本文選題：噪聲性聽力損失　切入點(diǎn)：下一代sRNA測(cè)序　出處：《現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué)》2016年01期

【摘要】：目的通過(guò)噪聲性聽力損失(NIHL)耳蝸差異性mi RNA構(gòu)建的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),分析NIHL耳蝸的重要基因及功能,探討NIHL的損傷機(jī)制。方法 6只SPF及SD大鼠通過(guò)110 d B SPL(6 h/d、24 d)的高斯白噪聲暴露建立NIHL模型,6只SPF及SD大鼠非噪聲暴露作對(duì)照,噪聲暴露后7 d取實(shí)驗(yàn)大鼠耳蝸組織進(jìn)行s RNA深度測(cè)序,分析差異性表達(dá)的mi RNA,以差異最顯著的8個(gè)mi RNA依據(jù)靶基因數(shù)據(jù)庫(kù)Target Scan、mi Randa和mi RDB共同預(yù)測(cè)的靶基因建立差異性表達(dá)mi RNA的靶基因集,結(jié)合蛋白互作數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建mi RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),統(tǒng)計(jì)網(wǎng)絡(luò)中每個(gè)基因相連基因的個(gè)數(shù),確定相連基因個(gè)數(shù)大于30的基因作為NIHL大鼠耳蝸的重要基因,通過(guò)Gene Cards數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)重要基因進(jìn)行功能注釋。結(jié)果 (1)噪聲暴露組大鼠永久性聽閾位移水平(PTS)明顯高于對(duì)照組(秩和檢驗(yàn):Z值-2097,P0.01);(2)s RNA測(cè)序結(jié)果顯示2組耳蝸差異性mi RNA有148個(gè)[|log2(Fold Change)|1],差異性最顯著的8個(gè)mi RNA為:rno-mi R-378b、rno-mi R-211-5p、rno-mi R-133b-3p、rno-mi R-29c-3p、rno-let-7c-2-3p、rno-mi R-674-5p、rno-mi R-495、rno-mi R-3068-3p;(3)mi RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的重要基因有11個(gè):VEGFA、TNF、EGFR、FOS、NR3C1、AGT、CREBBP、PTK2、CD44、STAT3、IGF1。結(jié)論 NIHL大鼠耳蝸的11個(gè)重要基因通過(guò)調(diào)控細(xì)胞增殖與分化、控制細(xì)胞凋亡、改善組織細(xì)胞營(yíng)養(yǎng)代謝、介導(dǎo)組織炎性反應(yīng)以改善和修復(fù)耳蝸組織細(xì)胞。
[Abstract]:Objective to analyze the important genes and functions of NIHL cochlea and explore the mechanism of NIHL damage by using the gene regulatory network constructed by the difference mi RNA of noise-induced hearing loss (NHL) cochlea.Methods six SPF and SD rats were exposed to white noise at 110d B SPL(6 / dago for 24 days to establish NIHL model. Six SPF and SD rats were exposed to non-noise as control. Cochlear tissues of experimental rats were taken 7 days after noise exposure for deep sequencing of s RNA.Based on the target genes predicted by Target Scanmi Randa and mi RDB, the target gene sets of differentially expressed mi RNA were established by using the 8 miRNAs with the most significant difference. The regulatory network of mi RNA was constructed by combining the protein interaction database with the target genes predicted by Target Scanmi Randa and mi RDB.The number of genes connected to each gene in the network was counted, and the genes with more than 30 connected genes were identified as important genes in cochlea of NIHL rats. The important genes were annotated by Gene Cards database.Results (1) the permanent threshold displacement level of noise exposure group was significantly higher than that of the control group (rank sum test: Z value -2097 P0.01P0.01P0.01) RNA sequencing results showed that the cochlear difference mi RNA of the two groups was 148 [log2(Fold change] 1. The most significant difference of 8 mi RNA was: 1: rno-mi.Conclusion 11 important genes of NIHL rat cochlea can regulate cell proliferation and differentiation, control cell apoptosis, improve nutrient metabolism of tissue cells, and mediate inflammatory response in order to improve and repair cochlear histocytes.
【作者單位】： 深圳龍崗區(qū)疾病控制中心;廣東藥學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院;廣州市職業(yè)病防治院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81202179) 廣東省自然科學(xué)基金(S2012040006490) 廣東藥學(xué)院科技處-附屬第一醫(yī)院聯(lián)合自然科學(xué)培育基金(GYFYLH201326)
【分類號(hào)】：R764

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本文編號(hào)：1696557