本文關鍵詞：基于miRNAs芯片的喉鱗狀細胞癌致癌機制的初步分析

  更多相關文章： 腫瘤 鱗狀細胞 微RNAs 芯片分析技術 計算生物學

【摘要】：目的 miRNA芯片篩選與喉鱗狀細胞癌(1aryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)形成相關的差異miRNA s,結合生物信息學分析確定并進一步驗證具有診療價值的目標miRNAs。方法AffymetrixGeneChipmiRNAArray3.0芯片對5對LSCC組織及相應的癌旁組織行差異miRNAs的篩選,原始數(shù)據(jù)上傳Gene Expression Omnibus數(shù)據(jù)庫。采用Mev軟件中配對方式t檢驗進行芯片探針的差異分析,經Affymetrix Analysis Center分析后將差異探針轉換為差異表達的miRNAs;選擇我們前期工作確定的微小染色體維持蛋白4(mini chromosome maintenance protein4,MCM4)作為核心基因,采用Mirfocus數(shù)據(jù)庫生物信息學分析MCM4的調控miRNAs并結合相關文獻確定目標miRNAs;采用RT-PCR在另外21對LSCC組織及相應的癌旁組織中驗證目標miRNAs。結果經差異篩選分析,有127個差異表達的miRNAs,其中78個miRNAs在腫瘤組織中高表達,49個miRNAs在腫瘤組織中低表達;采用Mirfocus數(shù)據(jù)庫生物信息學分析參與核心基因MCM4的調控miRNAs并結合相關文獻,確定高表達的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p為與MCM4調控作用相關的目標miRNAs;hsa-miR-30a-5p為另一個潛在的目標miRNA,且在腫瘤組織中低表達;通過RTPCR驗證這3個差異表達的目標miRNAs與芯片篩選結果一致。結論基于miRNAs芯片篩選分析得到的hsa-miR-183-5p、hsa-miR-24-3p及hsa-miR-30a-5p對LSCC的發(fā)生發(fā)展具有重要調控作用,可作為潛在的診療靶點。
【作者單位】： 首都醫(yī)科大學附屬北京同仁醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科 耳鼻咽喉頭頸科學教育部重點實驗室(首都醫(yī)科大學);內蒙古自治區(qū)人民醫(yī)院耳鼻咽喉科;首都醫(yī)科大學附屬北京同仁醫(yī)院病理科 頭頸部分子病理診斷北京市重點試驗室;
【基金】：北京市醫(yī)管局揚帆計劃(XMLX201311) 北京市科委重點項目(Z141107002514003) 內蒙古自治區(qū)自然科學基金面上項目(2015MS0834)聯(lián)合資助
【分類號】：R739.65
【正文快照】： 頭頸腫瘤是世界范圍內第6常見的惡性腫瘤。據(jù)統(tǒng)計,每年死于頭頸腫瘤的患者全球約有200 000人,其中90%為上皮源性m。而喉鱗狀細胞癌(laryngealx squamous cell carcinoma,LSCC)在頭頸部上皮來源H ^ 的原發(fā)惡性腫瘤中排第2位,也是最為常見的頭頸鱗狀細!胞癌(head and neck squam

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;放療和miRNAs兩者關系的研究進展(英文)[J];Chinese-German Journal of Clinical Oncology;2012年05期

2 王寧;黃辰;姚嘉宜;艾婷;李圍圍;付學海;宋麗萍;;肺癌相關miRNAs研究進展[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學;2012年05期

3 ;Identification of deregulated miRNAs and their targets in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Gastroenterology;2012年38期

4 William CS CHO;南娟;;miRNAs作為癌癥預測和預后標志物的巨大潛能[J];中國肺癌雜志;2013年01期

5 William CS CHO;南娟;丁燕;;miRNAs在肺癌中的作用[J];中國肺癌雜志;2009年12期

6 錢莘;丁金勇;敖緒軍;安江洪;陳正堂;;小鼠支氣管肺泡干細胞miRNAs表達譜的鑒定[J];腫瘤學雜志;2011年09期

7 楊衛(wèi)東;王歡;汪靜;;miRNAs:腫瘤診斷治療的潛在新型靶分子[J];現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學;2013年08期

8 濮龍軍;王晶;李鵬濤;董振;郭華榮;;miRNAs生物合成過程的調控[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學進展;2014年20期

9 廖世奇;梁瓊;曾家豫;陳樺;;miRNAs與腫瘤發(fā)生發(fā)展相關性研究的進展[J];甘肅醫(yī)藥;2009年05期

10 Jeffrey Liu;;microRNAs, an active and versatile group in cancers[J];International Journal of Oral Science;2011年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011醫(yī)學科學前沿論壇第十二屆全國腫瘤藥理與化療學術會議論文集[C];2011年

2 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中華醫(yī)學會腫瘤學分會第七屆全國中青年腫瘤學術會議——中華醫(yī)學會腫瘤學分會“中華腫瘤 明日之星”大型評選活動暨中青年委員全國遴選論文匯編[C];2011年

