22 TRDN TMC5GABRA2 ATP1A2 DMRTC1 TECRL SHISA6 AGR3hsa-miR-33bSLC30A8 CALCA MKRN3 MDGA2 ADAMTS19 ABRA AWAT2 CHRNA1 MAGEB1PPP1R3A PCP4 ADD2 SHISA6 IBSP SLC5A5 PKHD1 APOBEC2 AADACL3 VGLL2FGF5 OPCML MAGEA2 TSPY2 AMBN SLC1A6 C10orf82 CSMD3 CALCB MYPNTECRL MYOZ2 ZNF695 VWA3A EPO MYH1 DEFA5 ASB10 UPK1B PIK3C2GSLITRK4 KY FAM90A1 NEFL BEST3 NXF2 GDF6 CYP3A43 ANO4 DIRAS2 FAM9CTMEFF2 DLK1 BRDT ANKRD1 PTH2R GRIK2 NRK SERPINB11 TTN TSPY3MYO3A SCN5A BPY2 STATH HTN3 FMN2 CPNE4 MASP1 ZNF208
【參考文獻】:
期刊論文
[1]ABO blood group is a predictor of survival in patients with laryngeal cancer[J]. Ting Jin,Pei-Jing Li,Xiao-Zhong Chen,Wei-Han Hu. Chinese Journal of Cancer. 2016(12)
[2]miR-206 Inhibits Renal Cell Cancer Growth by Targeting GAK[J]. 衛(wèi)超,王珅,葉章群,陳志強. Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2016(06)
[3]Competing endogenous RNA networks and gastric cancer[J]. Lei-Lei Guo,Chun-Hua Song,Peng Wang,Li-Ping Dai,Jian-Ying Zhang,Kai-Juan Wang. World Journal of Gastroenterology. 2015(41)
本文編號:2916199
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/wuguanyixuelunwen/2916199.html
最近更新
教材專著