本文關(guān)鍵詞：基于miRNAs芯片的喉鱗狀細(xì)胞癌致癌機(jī)制的初步分析

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【摘要】：目的 miRNA芯片篩選與喉鱗狀細(xì)胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相關(guān)的差異miRNA s,結(jié)合生物信息學(xué)分析確定并進(jìn)一步驗(yàn)證具有診療價(jià)值的目標(biāo)miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片對(duì)5對(duì)LSCC組織及相應(yīng)的癌旁組織行差異miRNAs的篩選,原始數(shù)據(jù)上傳Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫(kù)。采用Mev軟件中配對(duì)方式t檢驗(yàn)進(jìn)行芯片探針的差異分析,經(jīng)Affymetrix Analysis Center分析后將差異探針轉(zhuǎn)換為差異表達(dá)的miRNAs;選擇我們前期工作確定的微小染色體維持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作為核心基因,采用Mirfocus數(shù)據(jù)庫(kù)生物信息學(xué)分析MCM4的調(diào)控miRNAs并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)確定目標(biāo)miRNAs;采用RT-PCR在另外21對(duì)LSCC組織及相應(yīng)的癌旁組織中驗(yàn)證目標(biāo)miRNAs。結(jié)果經(jīng)差異篩選分析,有127個(gè)差異表達(dá)的miRNAs,其中78個(gè)miRNAs在腫瘤組織中高表達(dá),49個(gè)miRNAs在腫瘤組織中低表達(dá);采用Mirfocus數(shù)據(jù)庫(kù)生物信息學(xué)分析參與核心基因MCM4的調(diào)控miRNAs并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn),確定高表達(dá)的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p為與MCM4調(diào)控作用相關(guān)的目標(biāo)miRNAs;hsa-miR-30a-5p為另一個(gè)潛在的目標(biāo)miRNA,且在腫瘤組織中低表達(dá);通過(guò)RTPCR驗(yàn)證這3個(gè)差異表達(dá)的目標(biāo)miRNAs與芯片篩選結(jié)果一致。結(jié)論基于miRNAs芯片篩選分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p對(duì)LSCC的發(fā)生發(fā)展具有重要調(diào)控作用,可作為潛在的診療靶點(diǎn)。
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科 耳鼻咽喉頭頸科學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(首都醫(yī)科大學(xué));內(nèi)蒙古自治區(qū)人民醫(yī)院耳鼻咽喉科;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院病理科 頭頸部分子病理診斷北京市重點(diǎn)試驗(yàn)室;
【基金】：北京市醫(yī)管局揚(yáng)帆計(jì)劃(XMLX201311) 北京市科委重點(diǎn)項(xiàng)目(Z141107002514003) 內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2015MS0834)聯(lián)合資助
【分類號(hào)】：R739.65
【正文快照】： 頭頸腫瘤是世界范圍內(nèi)第6常見(jiàn)的惡性腫瘤。據(jù)統(tǒng)計(jì),每年死于頭頸腫瘤的患者全球約有200 000人,其中90%為上皮源性m。而喉鱗狀細(xì)胞癌(laryngealx squamous cell carcinoma,LSCC)在頭頸部上皮來(lái)源H ^ 的原發(fā)惡性腫瘤中排第2位,也是最為常見(jiàn)的頭頸鱗狀細(xì)!胞癌(head and neck squam

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1152765