3 Wenyu Zhang;Yuan Zhuang;Xinhua Jing;Feng Guo;沈百榮;;Identification of novel miRNAs biomarkers for prostate cancer from gene expression data[A];第五屆全國生物信息學與系統(tǒng)生物學學術大會論文集[C];2012年

4 Mong-Hong Lee;;Identification of Radioresistant NPC Cells CNE-2R with Differentially Expressed miRNAs[A];2008年中國病理生理學會第十一屆腫瘤和第十二屆免疫專業(yè)委員會學術會議論文集[C];2008年

5 王金環(huán);;血漿游離miRNAs在惡性膠母瘤診療中作用的研究[A];天津市生物醫(yī)學工程學會第三十三屆學術年會論文集[C];2013年

6 Jinghua Li;Yaonan Zhang;Yuxiang Zhang;;MicroRNA-886-5p inhibits apoptosis by down-regulation of bax expression in human cervical carcinoma cells[A];中國生物化學與分子生物學會第十屆會員代表大會暨全國學術會議摘要集[C];2010年

7 Xiaoxia Liu;Li Liu;Qian Xu;Ping Wu;Xialin Zuo;Aimin Ji;;MicroRNA as a novel drug target for cancer therapy[A];2013年廣東省藥師周大會論文集[C];2013年

8 Yongzhan Nie;Xiaodi Zhao;Jun Tie;Xiaohua Li;Lin Xia;Haifeng Jin;Qiong Wu;Yongquan Shi;Kaichun Wu;Daiming Fan;;Dysregulation of miRNAs in Gastric Cancer[A];2012中國消化系疾病學術大會論文匯編[C];2012年

9 Wei Jiang;Xiaowen Chen;Mingzhi Liao;Xia Li;;Small molecule and miRNA network in human cancer and its application to miRNA pharmacogenomics[A];第五屆全國生物信息學與系統(tǒng)生物學學術大會論文集[C];2012年

10 陳杰;于雙妮;馬怡輝;趙武干;盧朝輝;;人胰腺癌中miRNAs的差異表達及部分功能研究[A];中華醫(yī)學會病理學分會2010年學術年會日程及論文匯編[C];2010年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 江尚;特異性miRNAs與前列腺癌發(fā)病密切相關[N];中國醫(yī)藥報;2007年

中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 陳毅鵬;酒精性肝病特異性miRNAs表達譜及下游調控基因研究[D];浙江大學;2014年

2 牛文洋;肝細胞癌血清特異miRNAs的篩選及其在診斷中的應用[D];第二軍醫(yī)大學;2011年

3 蔡輝;早期胃癌血清miRNAs篩選及其表達研究[D];蘭州大學;2013年

4 王佳;腸胃癌血清miRNAs診斷模型的建立和組織蛋白酶D增強胃癌細胞對順鉑敏感性的研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2014年

5 戴楠;雙功能基因APE1與miRNAs相互調控介導骨肉瘤放療敏感性的機制研究[D];第三軍醫(yī)大學;2013年

6 周瑞;調控小細胞肺癌侵襲轉移能力的miRNAs的鑒定及作用機制探討[D];華中科技大學;2014年

7 吳畏;鑒定直腸癌異常表達的miRNAs及其與惡性演進的關系[D];中南大學;2011年

8 梁雪;腫瘤相關miRNAs對樹突細胞壽命與功能的調控[D];南開大學;2013年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 朱珍;肝臟未分化胚胎性肉瘤的微衛(wèi)星雜合性缺失和miRNAs譜表達特征及其臨床病理學意義[D];第二軍醫(yī)大學;2012年

2 朱陳;血漿miRNAs作為胃癌早期生物標志物的臨床流行病學研究[D];南京醫(yī)科大學;2014年

3 田甜;miRNAs基因區(qū)域多態(tài)與肺癌易感性及預后關系的分子流行病學研究[D];南京醫(yī)科大學;2009年

4 康美云;循環(huán)miRNAs作為胃癌診斷潛在生物標志物的篩選[D];南京醫(yī)科大學;2014年

5 周美玉;肺癌95D與95C細胞株中轉移相關miRNAs的篩選研究[D];中南大學;2010年

6 徐燕梅;血漿miRNAs預測非小細胞肺癌患者放療敏感性的研究[D];第三軍醫(yī)大學;2014年

7 姜波;肺癌組織中調控puma基因的miRNAs的篩查和鑒定[D];昆明醫(yī)科大學;2012年

8 張宇;RNA加尾和引物延伸RT-PCR法實時定量檢測胃癌中miRNAs的表達[D];中國醫(yī)科大學;2009年

9 賈文慧;宮頸癌及子宮內膜癌血清miRNAs的研究[D];南京大學;2013年

10 劉帥帥;循環(huán)miRNAs檢測對肝癌診斷價值的meta分析[D];蚌埠醫(yī)學院;2015年

，

本文編號：1152765