【摘要】：背景:瘢痕疙瘩是一種常見的皮膚科疾病,是皮膚傷口愈合后由于膠原異常增生所致。胸骨區(qū)是瘢痕疙瘩的好發(fā)區(qū)域,頸部、耳垂和肩膀等區(qū)域也可見分布,其病程特點(diǎn)為慢性遷延。瘢痕疙瘩不但影響患者的自我評價(jià),同時(shí)也給患者造成巨大的心理壓力和思想負(fù)擔(dān),成為不可忽視的社會(huì)問題。目前醫(yī)學(xué)界還沒有完全闡明瘢痕疙瘩的發(fā)病機(jī)理。環(huán)境、遺傳和免疫等因素共同作用誘發(fā)瘢痕疙瘩是目前的共識(shí)。相比于其他類型的皮膚病,國內(nèi)對瘢痕疙瘩的發(fā)病機(jī)制研究及診療技術(shù)的研究明顯滯后,還存在許多空白。隨著高通量生物芯片技術(shù)的成功研發(fā),采用關(guān)聯(lián)分析方法來篩選瘢痕疙瘩易感基因,取得了前所未有的成就。Nakashima等2010年發(fā)現(xiàn)15q21.3與日本人群瘢痕疙瘩發(fā)病呈顯著相關(guān)。復(fù)雜疾病的易感基因存在一定的人種差異和遺傳異質(zhì)性,這些區(qū)域是否與中國人群相關(guān)需要進(jìn)一步在中國人群進(jìn)一步驗(yàn)證。目的:擬在前期日本人群瘢痕疙瘩關(guān)聯(lián)分析研究基礎(chǔ)上,利用Sequenom i Plex平臺(tái)對309個(gè)瘢痕疙瘩患者和1080個(gè)健康人群位于15q21.3區(qū)域SNP位點(diǎn)rs2271289進(jìn)行基因分型,探討染色體15q21.3區(qū)域遺傳變異與中國漢族人群瘢痕疙瘩是否具有易感相關(guān)性,同時(shí)進(jìn)一步探討基因型與表型的相關(guān)性。方法:本試驗(yàn)中所有納入研究對象的309個(gè)瘢痕疙瘩患者和1080個(gè)健康對照組的體檢人群,均為漢族人群。通過Sequenom Mass Array技術(shù)平臺(tái)對rs2271289進(jìn)行基因分型。進(jìn)一步根據(jù)家族史、皮損嚴(yán)重度和皮損類型進(jìn)行臨床表型分層分析,對照組和病例組間等位基因和基因型分布頻率使用PLINK 1.07和SPSS 20.0軟件進(jìn)行分析和比較,分別得到OR值(比值比)、P值和95%CI(95%置信區(qū)間)。以α=0.05作為分析染色體15q21.3(rs2271289)的等位基因在病例組間、病例組和對照組間的關(guān)聯(lián)性是否有統(tǒng)計(jì)意義的判斷標(biāo)準(zhǔn)。結(jié)果:1.研究小組利用Sequenom i Plex平臺(tái)完成了漢族人瘢痕疙瘩易感基因關(guān)聯(lián)分析研究,發(fā)現(xiàn)15q21.3(rs2271289 located in NEDD4,OR=1.63,95%CI:1.24~2.10,P=3.27E-04)與瘢痕疙瘩存在易感相關(guān)性。2.通過分層分析發(fā)現(xiàn)rs2271289等位基因頻率在家族史陽性和家族史陰性患者組分別與對照組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);重度組和中輕度組分別與對照組比較等位基因頻率,發(fā)現(xiàn)重度組rs2271289等位基因頻率分布差異顯著,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=1.77,P=1.95E-04);單發(fā)型患者組和多發(fā)型患者組分別與對照組比較,則rs2271289等位基因頻率分布差異在多發(fā)組患者差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=1.73,P=1.52E-03)。結(jié)論:本次通過病例對照關(guān)聯(lián)研究,發(fā)現(xiàn)位于染色體15q21.3區(qū)域NEDD4基因上rs2271289 SNP位點(diǎn)與漢族人瘢痕疙瘩易感相關(guān),參與瘢痕疙瘩的發(fā)病的NEDD4基因編碼的蛋白可能受到這個(gè)位點(diǎn)堿基變異的影響。NEDD4基因多態(tài)性rs2271289影響漢族人瘢痕疙瘩嚴(yán)重程度相關(guān),與家族史無關(guān)。
【學(xué)位授予單位】：皖南醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R622
【圖文】：

存在種族異質(zhì)性這一客觀現(xiàn)實(shí)，對各種族人群加以驗(yàn)證存在很大的難度。故而，針對各種群，基于結(jié)果來對瘢痕疙瘩易感位點(diǎn)可靠性與真實(shí)性進(jìn)行驗(yàn)證工作勢在必行。2010 年，借助 GWAS，Nakashima et al 對 1q41、15q21.3 以及 3q22-23 同瘢痕疙瘩間的聯(lián)系展開研究，并證實(shí)存在顯著相關(guān)性。此次研究對象為 1080 例正常對照、309 例我國瘢痕疙瘩患者。首先，針對漢族群體，收集其 DNA 標(biāo)本。然后，驗(yàn)證標(biāo)本染色體 15q21.3 部位 rs2271289 位點(diǎn)是不是我國漢族群體瘢痕疙瘩的易感位點(diǎn)。(2) 設(shè)計(jì)與合成引物：借助設(shè)計(jì)軟件 My Sequenom 來設(shè)計(jì)引物，待核對無誤，由 My Sequenom 生物公司開展引物的合成操作，具體見下表 2。表 2 SNP 擴(kuò)增及延伸引物序列SNP 擴(kuò)增引物序列 延伸引物序列rs2271289 1) ACGTTGGATGGAAATATGAAGTAAGGGTACA ctACTTCCCCTGGCTGCTC2) ACGTTGGATGCAAATCCCAGACTGCTTACC

結(jié) 果y-Weinberg 平衡檢驗(yàn)1289 的基因位點(diǎn)在病例組與對照組的基因型分布情況結(jié)果與數(shù)據(jù)結(jié)果 P＞0.05，說明研究選取的對象擁有群體代表性，基遺傳平衡。瘢痕疙瘩的臨床表現(xiàn)相關(guān)性分析D4 基因多態(tài)性 rs2271289 等位基因頻率對比情況據(jù)表明：優(yōu)勢比為 1.65,95%置信區(qū)間 1.24～2.10，P＜0.0 rs2271289 等位基因頻率分布具有顯著差異。

圖 4：rs2271289 重組率圖2.2 NEDD4 基因多態(tài)性 rs2271289 與臨床表型的相關(guān)性2.2.1 家族史 將沒有家族史與具有家族史的比例與對照組比例進(jìn)行對比，發(fā)現(xiàn) P＜0.05，rs2271289 等位基因頻率分布有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，詳見表 3。2.2.2 嚴(yán)重度 將中度、重度組病例分別與對照組病例進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)重度組病例數(shù)據(jù)表現(xiàn)為優(yōu)勢比= 1.77，95%置信區(qū)間:1.31～2.40，P＜0.05，表現(xiàn)出顯著差異，詳見表 4。2.2.3 臨床皮損類型 將單（多）發(fā)型病例分別與對照組病例比較，結(jié)果表明多發(fā)組病例表現(xiàn)為優(yōu)勢比=1.73，95%置信區(qū)間：1.23～2.44，P＜0.05 表現(xiàn)出顯著差異，詳見表 5。

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2764600