【摘要】：目的:越來越多的證據(jù)表明環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)在調(diào)節(jié)基因表達(dá)中發(fā)揮著重要作用,并且circRNA的異常表達(dá)已被證實與多種惡性腫瘤的發(fā)病存在相關(guān)性。然而circRNA在喉鱗狀細(xì)胞癌中的作用尚不明確。本研究應(yīng)用基因芯片技術(shù)檢測喉鱗狀細(xì)胞癌中circRNA的表達(dá)譜,以探尋在喉鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病過程中發(fā)揮潛在作用的circRNA。方法:運(yùn)用芯片技術(shù)檢測5例喉鱗狀細(xì)胞癌組織與5例正常喉黏膜組織中circRNA的表達(dá)情況。使用標(biāo)準(zhǔn)富集分析方法對產(chǎn)生差異表達(dá)circRNA的基因進(jìn)行信號通路分析,以預(yù)測相關(guān)circRNA的生物學(xué)功能。通過即時定量聚合酶鏈鎖反應(yīng)(qRT-PCR)檢測候選circRNA及其預(yù)測miRNA的表達(dá)水平。運(yùn)用生物信息學(xué)方法構(gòu)建circRNA-miRNA交互網(wǎng)絡(luò)以預(yù)測circRNA與miRNA的結(jié)合情況。結(jié)果:通過芯片技術(shù)檢測到喉鱗狀細(xì)胞癌和正常喉黏膜組織中存在506個差異表達(dá)的circRNA。qRT-PCR 結(jié)果證實 hsa circ 0044520 和 hsa circ 0044529 在喉鱗狀細(xì)胞癌組織中的表達(dá)存在顯著上調(diào)。hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p是hsa circ_0044520和hsa_circ_0044529的潛在靶miRNA。代謝/信號通路富集分析顯示hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529可能參與了膠原蛋白的合成過程。結(jié)論:競爭性內(nèi)源RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和生物信息學(xué)分析顯示:hsa circ_0044520和hsa_circ_0044529可能是通過 hsa-miR-4726-5p 和 hsa-miR-4640-5p 的“海綿作用”,在喉鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)病過程中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。
【圖文】：

向剪接而形成的內(nèi)源性非編碼ＲＮＡ邋（ｎｏｎｃｏｄｉｎｇＲＮＡ，ｎｃＲＮＡ），，在人類細(xì)胞中廣泛逡逑存在，在編碼基因的表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮著重要作用［９，邋１０］。目前的研究發(fā)現(xiàn)，生物體逡逑中的ｃｉｒｃＲＮＡ主要通過三種方式發(fā)揮作用（圖１）邐［１１］：邋（１）順式調(diào)控宿主基因的逡逑表達(dá)：通過ＲＮＡ－ＲＮＡ相互作用，影響轉(zhuǎn)錄機(jī)結(jié)構(gòu)和組成，特異性調(diào)控其宿主基因逡逑的表達(dá)［１２］；（２）作為內(nèi)源性１＾

本文編號：2682405