基于含腦膠質(zhì)瘢痕臨床患者的全外顯子測序探究外傷性癲癇發(fā)病的遺傳學(xué)機制
發(fā)布時間:2021-02-03 10:24
目的:1、通過結(jié)合臨床上醫(yī)學(xué)影像學(xué)和腦電圖等表征手段,分析外傷性癲癇的主要病癥表現(xiàn),并探討腦膠質(zhì)瘢痕與外傷性癲癇的關(guān)系,為進一步深入系統(tǒng)地研究外傷性癲癇的發(fā)病機制尋找切入點。2、通過抽取外傷性癲癇患者的外周血,提取其中的DNA進行全外顯子測序,篩選與腦膠質(zhì)瘢痕和外傷性癲癇相關(guān)的變異基因,探討腦外傷膠質(zhì)瘢痕形成的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。方法:1、收集臨床上有明確外傷史,無癲癇病史的外傷性癲癇患者9名作為實驗組,非外傷性癲癇患者3名作為對照組,分別利用磁共振成像儀、腦電圖等醫(yī)學(xué)設(shè)備對患者的腦部進行成像定位,觀察分析手術(shù)前的腦膠質(zhì)瘢痕的形態(tài)及分布情況及手術(shù)切除的癲癇灶的病理染色特征。2、抽取外傷性癲癇患者的外周血,提取其中的DNA進行全外顯子測序,篩選出與外傷性癲癇和腦膠質(zhì)瘢痕相關(guān)的基因,并對篩選出的結(jié)果進行功能性富集和蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系的分析。結(jié)論:1、通過利用臨床醫(yī)學(xué)影像學(xué)的表征手段對患者腦部病灶部位的成像,我們觀察到了患者病灶部位的腦膠質(zhì)瘢痕的形態(tài)和分布情況,并對手術(shù)后癲癇灶切片的尺寸進行了測定,證實了腦膠質(zhì)瘢痕可以作為確診外傷性癲癇的切入點。2、通過對外傷性癲癇患者體內(nèi)的DNA進行全外顯子測序,...
【文章來源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉技術(shù)原理示意圖
17圖2.2全基因組外顯子區(qū)域DNA富集與測序分析技術(shù)原理示意圖本研究采用AgilentV660M外顯子靶向序列富集系統(tǒng)對人的外顯子序列進行捕獲。首先,對DNA進行純度、濃度和體積等方面的檢測;對符合質(zhì)量要求的DNA建立基因組測序文庫,形成片段化的基因組序列,該序列兩端包含測序接頭;基因組DNA文庫與探針進行雜交,通過互補配對原則,目標(biāo)基因組DNA片段與被生物素標(biāo)記的寡核苷酸探針結(jié)合形成雜交復(fù)合物;未與探針結(jié)合的基因組片段被洗脫純化,利用PCR擴增捕獲片段;對捕獲雜交后的文庫進行純度、濃度檢測。最后對檢測合格的測序文庫進行IlluminaHiSeq高通量測序。實驗流程如下圖2.3所示圖2.3全基因組外顯子高通量測序?qū)嶒灹鞒?
17圖2.2全基因組外顯子區(qū)域DNA富集與測序分析技術(shù)原理示意圖本研究采用AgilentV660M外顯子靶向序列富集系統(tǒng)對人的外顯子序列進行捕獲。首先,對DNA進行純度、濃度和體積等方面的檢測;對符合質(zhì)量要求的DNA建立基因組測序文庫,形成片段化的基因組序列,該序列兩端包含測序接頭;基因組DNA文庫與探針進行雜交,通過互補配對原則,目標(biāo)基因組DNA片段與被生物素標(biāo)記的寡核苷酸探針結(jié)合形成雜交復(fù)合物;未與探針結(jié)合的基因組片段被洗脫純化,利用PCR擴增捕獲片段;對捕獲雜交后的文庫進行純度、濃度檢測。最后對檢測合格的測序文庫進行IlluminaHiSeq高通量測序。實驗流程如下圖2.3所示圖2.3全基因組外顯子高通量測序?qū)嶒灹鞒?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]mTOR/4EBP1/HIF-1α/VEGF信號通路在哮喘小鼠肺組織中的表達及意義[J]. 王莉,張艷麗,王秀芳,宋哲,王偉. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2017(01)
[2]哺乳動物雷帕霉素靶蛋白異常激活區(qū)別Ⅱ型和Ⅰ型難治性癲癇相關(guān)性局灶性皮質(zhì)發(fā)育不良[J]. 林元相,林堃,康德智,葉忠興,王行富. 中華實驗外科雜志. 2012 (12)
