Waardenburg綜合征模型豬的血管紋發(fā)育及轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
發(fā)布時間:2020-12-13 02:14
Waardenburg綜合征2A型是一種常見的遺傳性耳聾,主要是由Mitf基因突變造成神經(jīng)嵴細(xì)胞來源的黑色素細(xì)胞發(fā)育不良、黑色素合成減少引起,表現(xiàn)為全身性的色素沉積不足,其中由于內(nèi)耳血管紋黑色素細(xì)胞源性的中間細(xì)胞(intermediate cells)缺失導(dǎo)致耳蝸內(nèi)淋巴電位消失,并繼發(fā)廣泛的毛細(xì)胞損傷,最終表現(xiàn)為重度感音神經(jīng)性耳聾。Mitf-M基因自發(fā)突變的模型豬與人類Waardenburg綜合征2A型表型一致,即色素缺失、聽覺功能和內(nèi)耳形態(tài)學(xué)與電生理學(xué)缺陷,其耳蝸發(fā)育與聽覺形成過程相較于小鼠模型更接近人類。本研究基于該模型開展耳蝸血管紋的形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)分析,為血管紋發(fā)育及損傷相關(guān)疾病的致病機(jī)理和干預(yù)途徑提供參考。血管紋是由邊緣細(xì)胞、中間細(xì)胞、基底細(xì)胞和毛細(xì)血管網(wǎng)等組成的高度血管化組織,在維持耳蝸內(nèi)電位、離子轉(zhuǎn)運(yùn)循環(huán)中發(fā)揮著重要作用,既往研究主要認(rèn)為Mitf具有支持中間細(xì)胞的存活、維持血管紋結(jié)構(gòu)完整的功能,但對于Mitf作為轉(zhuǎn)錄因子如何涉及血管紋功能和聽覺形成尚未深入的研究,因此本研究利用RNA-Seq測序方法、免疫熒光技術(shù)及電鏡等技術(shù),分析Mitf基因參與的生物學(xué)過程、通路及在形...
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?1為RNA-Seq相關(guān)性分析,R為pearson相關(guān)系數(shù)的平方
??2.豬血管紋差異基因富集的KEGG通路??差異基因表達(dá)的KEGG通路主要富集在:①PI3K-AKT信號通路??(mmu04151,PI3K-AKT?signaling?pathway),基因有/fop、/故從、/攻“5、??Co/7心、G_yW、Cb/義7、kmW、Cb/5?2、77zZx^、②細(xì)胞-基質(zhì)粘附??(Mmu04510,FocalAdhesion),基因有/&甲、/,g沾、/你zS、0?/7W、Cb/2“7、Cb/7d、??ZamW、Cb/5(z2、77^4、/^l;③蛋白質(zhì)消化吸收(Mmu04974,Protein?Digestion??And?Absorption),基因有Cb/7a7、Cb/77“7、d/p762、Cb/7?2、Mwe、??Cb/2“7、Cb/5fl2、④Ecm-受體相互作用(Mmu04512,Ecm-Receptor?Interaction),??基茵韋Ibsp、Itgb8、Itga8、Colla2、Col2al、Collal、Lambl、Col5a2、Thbs4、FnU??⑤代謝途徑(MmuOl?100,Metabolic?Pathways),基因有Dc/、dWW、CWc八?3>r、Cbx?、??Cox/、Jox/、CA/7〇。如圖?1.3所示。??
3.差異基因GO功能富集分析及KEGG信號通路的聚類分析??在DAVID數(shù)據(jù)庫中分析差異基因,得出GO功能及KEGG信號通路的聚類分析。如??圖1.4所示,可發(fā)現(xiàn)GO功能最主要富集在細(xì)胞組分的黑色素小體(G0:0042470)、黑??色素膜(G〇:0033162)、和生物學(xué)過程的黑色素分泌過程(G0:0042438)以及KEGG??通路的PI3K-AKT信號通路(_u04151)、細(xì)胞-基質(zhì)粘附(_u04510)、蛋白質(zhì)消化??吸收(mmu04974)、ECM-受體相互作用(mmu04512)。??19??
本文編號:2913700
【文章來源】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院北京市
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?1為RNA-Seq相關(guān)性分析,R為pearson相關(guān)系數(shù)的平方
??2.豬血管紋差異基因富集的KEGG通路??差異基因表達(dá)的KEGG通路主要富集在:①PI3K-AKT信號通路??(mmu04151,PI3K-AKT?signaling?pathway),基因有/fop、/故從、/攻“5、??Co/7心、G_yW、Cb/義7、kmW、Cb/5?2、77zZx^、②細(xì)胞-基質(zhì)粘附??(Mmu04510,FocalAdhesion),基因有/&甲、/,g沾、/你zS、0?/7W、Cb/2“7、Cb/7d、??ZamW、Cb/5(z2、77^4、/^l;③蛋白質(zhì)消化吸收(Mmu04974,Protein?Digestion??And?Absorption),基因有Cb/7a7、Cb/77“7、d/p762、Cb/7?2、Mwe、??Cb/2“7、Cb/5fl2、④Ecm-受體相互作用(Mmu04512,Ecm-Receptor?Interaction),??基茵韋Ibsp、Itgb8、Itga8、Colla2、Col2al、Collal、Lambl、Col5a2、Thbs4、FnU??⑤代謝途徑(MmuOl?100,Metabolic?Pathways),基因有Dc/、dWW、CWc八?3>r、Cbx?、??Cox/、Jox/、CA/7〇。如圖?1.3所示。??
3.差異基因GO功能富集分析及KEGG信號通路的聚類分析??在DAVID數(shù)據(jù)庫中分析差異基因,得出GO功能及KEGG信號通路的聚類分析。如??圖1.4所示,可發(fā)現(xiàn)GO功能最主要富集在細(xì)胞組分的黑色素小體(G0:0042470)、黑??色素膜(G〇:0033162)、和生物學(xué)過程的黑色素分泌過程(G0:0042438)以及KEGG??通路的PI3K-AKT信號通路(_u04151)、細(xì)胞-基質(zhì)粘附(_u04510)、蛋白質(zhì)消化??吸收(mmu04974)、ECM-受體相互作用(mmu04512)。??19??
本文編號:2913700
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