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基于生物信息學(xué)分析鑒定骨肉瘤相關(guān)的異常甲基化基因及其功能

發(fā)布時(shí)間:2021-01-30 00:03
  研究背景:骨肉瘤(osteosarcoma)是最常見的骨原發(fā)性惡性腫瘤。通過手術(shù)和化療的聯(lián)合治療,骨肉瘤患者的5年生存率已經(jīng)提高至大約70%,然而手術(shù)治療對肢體的功能有嚴(yán)重的影響,化療在治療患者的同時(shí)也伴隨著不同程度的副作用。為了提高骨肉瘤患者的早期診斷和預(yù)后水平,亟需找到新的治療靶點(diǎn)和用于診斷的生物標(biāo)記物。近年來,識別基因特異性甲基化的改變逐漸被應(yīng)用于癌癥的早期檢測和治療。找到與甲基化相關(guān)的生物標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)有助于提高患者的生存率。此外,生物信息學(xué)和基因測序的普及為找到新的靶點(diǎn)提供了良好的條件。目前與骨肉瘤相關(guān)的異常甲基化靶點(diǎn)仍然未被充分研究。所以,本研究旨在利用生物信息學(xué)分析尋找與骨肉瘤有顯著相關(guān)的更敏感、更特異的異常甲基化靶點(diǎn)和生物標(biāo)記物以提高骨肉瘤患者的早期診斷和預(yù)后。目的:本研究旨在通過綜合生物信息學(xué)分析鑒定與骨肉瘤發(fā)病機(jī)制相關(guān)的異常甲基化差異表達(dá)的生物標(biāo)記物。方法:第一部分:從GEO數(shù)據(jù)庫獲取4個(gè)基因表達(dá)譜芯片,其中包括miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)(GSE28423、GSE65071),mRNA 表達(dá)譜數(shù)據(jù)(GSE36001)以及 DNA甲基化芯片(GSE36002)。其中GSE... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:74 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于生物信息學(xué)分析鑒定骨肉瘤相關(guān)的異常甲基化基因及其功能


圖2-1?GSEA分析流程圖??Figure2-1?the?flow?chart?of?Gene?Set?Enrichment?Analysis??

基于生物信息學(xué)分析鑒定骨肉瘤相關(guān)的異常甲基化基因及其功能


圖3-7.分別用DMSO和5-Aza處理后,8?


本文編號:3007848

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