[3]中國漢族瘢痕疙瘩家系的遺傳學(xué)特征研究[J]. 陳陽,高建華,劉曉軍. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2007(07)
[4]皮層注射氯化亞鐵建立外傷性癲癇動物模型[J]. 林元相廣州,徐如祥,姜曉丹,康德智,柯以銓,周谷蘭,杜謀選,蔡穎謙,秦玲莎. 中華神經(jīng)醫(yī)學(xué)雜志. 2006(04)
[5]腫瘤壞死因子-α及其受體在非特異性慢性腦炎及非腦炎相關(guān)難治性癲癇中的表達及其意義[J]. 林元相,葉忠興,康德智,林堃,王豐. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2013 (39)
碩士論文
[1]mTOR通路在氯化亞鐵誘導(dǎo)的外傷性癲癇大鼠模型額葉皮質(zhì)及海馬中的表達研究[D]. 王艮波.福建醫(yī)科大學(xué) 2015
本文編號:3016350
【文章來源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:90 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉技術(shù)原理示意圖
17圖2.2全基因組外顯子區(qū)域DNA富集與測序分析技術(shù)原理示意圖本研究采用AgilentV660M外顯子靶向序列富集系統(tǒng)對人的外顯子序列進行捕獲。首先,對DNA進行純度、濃度和體積等方面的檢測;對符合質(zhì)量要求的DNA建立基因組測序文庫,形成片段化的基因組序列,該序列兩端包含測序接頭;基因組DNA文庫與探針進行雜交,通過互補配對原則,目標(biāo)基因組DNA片段與被生物素標(biāo)記的寡核苷酸探針結(jié)合形成雜交復(fù)合物;未與探針結(jié)合的基因組片段被洗脫純化,利用PCR擴增捕獲片段;對捕獲雜交后的文庫進行純度、濃度檢測。最后對檢測合格的測序文庫進行IlluminaHiSeq高通量測序。實驗流程如下圖2.3所示圖2.3全基因組外顯子高通量測序?qū)嶒灹鞒?
17圖2.2全基因組外顯子區(qū)域DNA富集與測序分析技術(shù)原理示意圖本研究采用AgilentV660M外顯子靶向序列富集系統(tǒng)對人的外顯子序列進行捕獲。首先,對DNA進行純度、濃度和體積等方面的檢測;對符合質(zhì)量要求的DNA建立基因組測序文庫,形成片段化的基因組序列,該序列兩端包含測序接頭;基因組DNA文庫與探針進行雜交,通過互補配對原則,目標(biāo)基因組DNA片段與被生物素標(biāo)記的寡核苷酸探針結(jié)合形成雜交復(fù)合物;未與探針結(jié)合的基因組片段被洗脫純化,利用PCR擴增捕獲片段;對捕獲雜交后的文庫進行純度、濃度檢測。最后對檢測合格的測序文庫進行IlluminaHiSeq高通量測序。實驗流程如下圖2.3所示圖2.3全基因組外顯子高通量測序?qū)嶒灹鞒?
【參考文獻】:
期刊論文
[1]mTOR/4EBP1/HIF-1α/VEGF信號通路在哮喘小鼠肺組織中的表達及意義[J]. 王莉,張艷麗,王秀芳,宋哲,王偉. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2017(01)
[2]哺乳動物雷帕霉素靶蛋白異常激活區(qū)別Ⅱ型和Ⅰ型難治性癲癇相關(guān)性局灶性皮質(zhì)發(fā)育不良[J]. 林元相,林堃,康德智,葉忠興,王行富. 中華實驗外科雜志. 2012 (12)
[3]中國漢族瘢痕疙瘩家系的遺傳學(xué)特征研究[J]. 陳陽,高建華,劉曉軍. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2007(07)
[4]皮層注射氯化亞鐵建立外傷性癲癇動物模型[J]. 林元相廣州,徐如祥,姜曉丹,康德智,柯以銓,周谷蘭,杜謀選,蔡穎謙,秦玲莎. 中華神經(jīng)醫(yī)學(xué)雜志. 2006(04)
[5]腫瘤壞死因子-α及其受體在非特異性慢性腦炎及非腦炎相關(guān)難治性癲癇中的表達及其意義[J]. 林元相,葉忠興,康德智,林堃,王豐. 中華醫(yī)學(xué)雜志. 2013 (39)
碩士論文
[1]mTOR通路在氯化亞鐵誘導(dǎo)的外傷性癲癇大鼠模型額葉皮質(zhì)及海馬中的表達研究[D]. 王艮波.福建醫(yī)科大學(xué) 2015
本文編號:3016350
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