PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究
發(fā)布時間:2022-01-23 20:03
乳腺癌是女性群體中發(fā)病率極高的惡性腫瘤,是多因素導(dǎo)致的復(fù)雜疾病,在乳腺癌發(fā)病機制的諸多理論中,遺傳因素扮演了非常重要的角色。機體內(nèi)的DNA修復(fù)系統(tǒng)對預(yù)防腫瘤的發(fā)生起著重要作用,DNA損傷修復(fù)基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是導(dǎo)致個體修復(fù)能力差異的重要原因,而DNA損傷修復(fù)能力存在的個體差異進一步?jīng)Q定了腫瘤易感性。因此,針對DNA損傷修復(fù)基因展開其基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究,探尋新的特異性分子標記對乳腺癌的早期診斷、治療具有重要意義。本研究對5個DNA損傷修復(fù)基因PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3進行SNPs基因分型,初步分析PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP與乳腺癌臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性,研究乳腺癌患者中PAPR1、OGG1、XRCC1、XRCC2、XRCC3的SNP位點不同基因型和單倍型與乳腺癌患病風(fēng)險之間的相關(guān)性,并探究基因不同SNP位點互作與乳腺癌患病風(fēng)險之間的相關(guān)性,為乳腺癌的早篩檢測和預(yù)后評估提供參考依據(jù)。利用Meta分析方法選擇出與乳腺癌易感性相關(guān)的5個...
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:103 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
連鎖不平衡熱圖
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究66交互作用,其中rs1805408與rs3219110間交互作用較強,rs1805408和rs3219110位點之間的交互對乳腺癌發(fā)病風(fēng)險可能具有重要影響。AC圖3-2PARP1基因三個tagSNP之間的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.圖解模型;B.MDR餅圖;C.MDR樹形圖3.5.1.2OGG1基因tagSNP之間的互作分析對OGG1兩個多態(tài)性位點rs2072668、rs1052133進行交互作用分析,從MDR結(jié)果可以看出(表3-9),兩個模型組合與乳腺癌易感性之間均不存在顯著關(guān)聯(lián)(P>0.05),因此,可推斷OGG1基因這兩個單核苷酸多態(tài)性位點之間不存在交互作用。B
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究67AC圖3-3XRCC1基因五個tagSNP之間的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.圖解模型;B.MDR餅圖;C.MDR樹形圖3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之間的互作分析本研究中選取了XRCC1基因5個多態(tài)性位點rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487進行了MDR分析。從表3-9中可以看出,在SNP位點交互模型中,交叉驗證一致性處于于5~10的區(qū)間,檢驗準確度值處于0.6364~0.6513區(qū)間。在5個組合中,XRCC1基因的rs3213263、rs3213356兩位點模型為多態(tài)性位點之間相互作用的最佳模型,其具有最高的檢驗準確度(64.77%)以及最大的交叉驗證一致性(Cross-validationconsistency=10),經(jīng)統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)rs3213263、rs1130409模型組合與乳腺癌易感性之間存在顯著關(guān)聯(lián)(P=0.0010),可推斷出XRCC1的兩個SNP位點之間可能存在著較強交互作用,并且該交互作用可能會升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型,雖然也都有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001),但是Cross-validationconsistency較低或預(yù)測誤差較高,B
本文編號:3605063
【文章來源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
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蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究66交互作用,其中rs1805408與rs3219110間交互作用較強,rs1805408和rs3219110位點之間的交互對乳腺癌發(fā)病風(fēng)險可能具有重要影響。AC圖3-2PARP1基因三個tagSNP之間的互作分析Figure3-2InteractionbetweenthreetagSNPsofPARP1A.圖解模型;B.MDR餅圖;C.MDR樹形圖3.5.1.2OGG1基因tagSNP之間的互作分析對OGG1兩個多態(tài)性位點rs2072668、rs1052133進行交互作用分析,從MDR結(jié)果可以看出(表3-9),兩個模型組合與乳腺癌易感性之間均不存在顯著關(guān)聯(lián)(P>0.05),因此,可推斷OGG1基因這兩個單核苷酸多態(tài)性位點之間不存在交互作用。B
蘭州大學(xué)碩士學(xué)位論文PARP1、OGG1、XRCC1、XRCC2和XRCC3基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的研究67AC圖3-3XRCC1基因五個tagSNP之間的互作分析Figure3-3InteractionbetweenfivetagSNPsofXRCC1A.圖解模型;B.MDR餅圖;C.MDR樹形圖3.5.1.3XRCC1基因tagSNP之間的互作分析本研究中選取了XRCC1基因5個多態(tài)性位點rs25489、rs3213263、rs3213356、rs3213266和rs25487進行了MDR分析。從表3-9中可以看出,在SNP位點交互模型中,交叉驗證一致性處于于5~10的區(qū)間,檢驗準確度值處于0.6364~0.6513區(qū)間。在5個組合中,XRCC1基因的rs3213263、rs3213356兩位點模型為多態(tài)性位點之間相互作用的最佳模型,其具有最高的檢驗準確度(64.77%)以及最大的交叉驗證一致性(Cross-validationconsistency=10),經(jīng)統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)rs3213263、rs1130409模型組合與乳腺癌易感性之間存在顯著關(guān)聯(lián)(P=0.0010),可推斷出XRCC1的兩個SNP位點之間可能存在著較強交互作用,并且該交互作用可能會升高乳腺癌的易感性。除此之外的其它模型,雖然也都有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001),但是Cross-validationconsistency較低或預(yù)測誤差較高,B
本文編號:3605063
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